俞大遒感覺像是吃了蒼蠅。自己向天子建議建立軍校，天子接著就要求自己出任軍校祭酒，怎麼想都像是一個圈套。要是在往日，他早答應去軍校當祭酒了，為帝國培養出一群得力幹將，將來桃李滿天下，多好的事啊。但問題是，水師這頭他也舍不得放。他琢磨著自己剛才想不來的縱隊戰法，一定能成功，要不了幾年，自己就可以率領水師滿大洋的風光了。
軍校？還是水師？這是一個問題。
萬曆饒有意思的看著俞大遒做“魚與熊掌”的選擇，老實說這也可以說是一個“小圈套”，到不是不信任俞大遒，而是想把他用在更重要的位置上。江南水師固然重要，但有陳嶙鄧子龍在，問題不大；而草創軍校，就必須要一個像俞大遒這樣的人坐鎮。萬曆心中還有一個人選，就是兩廣總督淩雲翼，才幹突出，精通兵法，還是文官出生。但就是因為他是文官，反倒讓萬曆放棄了他。剩下的人選就非俞大遒莫屬了。俞大遒對水戰步戰騎戰皆有造詣，又在實戰中曆練過，足以勝任。
“能不能兩樣都…”俞大遒實在難以取舍，試探著問道。
萬曆笑道：“將軍年已古稀，卻不服老。但朕如何忍心讓將軍如此操勞呢？”
俞大遒訕訕笑道：“臣也是左右兩難，不知該如何決策，就請陛下為臣決定吧。”
於是，萬曆說道：“將軍為國征戰大半輩子，朕也不忍心在讓將軍受海上風波之苦。朕看來，將軍就以靖海伯﹑太子太傅﹑兵部尚書銜，領軍校祭酒吧。”
軍校祭酒的品級雖不高，但是加上太子太傅兵部尚書兩銜可就很高了，這樣的位階朝廷中也隻有張居正戚繼光等少數幾個人能比。相信俞大遒也不會不滿意。俞大遒原來的水師提督，品級不過比總兵略高，這一次加了太子太傅和兵部尚書，連升了幾級，心喜不已。又聽萬曆問道：“將軍走後，不知誰可以當然水師提督？”
人選自然會在陳嶙鄧子龍陳蠶三人中選，但問一下俞大遒，可以顯示對他的尊重，有利於解決問題。
俞大遒說道：“以才幹論，三人都合適。但若要論掌握大局，平衡左右，則陳嶙為上。”
“那好，就讓陳嶙接任水師提督，讓鄧子龍陳蠶為副，共同掌管江南水師。”萬曆順勢決定了江南水師的將領。“誠如將軍所見，水師不是步兵的附屬；倭寇雖平，而海疆卻未必安寧，水師也將越來越重要。因此，新成立的軍校也要培養一些水師人才。朕準備從江南水師撥一些戰船，組建一隻小的水師，供軍校學子操練所用。將軍以為如何？”新的軍校是要培養軍官，自然少不了水師。
“陛下見的是。”俞大遒說道，“熟讀萬千兵書，不如一陣上交鋒。臣以為軍校不光要有戰船，還改購置火器槍炮等戰具，讓學子能有所體會。避免成為紙上談兵之人。”
這一點也是萬曆所擔心的，他是要將秀才變成兵，但如果教育不得法，那就會將兵變成秀才。為此，才及其重視實踐，設立致德公學時，就設立了一些需要實踐的科目。現在見俞大遒能想到這一點，自然高興，說道：“下筆千言，胸中卻無一策，又有何用？兵者詭道，存亡之機，不可不慎。因此這軍校操練當以實戰為準，不搞花架子，寧可平日多流汗，不願戰時流血。軍械錢糧，朕會盡量滿足。以後工部製造出了新式武器﹑戰船都先讓軍校試演，看看效果如何，然後再全軍推行。”