慈悲入寺，述說林凡訣別紅塵，削發為僧；以及修仙界之風雲再起。
第二次神州浩劫停息後，流離失所的難民開始重返修仙界，以重建家園。般若寺內，虔誠拜佛者人滿為患，以祈禱災難不再降臨。無所謂信仰，隻為心靈有所寄托。
一位失魂落魄的少年，在香火鼎盛的般若寺中遊蕩，在人頭攢動中穿梭。戰爭之後，大部分人或多或少會情緒低落，而少年便顯得毫不起眼。
其邁入大日正殿，無比真誠地於佛祖金身前長跪不起。與其相交匪淺的歸圓、歸樸，見其神情，均未打擾少年這一刻的思緒沉澱，立於其左右，以誦心經，望其早日走出陰霾。
普佛方丈見此，已知少年此行之目的；因佛門聖地，乃是一切苦惱的邊緣，亦是苦海的彼岸。普佛方丈與其相視一笑，林凡的到來，證明其已對世間有所感悟，從而能令其放下心中的執著。
“拯救神州大陸的任務就交給我吧！”當初一腔熱血的少年，終於大徹大悟，對其而言，乃是一次機緣，無所謂悲喜。擇日，一群善心向佛者，參加了般若寺新弟子的入門儀式。普佛方丈親自為林凡剃度，並將其作為親傳弟子收入門下，法號“慈悲”。
鼎鼎大名的開天一族之現任族長，結束浩劫的天選者，從此淡泊名利，一心奉佛。可謂：
浩劫無謂戰爭事，孤魂再無輪回時。
少年英豪終覺悟，摒劍棄道麵佛祖。
大日殿堂看紅塵，普佛方丈善一笑。
執刀以斷千緒絲，從此慈悲向世人。
林凡於般若寺中與世隔絕的生活，便這般一晃五年而過。如今修仙界，家園得以重建，庶民得以安居樂業，呈現一片欣欣向榮之前景。便在這四海升平的國度中，修仙界風雲再起。
一日之內，八大掌門盡死於非命，死態安詳，室內並無廝殺之痕跡，不知慘遭何人之毒手？各大門派如臨大敵，且嚴令將消息走漏，以防事態惡化。然而，世間沒有不透風的牆，此次事故，終究無法隱瞞世人。
修仙門無奈，便對外聲稱，各大掌門因長生境難以突破，生命走到了盡頭，最終遺憾離世。但是，事態仍在升級，便在修仙門猝不及防之際，清明門餘郢山重犯大獄，般若寺千浮塔，雲煙穀飛霧崖，九陰宗九重地格，餓鬼道吞死蠶。
此人間五大婦孺皆知，且令人聞風喪膽的監獄，遭神秘人士襲擊，其內重犯、死囚均逃出生天。一時間，修仙界掀起千層浪，可謂民不聊生，修仙門更是苦不堪言。所謂國不可一日無君，遂及時作出修整。
由梅寒擔任清明門代理掌門一務，般若寺唯一一位德高望重的高僧苦陀，因無視佛門清規戒律，且知不悔改，已然入獄，遂由歸圓任代理住持一職；雲煙穀戰部長老楊峰，九陰宗司馬圖，餓鬼道鬼宿分別擔當此重任。
天界遠古三族均派出代表赴約清明門會談，而與九陰宗成為左鄰右舍，現居於第五天卷之城的開天一族則兩耳不聞窗外事。會議內容包括，調查八大掌門無故死亡一案，以及整頓修仙界，緝拿逃犯等重大事件。
決策如下，由清明門狼花天使李雲藥、雲煙穀琵琶女樂音音為主副執行官，抓捕或剿滅在逃罪犯。由般若寺代理住持歸圓，協八大門派精英組成調查團，調查八大掌門同一時間遇害一事。
會談結束後，歸圓剛走出清明大殿，便被陳夢雲和楊厲攔下，且質問林凡為何貪生怕死，躲於般若寺中隱世不出？而歸圓身負重任，修仙界之狀況迫在眉睫，且道：“慈悲師弟乃方丈欽點的下任方丈的不二人選，早在三年前便於無邊菩提度中潛心悟禪。”