九月二十八日，古北口提督趙國華、馬蘭鎮總兵蔣義、泰寧鎮總兵胡偉、宣化鎮總兵杜子飛被誘殺於北京，所部提標四營，鎮標七營，並遵化協營、紫荊關一標經裁撤整編，合編為關寧軍混成第三師團，師團長馬龍，計四個聯隊，戰兵一萬二千人。
九月二十九日，天津鎮總兵周保亮、大名鎮總兵斐大剛、通永鎮總兵華雲國於保定被殺，三將所轄鎮標八營、河間、大沽二協，固關營兵、開州一協、大名城守營、山永二協兵改編為關寧軍混成第四師團，師團隸屬直隸巡撫齊壯直轄，有兵一萬一千人。直隸原提督金國正所部綠營兵七千人改建直隸各府縣守備兵，歸屬地方各府縣直領。
九月三十日，康熙自盛京經錦州回師山海關，與嶽樂所部兵馬會合，計有兵員五萬。當日即由康親王傑書督所部一萬兵強行攻關，遺屍三千餘具於關下，未克。雙方陷入僵持階段，清軍無力進攻，關寧軍也無意出關決戰。隻使人向關下射出布告，曰宣統皇帝已登基，康熙已死於盛京，拒不承認康熙仍活著事實。
十月初二，京師鄰郊各府縣綠營兵及新征兵兩萬五千人開赴山海關，編為關寧軍混成第五師團，師團長伍楓秋。至此，集於山海關的關寧軍兵力壓倒清軍。
十月初五，南懷仁督造完成36門開花炮運至山海關下。
十月初七，康熙聞知盛京遭清原關寧攻擊，葛爾丹已破科爾沁，越過黑山向錦州進犯，唯恐後路被退，成甕中之鱉，不顧將疲兵喪，強令再攻山海關。激戰一日，棄屍萬餘，仍不得入關內一步。
十月初八日，關寧軍遣密使與清簡親王雅布、肅親王富綬密商，以殺康熙者為關外王的條件，誘使雅布與富綬作亂。不料事泄，康熙先下手為強，以召禦營會議為名，暗中埋伏侍衛亂刀砍殺雅布、富綬，誅殺二王部下三十餘名將領，接管二人名下兵馬。
十月初九，久攻不下且有斷糧之危，康熙領殘軍三萬餘連夜往盛京逃去，趙強領五萬兵馬尾隨其後。
十月十四，關寧軍完成對盛京包圍，偏師占領遼西等地，斷了康熙由海路逃至關內之念。
十月十六日，葛爾丹率準葛爾兵與關寧軍會師盛京城下，雙方約定先入盛京者即擁有此城。
十月二十八日，盛京將軍賴塔領兵突圍，因後繼不支，敗回城中。
十一月初三，葛爾丹揮師攻城，未克，後不再強行攻城，留一萬兵於盛京，自帶主力回返漠南，以消滅漠南殘餘各部。
十一月初六，趙強遣使要康熙投降，可保證城內旗人性命。康熙不允，斬殺使者。趙強大怒，開挖福陵、昭陵，掘努爾哈赤與皇太極之屍以白布係之，懸於軍營轅門之上。清軍聞之，舉城哀嚎。
十一月初八，城內斷糧。十四日，斬殺軍馬充饑。二十四日，殺人為食。
宣統二年二月初九，康熙自感無回天之力，服毒自殺。康親王傑書領盛京大小官員開城投降。
二月十一，屠城令下，盛京城無一丁存活。
二月二十八日，關寧軍南下，所到之處，盡殺旗人，傳檄天下，殺旗人者當為漢人。
四月二十一日，關寧軍攻陷揚州，滿城旗人三千餘人被殺。
五月初九，關寧軍渡江攻陷南京，清兩江總督麻勒吉自殺，滿城三萬旗人被殺。爾後，關寧軍迅速占領江南各地。
五月十九日，得知南京被攻陷後，趙強殺宣統帝自立，國號“中華帝國”，年號威武。
六月上旬，清杭州將軍桂國喪心病狂，血腥屠殺杭州漢人十三萬。慘案發生，關寧軍群情激憤，調大軍三十萬圍攻杭州，攻城十六日，終克，裂杭州將軍桂國屍，盡砍滿城旗人，西湖之水一時血紅。