在浩瀚海洋中一座不起眼的孤島上，有著一片看上去異常茂盛的森林，而那森林的深處隱藏著一處鮮為人知的建築。
偌大的現代化建築四周格外安靜，看不到半個人影，甚至連飛禽走獸的蹤影也感覺不到。之所以會是這個樣子，就要歸功於那隱藏在暗處，發著凜凜寒光的遙控激光炮，它早已將周圍的空間封鎖個密不透風。即使是隻蚊子也別想靠近，更別說動物了。
建築內的通道四通八達，全鋼鐵質建材以及吱吱轉動的電子眼，更是為其增添了恐怖冰冷的氣氛。
“呼哧呼哧……”在一個無人通道的上方換氣管道內，男孩正奮力的向前爬行著，一雙靈動澄澈的眼睛，天然得毫無心機的微笑，無不讓人相信這是一個滿是朝氣，單純活潑的孩子。
管道內光線昏暗，灰塵密布，卻毫不影響男孩內心激動的情緒，朝著目標堅定不移的前進著。
‘咯……’男孩熟練的拆下通道旁的鐵欄，小心地幾乎聽不到聲音，可見他已經不是第一次幹這種事了。顧不及擦去滿身的灰塵，男孩徑直向最近的大門跑去，看也不看便在旁邊的觸摸鍵盤上熟練的按出六個數字，隻聽叮的一聲，門順利打開。
“小雲霄，你又來啦？”屋內的人仿佛早已知曉男孩的到來，出聲招呼道。
“今天可是汪叔進貨的日子，我怎麼可能忘記呢！”男孩笑著應聲，無意間看到中年人身後幾大箱子，一雙眼睛頓時變得賊亮起來，語氣也變得急躁起來，還帶著些莫名的激動，“汪叔，快，快，這次又帶了哪些好東西，快給我看看。”
“嗬嗬嗬，不要急，小雲霄，這次的貨啊保證讓你滿意。”汪叔笑嗬嗬地拍拍男孩肩膀，在男孩迫切的目光中，將身後的大箱子一一搬到男孩的麵前。
“哇塞，這些都是最新款的模型。噢哦！竟然連雪拉比這類稀有的精靈都有，實在是太棒了！”男孩從箱子內翻著各類模型，時不時的長籲短歎、尖叫連連，開心忘我的樣子，惹得汪叔笑聲不斷。將這個滿是冰冷的環境裏，染上一縷難得的溫馨。
就在同一時間，位於建築中心的一個超大型的房間內，身穿白大褂的人們正忙碌的來回走動，如機械一般，麵無表情的操作著身前的各種儀器。除了嘀嘀嗒嗒的儀器聲，便再也沒有其他的聲音。不論有生命的還是無生命的物體，凡事經過儀器的檢測後，都被拋棄處理，惟有一堆被稱為結果的文字印在電腦屏幕上，四周還有更多的小型屏幕，上麵各種各樣的數據更是看得人眼花繚亂。
“艾瑪，計劃準備的如何了？”冰冷的仿佛沒有一絲感情的聲音，打破了房間內的沉靜。
“報告大人，基本上已經完成了，隻需再複查一遍即可啟動。”旁邊一人恭敬的回答著，臉上卻並沒有相應的滿意笑容。
“複查？這已經是第幾次了？你們的進度讓我很不滿意，我要馬上執行！”冰冷的聲音夾雜了一絲焦躁，音量也大了不少。
“大……大人，未經檢查便啟動，那是很危險的事……”身旁的人一臉為難，苦著臉還打算繼續勸說，卻被嚴厲的聲音打斷，“不管如何，今晚必須行動！”
“是……”
這裏，是一個連衛星都無法找到的孤島，上麵藏有一個高科技的實驗室，其中幾乎集合了人類中的大多數智者，對各種未知的事物進行研究和開發。在這裏沒有倫理道德可言，試驗體從無生命的石頭，到頻臨滅絕的動植物，甚至還有人類本身，都是他們研究的材料之一。
而那個活潑好動的男孩名叫雲霄，今年十二歲，是個孤兒，來到這個實驗室已經2年了，仿佛被消除了記憶一般，他完全不記得來這裏之前的事了。由於他聰明伶俐，又顯得比一般的孩子堅強的多，很快便被轉移到特殊的房間，接受嚴格的教育，體能訓練、科學知識，各種各樣幾乎不是他們這個年齡該接受的東西，毫無人性的如填鴨般被強迫接受著。除了短暫的餐後休息外，他和其他類似的孩子一樣幾乎沒有半點休息的時間。當然不乏受不了壓力而崩潰的孩子，凡是這樣的人，都被穿著白衣的人帶走，在那之後，雲霄便再也沒見過。
其間，活潑貪玩的他偶然間發現了這個房間，更無意間發現了神奇寶貝這種神奇的生物，在汪叔的引導下與這種奇特的精靈們結下了不解之緣，終日在枯燥環境之下的雲霄一下子就愛上了這些可愛的小家夥，之後更是一發不可收拾，每當在汪叔這發現新的種類，他總會興奮之餘將其收藏起來，這項愛好成了他快樂的源泉，也給了他生存的動力。