第一隊負責地球近空防衛作戰，也就是月球軌道以內的外太空。
第二隊負責地球中空防衛作戰，也就是月球軌道以外到火星軌道以內的外太空。
第三隊負責地球遠空防衛作戰，也就是火星軌道以外的外太空。
第四隊為機動艦隊，負責協助一二三隊作戰並監視小行星帶。
正當這顆小行星襲來時，於是第三隊和第四隊迅速出動，負責摧毀這顆小行星。
而每艘太空戰艦都裝備了離子束和激光武器，可以通過離子束或激光攻擊小行星表麵而產生的推力以使其改變軌跡。
正當第三隊和第四隊的戰艦在用離子束和激光來攻擊小行星，使其改變軌道時，小行星突然發生爆炸，一百搜戰艦無一艘幸免而全部被毀。
正當魏博為第三隊和第四隊戰艦的全軍覆沒感到震驚時，又有兩顆小行星突然朝地球撲來，而第一隊和第二隊在攔截時也全軍覆沒。
“看來毀滅者是要徹底毀滅地球呀。”於是魏博和夏清、遊希望、羅西·萊昂納多等人坐在PDC會議廳，靜待末日到來……
與此同時，一艘太空軍與智通公司聯合研發的秘密戰艦三體號悄悄離開地球，朝著新地球駛去……
三體號上的成員包括許多人類精英，有萊奧·馬登、艾瑪·史密斯、陳默、劉佳、袁星、桓衛等人。
原本這些人是想要留在地球與地球母親同生共死的，不過夏清說服了他們，叫他們不要作無謂犧牲。
三體號的出發比流浪地球號晚了三天，不過速度卻要快上一些，超過十分之一光速，而流浪地球號的速度稍慢於十分之一光速。
因此三體號預計在十天內趕上流浪地球號，與它一起前往新地球。
然而三體號在駛入小行星帶時收到了地球發回來的影像，發現地球已被小行星徹底摧毀，南極聯邦不複存在。
三體號上的成員既感到悲傷也感到無奈，不過他們也十分小心，擔心會受到小行星攻擊。
果然毀滅者趁著三體號通過小行星帶時發起了攻擊，整個飛船被小行星撞毀，萊奧·馬登、艾瑪·史密斯、陳默、劉佳、袁星、桓衛等人全部遇難。
不過幸運的是流浪地球號在排險者的幫助下躲過了小行星攻擊，通過時空蟲洞到達了新地球。
因此許吳和楊萍到達新地球時地球時間確實是2323年，不過二人的旅程中隻用了四天而已，地球則是十分荒涼，再也沒有人煙。
……
五年後，楊萍和許吳不婚不育的幸福生活在新地球上，一起在它的南極上創立新家園，而羅伯特和瑪麗·雪萊則在旁幫助。
何碧和梅有則是許楊二人的孩子，在南極開墾新土地，收獲新作物，延續人類文明……