偌大的房間中擺放著密密麻麻的機械裝置，而在原本就頗狹小的環境中卻擠著這麼多人，這使得室內的空間進一步地減少了——然而這並非指此時室內的氣氛十分混亂，事實上，即使是如此狹窄的環境裏，人們的動作卻並未有所失當。對他們來說，或許空間的擁擠與狹小，對真正意義上的工作效率並沒有影響吧。
而在這群人當中最突出的一個，正是一名一頭酒紅色長發的中年女性，隻是雖然年齡上來說已然接近四十，女性的外表卻宛如二十餘歲一般——這已不是所謂的天生麗質和保養適宜能解釋的了。事實上，肩膀上掛有“Dr.Kurisu”的名牌的女性之所以能夠留存這等年輕外表，有著更深刻的原因。
“牧瀨主任，偵測到九條主任最後一次出現的時間點為……2011年，也就是19年前！”
穿著純白色製服的男性研究員以急迫卻不失冷靜的聲音向位於最顯眼處的女性報告著，事實上他們此時所遭遇的是相當嚴重的事態，但是並沒有失去冷靜這一點也是身為頂尖研究員所必要的素質與矜持。無益的感情用事隻會釀成誰也不想看到的後果，唯有冷靜處事才能取得最終的成功——於是深深清楚這一點的研究員們，即使是遭遇到了就算說是最糟的事態也不為過的狀況，也依然沒有喪失一絲冷靜。
“明明隻是時間機器的第一個測試救助案例而已，居然會發生這種事情……”
被稱為牧瀨主任的女性一麵做著手邊的活計，一麵微微地歎息著。雖然她深刻地認知到身為此處唯一核心級研究員的自己絕對不能帶頭喪氣，但是就這種狀況而言，她很難接受上一刻計劃還穩步前進，下一刻就完全脫離現況的事態。雖然作為涉足這個研究領域的人說這樣的話有些奇怪，但是作為研究員的她並不喜歡脫離常規的狀況。
“呐，岡部，時間科技，真的是我們可以涉足的領域……麼？”
時間科技。
從牧瀨主任口中念出的這個關鍵字，便是這個實驗室的中心研究領域了。
近三十年前的21世紀初，人類開始確實涉足時間科技這一領域。事實上在更早以前，似乎就存在著時間跳躍的現象，與過去的自己或是別的什麼人溝通，抑或是非計劃性的在時間軸上進行移動的事態都有所發生。不過直到2000年，人類才開始確實著手進行時間科技的相關開發。取得的是雖然微弱卻未曾停滯的研發進展，到了現時的2030年，確認功能已經完美的時間機器，在作為研究總部的日本凰繚蘭學園研究院製造完成。
作為核心研究員之一的牧瀨紅莉棲正是因為與時間流做了過多接觸，導致身體的代謝現象發生了不明變化，因此發生了在年齡增長上可說是停滯的現象。這也是其實際年齡已經近40歲，然而容貌卻還如20歲出頭的女性一般的原因，同樣作為最核心研究員的九條玖琉璃、岡部倫太郎、一之瀨琴美等人，也或多或少發生了類似現象。
而作為時間機器“Flyer”的第一個測試案例，作為核心研究員之一的九條玖琉璃提出了對同為做出重大貢獻的核心研究員，在20年前的2010年被卷入爆炸事故的葛木晶予以救助。這個案例獲取了包括葛木本人在內的所有核心研究員一致通過，並著手選出最為適格的救助人員——研究部排名在第一位的新生，雪代鈴乃。
然而事故便出現在此時。利用時間機器“Flyer”前往過去的雪代鈴乃遲遲沒有歸來，這個場合之下，作為首席開發者的九條玖琉璃為確認事態狀況以及對時間機器的測試，決定親自前往。但是這種在原本的計劃中萬無一失的決議，卻是異變的開端。
前往時間機器的九條玖琉璃也如雪代鈴乃一般沒有歸來，這便是最初的異象。這種狀況下本應重新進行調查時間線上的狀況並執行解決措施，但接下來發生了更大規模的異常事態——幾乎是同期，來自實驗室外的一份報告顯示，似乎時間機器的初次啟動造成了嚴重的惡性事故，包括作為核心研究員的岡部倫太郎、葛木晶、一之瀨琴美、結城野名等人在內，一大批與私立凰繚蘭學園所在島嶼相關或不相關的人員不同程度的確認了失蹤報告甚至死亡報告。
這是所謂的時空事故，而且其中絕大多數甚至因為時間過於緊急的緣故，無法確認其失蹤或死亡原因。
可以確認的是，原本隻是作為一次測試案例而實施的葛木晶救助計劃，因為某種原因引發了不可抑製的蝴蝶效應。對於世人來說，也隻是會把這些人的失蹤抑或是死亡當做一件正常的事情——然而對於牧瀨紅莉棲以及其餘全部在研究院內的人來說，並不是這樣，這實在是最大的幸運。
“好在這裏的全部成員都已經植入了時砂獲取了ReadingSteiner，雖然不如岡部那種天生的ReadingSteiner來的有效，但大體上記憶也不會受到時間線的幹擾……”
作為僅存的核心級成員，牧瀨紅莉棲當機立斷直接對進入時間機器的雪代鈴乃與九條玖琉璃留下的最後訊息進行追蹤，一方麵使用時間機器本身進行探索，另一方麵也使用世間的情報網查詢這兩人在內的一部分失蹤人員在“這個時空”裏最後的情報出處，雪代鈴乃的情報過於鬆散基本沒有意義，但是對九條玖琉璃的搜查卻有了重大進展。
這也正是開頭研究員那句話：
“牧瀨主任，偵測到九條主任最後一次出現的時間點為……2011年，也就是19年前！”
——的起因。
“……研究院新生中，還有植入了時砂的適格者麼？”
所謂的適格者——這裏指的，是為了進行時間跳躍而執行過各種訓練的人員，時間穿越本身是一件頗複雜的事情，即使在核心研究員中，有資格確實使用時間機器“Flyer”進行跳躍的適格者，也僅有自幼便涉足於時間科技研究的九條玖琉璃而已。雖然不經過訓練的人也可以使用發展已經頗為成熟的時間機器，但若是使用時間機器執行相關的各類任務的話，就必須是經過訓練的適格者才能擔任。
由凰繚蘭學園研究部所培養的適格者中，成績最好的便是前文所提到的，負責執行此次測試救助案例的雪代鈴乃。
“……因為短期內並沒有再次使用時間機器的預定，所以大多數都沒有植入時砂，無法把握現況的他們是無法完成任務的。”
沒有植入時砂的常人意識不到時空的變化——因為對他們來說，一直以來存在於記憶中的發生了的事情才是事實。
除去作為測試救助案例的葛木晶救助行動外，短期內沒有再使用時間機器的預定。時砂本身的效果是有時效性的，因此除去被選擇前往執行任務的雪代鈴乃之外，並沒有其他適格者植入時砂。而對沒有植入時砂的適格者們來說，被蝴蝶效應影響了記憶和認知的他們是無法把握現狀的，更不要提參與行動了。