性命健身秘法是一套科學的健身方法，有嚴密的理論體係，也有豐富、神奇的實踐效應。它的理論體係包括性命學術體係和性命功功理體係，這兩個體係從不同的角度體現了性命學的科學性。它的實踐效應主要以健身效應為主，又有許多健身之外的其他神奇效應。
一、性命學與性命學術體係
性命學是研究宇宙、天地、人類、性命的發生、存在與歸宿的科學。其中“性命”二字的意義我們曾在本書開頭作過解釋，即：“性”表示人的精神、神誌，“命”表示人的形軀、身體。所以性命學實際上是關於人的性命的科學。人類本身是由宇宙、天地分化生成的，人本身又是一個小宇宙，因此研究人的性命的規律，必須研究宇宙、天地的規律，研究大宇宙的規律，最終是為掌握人這個小宇宙的規律。無論是大宇宙或是小宇宙，它在時間坐標上的根本表現都是發生、存在與歸宿。
性命學術的源頭是近八千年前伏羲始畫八卦。根據《周易I係辭下傳》的說法，上古時代華夏民族的領袖伏羲氏（又稱包羲氏）“仰則觀象於天，俯則觀法於地，觀鳥獸之文，與地之宜，近取諸身，遠取諸物，於是始作八卦，以通神明之德，以類萬物之情”。這段話完整地寫出了作為性命學研究一代始祖的伏羲氏研究天地宇宙及人類自身，發現它們的根本性規律並加以表達（作八卦），最後又用這種規律去分析萬物，使人類通達神明的境界，這樣一個氣勢磅礴的故事。
伏羲氏之後，曆代都有性命學大師繼承和傳播性命學術，並且有不少留下了他們的曠世名作，這些名作，組成了性命學跨越古今的學術體係。
性命學術體係的中心內容是三部要典、二十四部正經。三部要典是：博涉知識的《性命雙修萬神圭旨》（又名《性命圭旨》，明代尹真人弟子著、窮究理性的《性命指南計》（又名《道書十二種》，清代劉一明著）；密修實證的《伍柳四書》（又名《伍柳仙宗》，係明代伍衝虛所著《天仙正理》、《仙佛合宗》及清代柳華陽所著《金仙證論》、《慧命經》四部書的合訂本）。
二十四部正經是：
《易經》（傳周姬叔旦撰，約七百餘字。現在版本一般是《周易》，其中六十四卦係伏羲所創，每卦的卦辭和爻辭分別係文王和周公所撰，解說部分的“傳”共有十篇，稱作“十翼”，被認為是孔子的著作）；
《道德經》（老子著，約五千字）
《大學》（孔丘著，約二百字）；
《中庸》（孔丘著，約一百一十字）。
以上是先秦時期的性命學正經。
《參同契》（漢代魏伯陽、徐景休、淳於叔通著，約六千一百字）；
《入藥鏡》（晉代崔希範著，二百四十六字）；
《敲爻歌》（唐代呂岩著，一千五百三十字），
《黃鶴賦》（唐代呂岩著，七百六十字）
《百字碑》（唐代呂岩著，一百字）；
《沁園春》（唐代呂岩著，三百四十字）；
《金剛經》（釋迦牟尼與須菩提問答，阿難記述，鳩摩羅什譯，五千一百四十八字）
《心經》（唐代玄奘譯，二百六十字）；
《陰符經》（傳黃帝著，約四百三十二字）
《黃庭經》（唐代玉宸君等著）。
以上是漢唐時期的性命學正經。
《悟真篇》（宋代張伯端著，六千四百三十七字）
《四百字》（宋代張平叔著，四百字）
《心印經》（宋代自然覺王著，二百字）
《證道篇》（元代邱處機著,一千二百字,附《青天歌》）
以上是宋元時期的性命學正經。
《無根樹》（明代張三豐著，一千三百三十七字）；
《女丹詩》（明代孫不二著，五百六十字）；
《道原淺說篇》（明代伍衝虛著，四千九百八十字）；
《指玄訪道篇》（明代涵穀子著，三百七十七字）
《妙訣歌》（清代柳華陽著，四百字）；
《悟元篇》（清代劉一明著，二十四訣、駐雲飛等五篇四千字）。
以上是明清時期的性命學正經。
性命學學術體係的中心內容：上文所列的三部要典二十四部：
正經作為一個嚴密的學術體係有如下的特點。
1從先秦時期到明清時期長達幾千年的炎黃曆史中，每代均有性命學大師和他們留下的著作，體現了性命學術源遠流長的特點。
2這些著作包括了儒家、釋家、道家各自的經典名作，反映了性命學術的一個重要觀點：儒、釋、道三家雖屬不同的學派，但卻含蘊著本質的內在統一性，即最終的歸宿都是研究人的性命。
3時代較晚的著作往往充分地引證時代較早的著作，反映了性命學術思想的一脈相承性。