蔣介石來到李宗仁的辦公室，輕蔑地看了李一眼說：“德公（指李宗仁，字德鄰），你還是自動放棄的好，你必須放棄。”李宗仁回答道：“委員長，這事很難辦啊。”蔣介石接著說：“我是不支持你的。我不支持你，你還選得到？”“這倒很難說！”李宗仁負氣地道。“你一定選不到！”蔣介石加重了語氣。李宗仁目光如炬，回敬道：“你看吧！我能選得到！”
蔣介石急了，說出“隻要你不參加副總統競選，才能避免黨內的分裂”之類的話來威脅李宗仁。但李宗仁毫不動搖，最後兩人越說越僵，不歡而散。
李宗仁自己曾說過，蔣介石是有名的大獨裁者，一般部下和他說話，為其氣勢所懾，真可說是不敢仰視，哪裏還敢和他吵嘴。李宗仁這回不但敢和蔣介石吵嘴，而且還針鋒相對，讓蔣介石非常惱怒。蔣介石把孫科拉出來參加副總統競選，是想利用這位“太子”來擊敗李宗仁。孫科本來就不打算參加副總統競選，後經蔣介石夫婦出麵保駕，硬是把他拉出來參加競選。蔣介石除答應全力支持外，還提供全部競選經費。盡管如此，仍未能挽救孫科敗北之命運。選舉計票結果，李宗仁得1438票，比孫科（得1295票）多143票。李宗仁擊敗了孫科，成功當選副總統。
1948年5月1日，蔣介石、李宗仁當選國民政府正、副總統。就職當天，據李宗仁回憶，蔣介石故意不讓他知道要穿著中式禮服，結果他穿軍裝，看起來好像是蔣的副官。蔣介石於該年年底的“反省錄”中認為：本年最大失敗為政治，而政治失敗之總因即在副總統主張黨員自由選舉之方式，尤其在選舉前夕為李宗仁前來哭訴懇求，誤信其被選後，彼不能有單獨政治主張之諾言，於是支持孫科當選之決心動搖，對民青兩黨選票，任其選李，因之孫敗，此乃餘決心不堅。
從這次正、副總統選舉中，足見蔣李矛盾之尖銳。而曆史上，蔣介石和桂係宿怨很深，蔣李時分時合，矛盾重重。蔣介石三次下野，均與桂係“逼宮”有很深的聯係。
1927年，以李宗仁、白崇禧為首的新桂係，幫助蔣介石在上海發動了“四一二”反革命政變，在血雨腥風中建立了南京政權；第一次國共合作宣告失敗。但實力強大的新桂係並不甘心對蔣稱臣，尤其是蔣介石獨裁專製、排除異己的行為引起了他們的不滿，“反蔣”言行時有所聞，蔣桂關係日趨惡化。於是，蔣介石在打擊共產黨人之後又密令何應欽執行剿滅桂係的計劃。與白崇禧私交甚厚的何應欽不願無故翻臉，拒不執行這個計劃。這引起蔣介石的懷疑，認為“何已經軟化”，二人關係緊張起來。李白（李宗仁、白崇禧二人合稱“李白”）知道蔣的陰謀後，愈發感到這個人“陰險”“不可靠”，遂加緊糾結各方反蔣勢力，準備把蔣介石趕下台。而汪精衛亦揚言 “一切均可磋商，對蔣氏個人，絕不能相諒”，把以張發奎為總指揮的國民革命軍第二方麵軍從武漢調至九江地區“東征討蔣”。8月9日，唐生智發表討蔣通電，稱蔣介石“以軍治黨，以黨竊政”，要求“海內忠實同誌共起而平亂”。李宗仁將第七軍部署在南京以西地區，又聯絡浙江周風岐的二十六軍將部隊開到南京，對蔣形成包圍之勢。蔣介石敗退南京後，一麵致電馮玉祥表示讚成寧、漢合作，一麵又邀白崇禧率部與武漢汪精衛作戰。但桂係已經控製了南京四周，故而向蔣攤牌；白崇禧公開頂撞蔣介石，拒不執行對武漢作戰的命令。其他反蔣分子也紛紛表示願意與武漢“妥協”。1927年8月，蔣介石被李宗仁、白崇禧、何應欽等實力派“逼宮”通電下野，由其三人擔任國民政府軍事委員會黨務委員。南京與武漢兩國民政府亦達成統一，史稱“寧漢合流”。