被‘大青魚號‘擊中的是參加過偷襲珍珠港，珊瑚海海戰，聖克魯斯戰役的日本海軍中老資格的航空母艦，也是小澤治郎中將的旗艦‘翔鶴號‘，3枚魚雷全部命中.第一枚魚雷擊中鍋爐艙，這艘重型航空母艦立刻失去了動力.第二枚魚雷在艦首爆炸，在艦前部撕開了一個大口子，海水洶湧灌入並淹沒了下層全部艙室.第三枚正中油庫，這艘航空母艦立刻燒成了一片火海.艦首開始下沉，海水從前升降機口灌進機庫，航母艦體傾斜了，下午3時35分這艘日海軍航空母艦從海麵上消逝了.
但‘翔鶴號‘的沉沒並不意味著日本人的災難就此結束，另外一艘航空母艦‘大鳳號‘在戰鬥剛開始時被美潛艇‘阿爾巴科號‘用魚雷擊中，初看起來損失並不大，有一根小汽油管被震裂了，但要在複雜的管網中去尋找一個小裂縫是困難的，為了排除汽油蒸汽，一名管損軍官下令打開通風係統，他以為這樣就可以不造成大的損失.等戰鬥結束後再去查找漏油點.這真應了中國人的一句古話‘小不忍則亂大謀‘，這樣的措施，不僅沒有排除掉汽油蒸汽，反而使汽油蒸汽在這艘航空母艦下層艙室內亂竄.下午3時46分，就在‘翔鶴號‘剛沉沒不久，突如其來的猛烈爆炸在‘大鳳號‘的機庫下麵迸發了，飛行甲板被掀開了，一朵盛開的鮮豔的火紅的烈焰花升起來了，全艦不僅從頭到尾燃成了一片，而且船體也開始傾斜下沉.10分鍾後，太平洋的海水澆滅了火焰，順便也將日本人這艘新建造的3萬3千噸的航母請進了海底.
‘翔鶴號‘沉沒時，小澤中將堅持要與旗艦一起沉沒，誰的勸告也不聽.但他的部下們說，仗還在打，你得繼續擔負起指揮責任，不能不負責的臨陣脫逃.而且‘與艦共存亡‘這條規定己被山本將軍廢止了，為尊重己去世的山本將軍，你是不能這樣作的.小澤一言不發的離開了‘翔鶴號‘，就在他們轉移到‘翔鶴號‘的姐妹艦，另一條大型艦空母艦‘瑞鶴號‘上15分鍾時，‘大鳳號‘發生了大爆炸，這艘母艦向左大角度的傾斜，艦尾首先入水，慢慢地沉入了海中.
但打擊還在跟蹤而至，雖然己近黃昏，但美國人的機群還是追上了這支艦隊，小澤的全部60架飛機升空迎戰.但美國飛機人多勢眾，這些拚湊起來的攔截機隊，在12分鍾內全部被打掉了.日本艦隊的防空武器進行了猛烈而堅決的抵機，但這一切都無濟於事.美國飛機從四麵八方對‘機動部隊‘發起了攻擊.隻有20架美軍飛機被擊落，‘瑞鶴號‘中了8顆炸彈和3枚魚雷，這艘航空母艦在不到15分鍾就步上了‘翔鶴號‘的後塵，在‘馬裏亞納大海溝‘中報道去了.約有近10架魚雷機同時對另一艘叫‘飛鷹號‘的艦母進行攻擊，‘飛鷹號‘連中4顆魚雷，帶著艦上全體官兵沉入了水中.至此日本海軍投入馬裏亞納群島海戰中的4艘航空母艦全部沉沒，日本人可以說是一敗塗地了.