三清是道教天界中最高的神，包括元始天尊、靈寶天尊和道德天尊。三清尊神分別住在玉清境、上清境、太清境，故又稱玉清元始天尊、上清靈寶天尊、太清道德天尊。
一、元始天尊
元始天尊在三清之中地位為最尊，也是道教神仙中的第一位尊神，主持天界之祖。元始天尊即盤古大帝，又稱元始天王，生於太無之先，稟於自然之氣。
⊙盤古開天辟地
天地生成之前，混混沌沌、黏黏糊糊像一個雞蛋。一切東西，都溶化在這個雞蛋裏。有金、木、水、火、土五種元素相混，有青、黃、赤、白、黑五種顏色相溶。硬的像瓜子，軟的像瓜瓤。
盤古生在其中，龍首人身，一日九變，直到一萬八千年方才醒來。發現周圍一團黑暗，盤古張開巨大的手掌，向黑暗用力劈去。一聲巨響，雞蛋破碎，其中輕且清的東西慢慢上升，形成了天；厚重混濁的東西慢慢地下降，成為了地。盤古站在這天地之間非常高興。但他發現天地中間還有些藕斷絲連，於是左手執鑿，右手持斧，或用斧劈，或以鑿開，天地終於徹底分開。
盤古擔心天地再合攏起來，變回以前的樣子，就用手撐著青天，腳踏著大地。盤古每天長高一丈，天每天增高一丈。這樣持續了十萬八千年，天地之間相隔九萬裏。
盤古憑著自己的神力開天辟地，經年累月，實在太累，終於倒了下來。就在倒地的一瞬間，他嘴裏呼出的氣變成了天空飄動的雲，喉嚨裏的聲音變成了響徹天空的雷霆。他的左眼變成了太陽，右眼變成了月亮，頭發和胡須變成了夜空中的星星。他的身體變成了東、西、南、北四極和雄偉的三山五嶽，血液變成了江河，筋脈變成了道路，肌肉變成了農田，牙齒、骨骼和骨髓變成了地下礦藏，皮膚和汗毛變成了大地上的草木，汗水變成了雨露。
⊙玉清聖境
元始天尊開天辟地，治世成功以後，靈魂遊於太空之中，獨居在離地麵三萬六千裏的天界中心的玉京山上。天王神靈所居的地方是玉清三元宮上第一中位，即三十六天中的玉清境，天的最高位。玉清境內，有紫雲為閣，碧霞為城。元始天尊頂負圓光，身披七十二色。
因其前身是盤古、元始天王，所以後人尊稱其為元始天尊。天尊仰吸天氣，俯飲地泉，天尊之體，常存不滅。三劫過後，從石頭縫的積血中蹦出一位太元玉女。太元玉女天生麗質，國色天香，一出生就會說話，自號太元聖母。太元玉女吐納靈君之氣，在地上來往飄遊。
一天，元始天尊興起，來到地上神遊。天尊下界與玉女相遇，為玉女的美色、貞潔打動，一見鍾情。當即翻雲覆雨，把太元玉女攝入玉京山上宮。此時，天地間陰陽二氣氤氳化育，調和翻騰，無熱無寒。天尊順應陰陽之變，化成一縷青光投入玉女的口中，太元玉女即刻懷孕。玉女懷孕十二年，言語行動常有彩雲護體。
元始天尊與太元玉女先是生了一個長有十三個腦袋的天皇，叫做“扶桑大帝東王公”，後來又生了一個“太真西王母”。之後，天皇生了地皇(十一個腦袋)，地皇生人皇(九個腦袋)，天皇、地皇、人皇都活了三萬六千歲。元始天尊的子女漸漸多了起來，大庭氏、伏羲氏、神農氏、祝融氏、五龍氏都是元始天尊的後裔，分別住在五嶽(泰山、華山、恒山、衡山、嵩山)之上。
每到天地初開之時，天尊便授以秘道，開劫度人。元始天尊多次開劫度人，所度者都是天仙上品。太上老君、太上丈人、天真皇人、五方天帝及諸天官都出自元始天尊的門下。眾神仙按時上玉清境朝拜元始天尊。
現在三清大殿中的元始天尊，一般是頭罩神光，手執紅色丹丸，或者左手虛拈，右手虛捧，象征天地未形、混沌未開、萬物未生時的無極狀態和混沌之時，陰陽未判的第一大世紀。
道教以陽生陰降、晝短夜長的冬至日為元始天尊的聖誕，也有把正月初一作為神誕之日的。
⊙座下十二弟子
《封神演義》中說元始天尊座下有十二大弟子，分別是：
九仙山桃源洞廣成子；
二仙山麻姑洞黃龍真人；
乾元山金光洞太乙真人；
五龍山雲霄洞文殊廣法天尊；
普陀山落伽洞慈航道人；
金庭山玉屋洞道行天尊；
太華山雲霄洞赤精子；
夾龍山飛雲洞據留孫；
崆峒山元陽洞靈寶大法師；
九宮山白鶴洞普賢真人；
玉泉山金霞洞玉鼎真人；
青峰山紫陽洞清虛道德真君。
二、靈寶天尊
靈寶天尊名經寶，居三清中的第二位，又稱上清大帝、靈寶道君、太上大道君，封神榜中稱為通天教主。
靈寶天尊由元始天尊和太元聖母和合而生。元始天王的赤太無元玄黃之氣進入太元聖母體內，降生了靈寶天尊。開始，靈寶天尊暫住在三十五天之上的禹餘天上清真境內的蕊珠闕七映紫霞房中。靈寶天尊日夜吸納玉晨精氣、慶雲紫煙，凝神集氣，幻化成形，然後轉世，托胎於西方綠那玉國洪氏體內，孕育形成人的肉體。洪氏懷胎三千七百年，將他誕生於西那天鬱察山羅浮峰下。