龜山日軍駐地內已是慌作一團，“怎麼辦，大隗君，清國水師已經包圍了我們，西鄉將軍完了，艦隊完了，我們該怎麼辦，怎麼辦。”李仙得急得直打轉。
“李桑，咱們據險而守，還是能堅持五六個月的。到時候天皇會出兵解救我們的。”大隗底氣不足的說道。
“大隗君，我們還有希望嗎，清國水師十倍與我們，加之新勝士氣正旺，咱們還是要暫避鋒芒，要不咱們投降吧，這樣還能保存實力，等來日東山再起。”李仙得狡詐的說著。
“這行嗎，我們大日本從來就沒有投降一說，要是真降了國民還不罵死我，不行。”大隗心有餘悸的說著。
“不會的，要不這樣…，肯定能行，到時候惡人由我來當，你大隗君保證沒事。弄不好還會成為民族英雄呢。”李仙得看了看四周低聲說道。
“能行嗎，李桑。”“放心吧，你就瞧好吧，一切責任由我來承擔。”李仙得詭異的笑著。
第二天一大早，龜山日軍駐地內，李仙得領著一百多外國雇傭軍將一個大隊的日軍繳了械，逼迫大隗寫下了投降書，期間李仙得還將大隗捆了起來，讓大家看到事情是非大隗主觀所願的，如此拙劣的演技居然蒙混了過去。
受降儀式定在同治十四年二月十六日巳時，當沈葆楨一行清國水師大員走上龜山受降台時，李仙得帶著一把武士刀畢恭畢敬的站在一側，台下是幾百列隊等待受降的日軍和外國雇傭軍，周圍站滿了荷槍實彈的清軍水兵。“哈羅，總督大人，好久不見，您的精神還是那麼的矍鑠。”李仙得用蹩腳的中文恭維道。
“哦，原來是李領事（作者注：李仙得原來是美國駐廈門領事，後被日本聘為台灣問題顧問），怎麼有空來到龜山，這似乎不是你應該來的地方。”沈葆楨鄙夷的說道、
“哈哈，總督大人有所不知，我現在受聘於日本政府，擔任台灣蕃地事務局副長官兼顧問。現在全權代表日本駐台灣蕃地事務局向總督大人請降。”李仙得訕訕的說道。
“那好吧，即然你能全權代表日本政府，那好請在受降書上簽字畫押。”沈葆楨正色道。
“那好，那好，這就簽，這就簽。”說著李仙得接過受降書簽上了自己的名字，然後就要蓋上了台灣蕃地事務局的大印。
“等一等，”沈葆楨阻止道“李領事，台灣蕃地事務局是不受我們大清國承認的，那是你們利用武力侵略我們大清國土地，建立的偽政權，我們不會答應體現任何偽政權存在的詞句的。還是讓西鄉從道和大隗來署名吧。”
“OK，就按總督大人的吩咐辦。”
很快西鄉從道和大隗被清國水兵押了上來。
“西鄉將軍，既然你們戰敗了，請在受降書上簽名吧。”沈葆楨對西鄉從道和大隗說道。
“我們大日本皇軍輸得起放得下，我們戰敗了，受降書肯定要簽，但我一直不明白想請教閣下，你們那些小艇是如何購得的。”西鄉從道問道。
“對不起這是軍事機密，等過些天我請示皇上後再給你解釋，現在請你們簽名吧。”
西鄉從道和大隗心不甘情不願的簽下了自己的名字。
隨後當沈葆楨接過李仙得遞上來的指揮刀時，台下的日軍也都陸續將自己的槍械碼放在地上等著清軍的驗收，由此標誌著台海戰事徹底結束了。此戰清國水師共擊沉日艦十二艘，俘虜大小戰船十六艘，斃傷日軍大佐以下官兵1863人，俘虜日軍、外國雇傭軍1020人，生擒敵酋西鄉從道、大隗、李仙得。另有3000多日本僑民一起作為戰俘被關進了龜山的臨時戰俘營內。大清水師共折損戰船11艘，水師官兵傷亡831人。
沈葆楨連夜將戰事經過及立功人員具折送往京師，閩台各地沿海一片歡歌笑舞，漁民們紛紛拿出平日裏舍不得吃的海鮮招待水師官兵，到處洋溢著勝利的喜悅。但沈葆楨沒有被勝利衝昏頭腦，他清楚目前的形勢，這場戰事還沒徹底結束，日本人恐怕不會甘心這次的失敗，肯定會調集重兵再來進犯台灣，或許還有江浙等沿海富庶地區。沈葆楨仔細翻看著朝廷的詔書：台海一定，務必整備船械等待朝廷進一步指示。既然皇上沒有明示，隻能按照朝廷的指令行事。
在龜山視察了幾日後，沈葆楨將龜山一帶的防務和臨時戰俘營交給了福建水師提督鄭觀應，自己帶領著十二艘戰船回到了福建馬尾，一方麵整備船械，一方麵等待朝廷的進一步指示。
此時的北京城裏還不知道台海戰事已經勝利結束了，各衙門官員們都為內務府調查事件而惴惴不安，唯恐牽扯到自己身上，一些平日裏不太幹淨的官員也正忙著跑上跑下疏通關係好洗清自己的幹係。另外絕大多數官員都在擔心自己將來的位置，這次皇上決心革新朝政，讓各級官員內心惴惴不安，盡管皇上明詔要量才錄用不會拋棄任何官員的，但這顆定心丸顯然沒有起到預期效果，要不是高在春在早朝上金口玉言宣布穩定現任官員隊伍的幾條措施，人心才穩定下來。但坊間仍是議論紛紛。