聯邦政府在軍事力量的調動上和帝國有些不同。
明商帝國在星際航海時代依然在采取君主製，其最主要的原因就是在明商帝國獨立戰爭中——聯邦又叫聯邦分裂戰爭，以明家府兵為獨立軍主力、帶領依附於明家的另外兩家勢力戰家、獨孤家，通過持續二十七年的鬥爭完成明商帝國的建立。
為此，明家的大本營北境星域付出了極大代價，二十多年間家家掛孝、戶戶發喪，明家犧牲了家族子弟中的九成。在獨立戰爭中，明家兒郎衝鋒在前，將領身先士卒，為明商帝國的建立立下汗馬功勞。
獨立後，明商帝國也經曆了幾次內部權力傾軋，但在明商帝國子民的團結一心下，最終推舉采取君主製為主、內閣為輔的體製，才將帝國權力較好的平衡，得以在與聯邦的兩百多年爭鬥中存活下來。
帝國的軍事力量調動權限，絕大部分在明商國君——明皇身上，除青龍、白虎、朱雀、玄武四大軍區的跨防區調動必須由明皇下命令外，軍區內的軍、師級建製單位在防區內和團級單位在防區外的調動，也必須報隻對明皇負責的皇家作戰部，內閣隻是在明皇的決策命令下，進行進一步的行動方案完善。
平時，軍區司令官防區的作戰指揮權僅限於團級以下單位，以此類推。
總之，帝國國君軍事集權極高。
而聯邦的軍事力量主要由第一、二、三軍團和聯邦近衛軍團為主。
其中，第一軍團防區為落天星域，位於望山星域下方，下轄五個軍，主要駐守目標為帝國與聯邦之間的星海壹號蟲洞，主要任務為抵禦大規模軍事力量的蟲洞跳躍。
第二軍團，防區主要為混亂小行星帶，同時與聯邦近衛軍團協防首都圈，主要駐守海馬蟲洞，兵力最弱，僅下轄兩個軍。
第三軍團，駐守望山星域，主要分布在與帝國交叉的幾個邊境星球，下轄四個軍，望山星域曆次戰爭中的主力軍團，作戰經驗最豐富、戰鬥力最強悍的軍團，軍團內各級指揮官以白家子弟居多，坊間戲稱“白家軍團”。
聯邦近衛軍團為一個軍，主要駐守聯邦首都圈，包括首都星和周邊的衛星。
對聯邦的軍事力量調動權限，分權在總統、國會。
總統是聯邦軍事力量的最高統帥，但是宣戰權、調動權以及提供軍費的權力均在國會。
總統的兵力調動權限，和平時期限製在了聯邦內反恐怖和首都圈防衛（歸屬近衛軍團的一部），戰時的指揮權根據國會授權會有相應提升，比如戰時總統會在國防部的基礎上，組建戰時聯邦軍事力量指揮部，總統直管各力量的調動。
而國會平時對軍事力量的把控，則主要放在國會的軍事職能部門——國防部。
所以說，聯邦政府的國防部，曆來是國會職能部門選舉中的重頭戲，不過三十年以來，軍神威名猶在，國防部總長的人選，一直都要斟酌白家老爺子的看法。
軍神很少對國防部總長人選進行過提名，除了十一年前，聯邦發生了最大的危機後，軍神親自前往國會山，提名更換了國防部總長——即現任的白彬白總長。