成實醫生認為黑岩的死亡時間就在被發現的幾分鍾前，而現場磁帶前麵的五分三十秒的空白，也恰好印證了這一點。隻是這次的案發現場留下了一篇用鮮血畫的琴譜，毛利認為這是死者生前留下的死亡信息，但柯南認為如果黑岩還有時間跟體力用自己的血來寫這些東西的話，早就去外麵求救了，所以肯定是凶手留下的訊息。
柯南搶風頭讓毛利很沒麵子，接著一拳打到了他頭上。柯南被突如其來的一拳打的重心不穩，一不小心摔倒在樂譜上，還好血液早已凝固，不然這證據可就沒了。
混亂的現場就像是一鍋粥，黑岩的女兒和女婿對警方十分不滿，直言凶手隻能是唯一的村長候選人:清水。畢竟現在他才是所有世界的獲益人。
這邊小蘭告訴柯南，如果這是鋼琴琴譜的話，那麼指的就是黑色琴鍵。柯南由此推測出凶手是把鋼琴琴鍵對照英文字母拚成拚音來傳話。
根據這個線索，土豪川島被殺現場的樂譜要傳達的信息就是，“明白嗎？下一個就是你。”仿佛是在警告第二個死者，現任村長黑岩。
黑岩現場所留下的血譜所傳達的意思是“罪孽的怨恨，在這裏消除。”似乎在暗示這兩起殺人案和十二年前自殺的麻生圭二有關聯。
被嚇出精神病的炸毛兄又開始鬼叫起來，嘴裏念著:“一定是麻生龜二還活著。”
這時老警察又站了出來，斬釘截鐵的表示麻生圭二肯定是死了的，現場的骨頭和牙齒都比對過，確認死者就是他們一家，唯一的遺物就是保險櫃裏的樂譜。目暮警官當即表示，你還不趕緊去取。
柯南和老警察立馬出發，前去找保險櫃的鑰匙。
路上的時候，老警察說當年麻生圭二自殺時有四個目擊者，分別是以前任村長龜山，現任村長黑岩，炸毛兄西本以及土豪川島。
他們四個不僅和麻生圭二是同學，而且還是從小一起長大的玩伴。
黑岩的那個女婿是三年前突然跑到島上來的。
秘書莆田是個老奸巨猾又膽小懦弱的人，不像是能幹出凶殺案的家夥，不過能常常看到他和川島在公民館裏鬼鬼祟祟的。
清水則是個正義感很強的人，極受漁民的愛戴。
可是老警察除了收屍快跑的快，幹啥都慢，整整一個小時才找到倉庫的鑰匙。
小蘭跑過來告訴他們，因為時間太晚，所有人都已經回家了，而且他們都覺得殺人事件到此已經結束。
可到目前為止，凶殺現場隻播放了《月光》的第一第二樂章，而《月光》這首曲子還有第三樂章，所以柯南認為還有事情要發生。
當他匆忙趕到公民館時，就聽到琴房傳來了奇怪的聲音。打開門，又是那個神秘人，他破窗而逃。
柯南立馬追上，卻被腳下的東西絆倒了，定晴一看，是黑岩的女婿。
與此同時，小蘭他們在打開倉庫門後發見，精神不太正常的炸毛兄被吊死在裏麵，腳下還放了一張用樂譜寫成的遺書。
遺書裏交代，是他殺害了土豪川島和黑岩，因為他們幾人曾犯過錯誤，為了不想自己被揭穿而殺人滅口。
但是，如果是上吊自殺，為什麼腳下沒有墊腳的東西，而且也不會有人用特殊暗號來寫遺書。
想到屢次出現的黑影，柯南再次回到鋼琴房，他發現被砸暈的黑岩女婿旁邊掉落了一把調音錘。難道這架鋼琴之所以多年以來保持音準的原因，是因為女婿在默默做好事？可剛才那黑影到底在心虛什麼？
他走到鋼琴下麵，果然發現了一個暗格，地上還散落了一些墳墓。輕輕嗅了一下，竟然是海洛因！
這時警員也將黑岩被殺的現場照片洗了出來，可奇怪的是，一張照片上脖子旁邊有個發光的東西，但在下一張照片卻消失了。
還沒來得及細想，就被手上纏滿繃帶的秘書平台吸引了。柯南裝作不經意的提醒他袖子上有白色粉末，平田聽到後驚慌失措的處理著。
而此時，《月光》的終章即將奏響，老警察終於找到了麻生圭二留下的樂譜，打開一看，樂譜上寫著:“寫給我的兒子成實。”