“太無”者表示它是本體，非具體，而本體不落有無之對待。此不落對待而絕待之本體相對於先天後天來說是中天，中天表示先天即在後天中。它的方法論是三而一，一而三，一三兼舉，不一不異。
方以智關於太極的這些描述，繼承了中國哲學史上關於本體與萬物的關係的思想，也與方氏家學一脈相承。他的太極二儀四象八卦一時具足，三百八十四實有者中皆有虛無者存，與王弼關於大衍義的思想是一致的。不過王弼強調一是多的根據，一是多發生作用的所以然；方以智強調的是一即多，多即一。這一思想與理學家講的“衝漠無朕，萬象森然已具”也是一致的，不過理學家多就道德立論，方以智則用之表達他純形上學的觀點。
在方以智這裏，太極是天地萬物的統括，天地萬物的總體。總體不是個體的機械相加。太極是把天地萬物視為一個互相關聯、個體不能孤立地在其中活動的總體。從這個意義上說，太極又是萬物的統轄和主宰。方以智說：
謂之本不動者，非靜也，於穆不已也。幾先知幾，貫則為一，小其大，大其小，虛其實，實其虛，而無大小虛實矣。並無三征矣。生成合，生成分，分合合分，分即是合。聽百家之各專互勝，而統常變之大常者，通自在也。知所以之天，以安其不得不然之天。（《東西均·三征》）
就是說，太極本體是“維天之命，於穆不已”的，它超絕動靜，它在萬物運動之先，又在萬物運動之中。當然這個“之先”，不是指時間上的，而是邏輯上的。它離一切法，而貫一切法。它是萬物大小、虛實、分合的根據，但這個根據實際上沒有參與具體事物的任何活動，而是任萬物之自為。萬物之自為而共成一太極，這就是“聽百家之各專互勝”。太極以不統而實統之，它知萬物之必然，而安萬物之不得不然，非有任何造作於其中。它是或舒或卷自在無礙的。所以方以智的太極本體是形式的，不是有實際內容的；它是思辨的產物，不是實證的存在。太極不是萬物的集合，也不是萬物的來源，它是對萬物做總體性思考而得到的一種慧識。這個慧識表明方以智已突破實證存在的層麵而進入形上學領域。
3.“所以”在方以智這裏，萬物的存在和性質都是有根據的，都有它的“所以”。太極是一切存在的根據。太極是最高的“所以”。他說：“深表兩間之所以然曰太極。”（《周易時論合編·圖象幾表》）在他看來，萬物都有其必然性，這個必然性出於其本性，不是外在的東西給予的，也就是說，萬物“莫非然”。而此“然”背後有“所以然”。太極就是“莫非然中之所以然”（《易餘·絕待並待貫待》）。這個“所以”既用來表說本體，又用來表說事物間的聯係，而在表說本體中，它既指宇宙論的本體，又指本體論的本體。因為具體物既是有起始的，又與他物“共成一天”；既可以把它看做一個被生的東西，又可以看做一個獨立不依的存在；既可以把它看做無目的、無意欲的氣化物，又可以看做有性格、欲望與意誌的能動體。因為“所以”有許多不同的規定性，故每一種規定都有不確定的性質，都可以說不得已而名之。方以智對“所以”的描述，是從各個不同的角度出發的：
推論“所以”，始以一卵蒼蒼為太極殼，充虛貫實，皆氣也。所以為氣者，不得已而呼之。因其為造化之源，非強造者，而曰“自然”。因其為天地人物之公心，而呼之為“心”。因其為生之所本，呼之為性。無所不稟，呼之為“命”。無所不主，呼之為“天”；共由曰“道”，謂與事別，而可密察曰“理”。（《易餘·目錄》）
“一卵蒼蒼”，即渾天說之宇宙，宇宙間之物皆以氣為基元，故氣即“所以”。因“所以”為萬物的根據，故為造化之源。而“所以”對於具體物的支配和統轄是無意誌和目的的，故又叫“自然”。“所以”無私意造作，並且對萬物一例看，無輕重厚薄之別，所以又叫“公心”。因為“所以”乃一物之本質屬性，故稱其為“性”。其他“天”、“命”從主宰、稟受言，“道”、“理”從共由、條理言，各有所謂。以上這段話從各個不同的側麵全麵描述了作為萬物根據的“所以”。這些側麵合起來，就是“所以”的屬性與功能。這裏的“所以”實際就是太極。但太極與“所以”在語言上擔負的表達任務不同。有時“所以”等同於太極，如方以智說：“以故新其號曰‘太極’，愚醒之曰‘太無’，而實之曰‘所以’。”（《東西均·反因》）但二者在不同的語境中有不同的功用。總的說，太極重在言本體，“所以”重在言根據。“所以”指現實的功用，而太極則不能發生現實的功用，它表示邏輯關係。也可以說，“所以”是太極的使命的擔負者，它是太極與具體事物之間的橋梁。
方以智的太極觀念，是儒釋道綜合的產物。從儒家說，方以智受邵雍、周敦頤和朱熹的影響最大，他曾說：“邵子以太極為無名公，最妙。周子論始終、虛實、有無、道器之大綱，則實中有虛，虛中有實；有之前為無，無之前為有。……有卦爻與無卦爻對，而太極無對也。”（《東西均·三征》）這裏對邵雍、周敦頤“太極”概念的吸取甚為明顯，方以智的太極即太無的思想，受周敦頤“無極而太極”的影響；太極與兩間之物即一即萬、舒卷自如的思想，受周敦頤“物則不通，神妙萬物”及朱熹“人人有一太極，物物有一太極”的影響，但清除了周敦頤“陰陽一太極，太極本無極”的宇宙發生論因素。方以智關於太極的思想也受了佛教華嚴宗的影響，他嚐說：“華嚴歸於事事無礙法界，始結一真法界。”（《東西均·全偏》）一真法界即太極，事事無礙法界即萬有。一真法界即在事事無礙法界中，一真與萬有自在無礙。