一時間天下震動，正邪各方均派遣門人探查究竟，當時，時距張小凡赴昆侖進入輪回池已過三年，陸雪琪在小凡不辭而別後一直多方尋訪，音信全無，得知羲皇城一事，以小竹峰首座之尊親赴鴻蒙，在經曆一番坎坷後，正邪各派門人先後抵達羲皇城。
張小凡初以為逆輪回池運轉後便可抵達人間，不想卻到了羲皇城這個神秘所在，幾經磨煉後小凡已經成熟穩重，身在異域不敢造次，又已身兼九黎族供奉，不便背棄眾人。在一番探查後，神裔長老於古籍中得查端倪，終於明了此處便是上古遺留的伏羲聖城。
眾人又驚又喜，隨同張小凡前來的隻有寥寥十數人，輪回池與逆輪回池均隻能單項通行，如此大事張小凡隻好再赴昆侖輪回池返回異界稟報。期間小凡飛回青雲山卻正巧陸雪琪率眾遠赴鴻蒙，小凡唯恐尷尬，未見青雲諸同門。小凡抵達異域稟報羲皇城之事，神裔之民得知可以往來人間界，更有聖城在前，舉族震驚。在各族公議後，除部分遺老持重者，都願意回歸聖城，張小凡再次開啟逆輪回池。
初次返回人間界時，因為不知情況如何，張小凡暫時將碧瑤留在異界，二次返回時，人多勢眾，也不見得有何風險，於是攜碧瑤同回人間界。待率同數萬神裔之民回到聖城後，卻見到一片淒慘，初次來聖城的十餘人慘遭屠戮，伏羲女媧聖像被毀，聖城各處一片狼藉。
眾神裔悲憤交加，擒獲數名鬼王宗弟子，其中有人認出張小凡，口稱副宗主，張小凡的神裔朋友為維護小凡，誅殺幾人，眾人得知神裔長老等十餘人是人間各派高手擊殺，聖城也是被其焚毀，無不驚怒，各族各自分工，一麵重建聖城，一麵備戰人族，張小凡人類身份已遭各族質疑，一時也彷徨無計。
原來正邪各派初次探查羲皇城，發現伏羲蛇身聖像，深以為怪，又遭遇神裔長老諸人，以為是獸妖餘孽，當時獸妖之亂未久，各派因此均傷亡慘重，遂起了敵愾之心，正邪聯手盡殺這十餘神裔，搗毀聖像，火焚聖城。
焚香穀曆來與魚人族不合，在一次衝突中被神裔的前哨探知，見其人形魚首，引為同類，回稟族人，便有好戰族人百餘前往馳援，盡殺衝突中的焚香弟子，焚香穀門下見神裔形貌，以為獸妖複來，盡遣穀中精銳，門主親自前往主持，重創神裔。神裔殘餘傷者，回羲皇城稟明此事，眾皆憤怒，張小凡的勸阻也無濟於事，當下便遣數百精英驍勇者，奔襲焚香穀，張小凡無法阻攔，隻得隨行前往，盼有轉機。神裔大舉來襲，焚香穀也已有所準備，於各派廣邀人手。
焚香穀一戰，空前慘烈，神裔一族法術玄妙，人間界從所未見，焚香穀死傷無數，退至玄火壇，焚香門主見大勢已去，自毀玄火壇，逆轉八凶玄火陣，八荒火龍即將重創神裔族人，張小凡不忍生靈塗炭，強運天書法訣擊殺八荒火龍，自身也受重創，神裔忙於救護小凡，焚香餘人得以逃脫，但總壇被毀，門主身死，焚香穀一門至此覆滅。
焚香穀之戰震動天下，參戰各派弟子更是心有餘悸，正邪各方均感危機將近，非一門一派可與之抗衡，幾經協商，終於決定在青雲山下會盟，正邪各派盡棄前嫌，尊蕭逸才為盟主，誓伐神裔。
神裔伐焚香穀後，返回聖城，張小凡重傷閉關，參悟五部天書與五方聖諭的玄機。昆侖山本是神裔一族的聖地，在修葺羲皇城的同時，神裔族人謀劃拓荒開疆，計議在昆侖山下築城，便在此時，天下英雄集結全部精萃，同赴羲皇城，誓欲剿滅神裔族人。