三年的經曆，三年的快樂和痛苦，三年的友情，三年的淚水和笑容，三年的嬉笑打鬧，三年的成長，三年的時間過去了，在學院的最後一天，眾人畢業了。從擦肩而過不會看互相一眼的陌生人，到你我相約一起並肩而走的朋友；從一個人默默看著遠方的夕陽，到現在一起走著眺望大海；從不相知不相識的你我，變成患難與共的同伴和搭檔；從互相耍小伎倆陷害對方，到犧牲自己拯救對方……
當初那個充滿著快樂、臉上總帶有樂觀笑容的你，如今變得沉默寡言，也孤獨許多，從被輕視的吊車尾男孩元祖，現在成為了眾人心目中的領袖；當初那個不屑弱者的你，學會了以平等待人，成為了大家心目中永遠的閃電；當初那個膽小怕事的你，現在成為可以獨當一麵繼承了電子牌組的優秀畢業生；當初那個冷傲的你，現在充滿笑容，雖然留下遺憾，但不愧是是三年來學院的女王；當初那個戴著帽子總是孤獨的你，仿佛不再害羞，以笑待人，變得成熟起來……
“現在開始進行畢業典禮和畢業優秀學生表彰儀式呢。”克洛諾斯老師作為“學院偽最高負責人”，站在講台上宣布了畢業生中的優秀學生人員：“先是宣布畢業生中優秀學生的最終結果呢……但是真的不想宣布呢，如果把這個宣布了……就必須進行畢業典禮了呢……不能那樣呢！”克洛諾斯老師把埋在紙上的臉抬了起來，最終還是反對學生們畢業，在幾位老師和多美嬸的拉扯之下，克洛諾斯老師一邊掙紮一邊被遣送“回”醫療室進行最後的治療。
鮫島校長十分無奈，隻好自己來宣布了：“真是的……那就由我來代替宣布吧。今年畢業的最優秀學生是……似乎有三個人啊，天上院明日香同學、萬丈目準同學和丸藤翔同學。”在眾人的誇獎聲和鼓掌聲中，三個人上了講台，可是獎品決鬥之王武藤遊戲的複製牌組隻有一副，不知道要給誰。
“那樣的話我放棄。”“我也是。”“我也是。”三個人都自願不要那副牌組，就算那是決鬥之王使用的世界上最強的牌組，他們還是覺得自己的牌組最適合自己、在自己心目中一直使用的自己的牌組才是最強的卡組。既然三個人都不要，那麼鮫島校長隻好不送出去了，接下來就是低年級的代表·劍山的畢業致辭。劍山站上講台都不知道該怎麼說了，一直大口呼吸著：“咳咳，各位畢業的同學，今天我衷心恭喜你們……”
“回想起來，高年級的同學們……處處照顧我們低年級學生！嗚嗚……這份恩……謝謝啊啊啊……所以……恭喜畢業啊啊……”劍山也和克洛諾斯老師一樣太過不舍得高年級的學生們，哭喊著的劍山被幾位老師遣送去醫療室休息了。克洛諾斯老師和劍山的演講連退場都那麼糟糕，鮫島校長隻好請畢業生的代表·明日香進行致答謝辭了。
（下麵兩端括號裏麵是明日香的潛台詞）
明日香站在講台上，開始了自己發自內心的演講，那令人潸然淚下的畢業致答謝辭：“首先，由衷感謝大家今天為了我們畢業生而召開如此盛大的畢業典禮（為什麼我聽過的日文演講，第一句話總是那一句，明日香開頭這一句我都會背了）。時光飛逝，三年前……我們各自胸懷誌向踏入了這所學院的大門，然後在這所決鬥學院和朋友們、老師們相逢（然後在這所決鬥學院和你相逢），通過決鬥學到了很多東西。互相對戰、互相鼓勵，一起度過春夏秋冬的夥伴們（一起度過春夏秋冬的十代）。和你們的決鬥（和你的決鬥），告訴了我們自己的實力、弱點和對方的關懷（告訴了我自己的實力、弱點和互相的關懷）。”
不僅眾人在回憶三年間的種種事情，明日香自己也閉著眼睛開始回想，特別是關於十代和她的事情，這講話中也有她對十代不敢言說的感情：“即使從此以後各自踏上了不同的道路，四散天涯。我們都是夥伴（我都是愛你的），在心中刻下決鬥者們的羈絆（在心中刻下了愛的羈絆），是永恒的。在我們的未來中（在我和十代的未來中），有無數的困難和喜悅在等著吧。每次遇上的時候，我覺得我自己都會想起，在這裏的生活（在這裏和你的生活），在這裏的夥伴（在這裏的十代），我相信這些會一直指給我正確的方向（我相信十代會一直指給我正確的方向）。謝謝大家。謝謝你，決鬥學院（遊城十代），然後……再見了。”