然而韋昌輝此時卻收不了手了。他的野心一向也是極大，也早就看出來洪秀全是個無能之輩，根本就不能管理天國政務與軍務，此時東王倒台了，自然就該輪到他北王上位主事了！而當今之計在他看來，就是要多殺人來立威，東王多年積威，心腹遍布天國上下，若是不把他的心腹部下殺光殺淨，將來北王主事又如何能夠順暢？
就是在這種心理之下，韋昌輝說服了性格暴虐又野心勃勃的秦日綱，陳承熔猶豫不定，此時卻是拗不過這兩個心毒手辣的王爺，若是他不跟隨馬後，怕是第一個要挨刀倒黴。三人計較已定，也不管天王所命如何，幹脆定下計來，先是在早晨就張榜全城，言明了東王罪狀與天王下令誅殺的情由，到中午，又帖榜文，告誡城中不論文武，凡以往東王部下，一律到城內各處軍營裏去自首，凡自己前來認罪的，前罪就一律不問，由天王親自下令赦免。
昨夜事起，東王府內一處偏院被抵抗的士卒點燃，火光衝天，殺聲震天，很多東王的忠勇部下都趕往東王府去助戰，鏖戰一夜之後，說起來昨夜一戰就有三四千人的東王部下當場戰死了。而剩下的昨夜當然也看到了東王府處情形，他們昨夜不去助戰就是存了害怕或是觀望風色的心理，若是東王勝了自然趕快到東王府效忠，此時既然知道是北王與燕王等人勝了，東王的首級都送到天王府了，這些人托名是東王心腹，其實比之昨日戰死的人，倒是半點兒忠心也是沒有。
正午榜文一出，立刻就有以前的東王部下前去報道，到了傍晚時分，足有過萬人赤手空拳的來到了城內的各處營中報道，此時韋昌輝與秦日綱已經合兵一處，到傍晚時看看人數已經大致相差不多，便由韋昌輝和秦日綱一起一聲令下，精兵強兵一起動手，一撥撥的將人清點殺害，前者血跡未幹，後者哀嚎求饒，鐵了心要肅清異已的北王與燕王卻隻是不理，軍令一直不停的發將下去，太平軍將士手中的刀槍第一次不是舞向敵人，而是對準了自己的袍澤兄弟。
這一場好殺從早至晚，天黑之後仍然打著火把殺人，哀嚎聲直竄雲宵，隔上十幾裏地仍然隱約可聞。
這一天，闔城百姓幾乎沒有人敢上街行走，家家關門，人人閉戶不出，偶爾有整隊的巡兵經過時，人人膽戰心驚，推窗觀看時，一見人蹤，便又劈裏啪啦把窗戶頂死關上，然後全家老小一起躲到安全所在，不敢出一點聲響。
這一天，全南京城的客棧酒樓茶館也不曾營業，市麵上挑柴送水倒馬桶送菜的農戶統統不見，不少人家中斷飲斷炊也是不敢出門，唯有餓腹而哭而已。
兵災之禍雖然還隻陷於內鬥，卻已經顯現出它可怕的威力，使得與之無關的善良百姓深受它的苦楚迫害。此間情狀，唯有陷身其中者，才能知道一二端倪，而那些隻憑著想當然的書生，卻哪裏知道亂世之中百姓所受的痛苦遭遇。
天京之變的第三天，韋昌輝與秦日綱二人繼續在城中大索東王舊部，一天下來又殺得四五千人，這一次卻多半是東王舊部的家屬，男女老幼都有，以北王和燕王的意思，軍士前兩天向他兩人效忠，著實辛苦了，放縱一下，也是犒勞軍士之法。
大索，原本就是舊時將帥統兵破城後鼓勵士氣恢複士兵戰鬥力的不二良方，敵人已經盡失武裝，城中百姓就如待宰羔羊一般。那麼，就叫士兵們去殺人，鍛煉一下刀法槍法和野性，再去****，釋放一下獸性，然後，再叫士兵去搶劫一些民財，充實一下士兵們的荷包，這樣，他們就會感覺自己辛苦一場，讓主帥和將軍們立下大功，榮華富貴了，自己卻也不是一無所得，這樣，就會讓這些原本樸實的心靈得到一點彌補，全軍上下，對主帥的忠誠之心卻又會得到大幅度的提高了。
於是在肅清東王府餘孽的名議下，政變後的第三四五天，連續三天時間，北王與燕王的部下都在城中大索東王舊部，殺到第三天後，東王舊部接近三萬人已經被殺光，天氣漸熱，城中到處都是一股子難聞的血腥味道，開始時殺人還是在軍營或是特定的場所，後來士兵們殺紅了眼，哪裏還顧得許多？況且搶劫民財，自然就是現場殺人，****婦女，然後把一家人的家當搜羅幹淨，接著再去殺人，強奸，搶劫財物。幾天鬧騰下來，誰還管屍體的事，很多人的屍體就被砍死在自己的家門前，或是幹脆拉在小巷子裏殺掉，剝掉好衣服後丟在街道上，幾天下來，屍體發臭的很多，招引來一群群的蒼蠅和野狗，嗡嗡有聲，吠吠有聲，諾大的南京城內，屍臭與血腥味彌漫在空氣之中飄散不去，令人惡心欲嘔，而那些始作俑者，卻是成群結夥興 高采烈，他們殺人正殺在興頭上，搶錢也正搶在興頭上，還有不少漂亮女人被他們帶回了軍營之中，日夜不停的****，這樣的日子，可比在戰場上與清妖生死相搏要愜意的多。