聯合傭兵收到總部命令後，立即前往13號地區。最終在夜晚成功到達。
同時，傭兵們得到休息圖，他們所在的13號地區外，周邊的地區都已淪陷。所以他們要守住這片最後的淨土。
起初，13號地區很安靜，靜到讓每個人心裏發毛。直到一個生化幽靈的出現，打破了這個寂靜。傭兵們開槍射擊，最終成功擊殺這個生化幽靈，但槍聲卻引來了周邊生化幽靈的注意。
傭兵們立即向總部請求支援，但總部很無奈，生化幽靈源源不斷。這時候再派人過去，完全就是送人頭，不僅不能起到救人的作用，反而會增長生化幽靈的數量。
於是總部向傭兵們投放補給，裏麵有傭兵們所需的槍械，彈藥等。可這些東西隻不過是杯水車薪罷了，最終，13號地區被攻陷，沒有一個人活到天亮。
在13號地區淪陷之後，人類總部在一個沙漠中建立了軍事基地。因為穿過這片沙漠，生化幽靈就會到達港口，如果生化幽靈乘船前往其他大陸，那生化病毒就會擴散至全世界。（劇情是這樣寫的，從目前來看，生化幽靈並沒有誕生智慧，所以不可能開船，但劇情是這樣寫的，我也就隻能這麼寫了）
事實的確如此，生化幽靈開始進攻港口，但有這個沙漠軍事基地的存在，延緩了生化幽靈的腳步，但僅此而已。軍事基地的潰敗隻是時間問題。
因為有軍事基地延緩了生化幽靈的腳步，總部在港口部署了充足的兵力，想要徹底擊敗生化幽靈。
同時，生化幽靈中也出現了幾個變異體。第一個便是綠巨人，綠巨人是紅色生化幽靈，受到伽馬射線的輻射後產生的變異體，血量更加雄厚。第二個便是瘋狂寶貝，瘋狂寶貝是一位女護士，因感染了生化病毒而瘋狂注射藥物，想要治療自己，但結果是讓他成為了一個新的生化幽靈，並使其有了隱身的能力。
最終生化幽靈成功攻破港口乘船到達其他大陸生化病毒，就此擴散至全世界。
之後的時間裏，人類不斷潰敗，人數越來越少。人群之中，一直流傳著一個關於救世主的傳說。傳說中，隻要他們出現那麼戰局，將會得到扭轉。
之後在一個角鬥場中突然爆發了生化病毒，起初是一位感染了生化病毒的人，並沒有立刻變異，而是跟隨大部隊來到了這個角鬥場。
來不及多想，傭兵們立馬拿起武器，利用有利地形進行反擊。但一個新的變異體—靈魂忍者的出現，把人類通通炸出了防禦據點。
人類的失敗已是定局。
這時候，一名手拿榴彈槍的人出現，瞬間擊潰了大量生化幽靈，其榴彈更是把生化幽靈炸得暈頭轉向。是的，救世主出現了。在救世主的帶領下，人們成功擊敗了生化幽靈，取得了自生化戰爭爆發以來的第一場勝利。
在之後的對戰中，人們不斷取得勝利。
直到……