諸葛長民又驚又喜，恍惚間似乎時光又回到了當年一同歃血結盟，密謀反桓的歲月，對麵坐的仍是慷慨仗義的劉大哥。那一刻，他幾乎被感動得熱淚盈眶，已無暇仔細思量劉裕為什麼會對他說那些話。一時衝動下，他估計連今後要洗心革麵，永遠追隨劉大哥的念頭都有了。
就在諸葛長民心潮澎湃，對外界的感知變得麻木的時刻，可能劉裕做了什麼暗號，藏在屏風背後的心腹衛士丁旿突然衝了出來，一把將諸葛長民從床上拉下，擲於地上，然後一連幾拳，將其毆斃於床側。劉裕仍然平靜地坐著，默默看著諸葛長民一命嗚呼，臉上帶著未完全退去的笑意……
很難弄清楚劉裕為何要用這麼戲劇性的方式殺死諸葛長民，因為大可不必。沒有任何史書記載過諸葛長民有什麼過人的勇力，即使玩單挑，也九成不會是曾以一敵千的劉裕對手，何況屋內又有一個忠勇堪比典韋、許褚的丁旿？更不用說眾多護衛。其實當諸葛長民踏進太尉府的那一刻起，劉裕已經可以不費吹灰之力地置其於死地，根本用不著這麼多廢話，那麼劉裕為何還要這麼做呢？也許，其中並沒有多少厚黑的成分，僅僅是因為劉裕需要傾訴。
現代心理學認為，人是需要宣泄情緒的，如果把所有事都埋藏在心底，是一種難言的痛苦。生活在這個世界上並不容易，各種各樣不如意的應激事件都會使人的心理產生焦慮，這種焦慮如果得不到及時疏導，就會以一種心理能量的形式積聚下來，當這種積聚到達某個臨界點的時候，就會使人患上抑鬱症甚至精神分裂。而最好的應對手段就是傾訴，將內心的感受對另一個人訴說，讓痛苦釋放出去，心靈就會得到解放，獲得輕鬆。
劉裕此生的經曆比普通人何止複雜百倍？他雖然已經幹下了驚天動地的偉業，但我們也不能忘記：他仍然是一個凡人，也有喜怒哀樂，也會在危險來臨時緊張，也會在敵人挑釁時憤怒，也會在戰友反目時感慨，也會在親朋過世時傷痛。但他的身份又迫使他必須將這一切隱藏起來，根據需要而不是根據心情，去戴上精神麵具。可想而知，那個深藏在麵具之下的真實的劉裕是多麼需要傾訴自己的心聲。
然而，這個世界上又有很多事，是不能讓別人知道的。我們現在也就可以大致明白了：劉裕為什麼向諸葛長民傾訴自己的隱秘，不去找與他真正關係親密的劉穆之或劉敬宣，不是因為他把諸葛長民當成自己人，也不是故意要迷惑諸葛長民，讓其沒有防備，而是因為諸葛長民馬上要死了，誰還能比死人更會保守秘密？
諸葛長民死後，屍體被拖到廷尉府（相當於今天的最高法院），廷尉府的官員們以很高的效率完成了案件的審理工作，證明諸葛長民罪大惡極，現已被依法處決，隨後派人捕殺他的兄弟同黨。諸葛黎民不甘心束手就擒，揮刀與前來抓捕的士兵搏鬥至死，幼弟大司馬參軍諸葛幼民、堂弟寧朔將軍諸葛秀之均被處死，諸葛長民的家族被徹底清除。
盡管從法律程序上說，諸葛長民完全是被非法處死的，對他的事後審理絕無半點司法公正可言，但與被劉裕清洗的其他政敵相比，他在當時獲得的同情最少。曾經被他管轄過的官民百姓，在得知大貪官諸葛長民已經全族被殺的消息後，無不拍手稱快。一句譏諷他的民謠開始在建康一帶傳揚：“做官的可不要飛揚跋扈，無法無天，否則丁旿會來收拾你們！（勿跋扈，付丁旿）”人生在世，還是應該多做點善事，少做點壞事的。所以，歸根結底諸葛長民的禍還是自己惹下的。至此，當年一同密謀反桓的十二個首領，除劉裕外，隻剩一個像老黃牛般不爭名利、任勞任怨的王仲德還活在人世。