木葉55年。
一名13歲的藍色頭發的少年在林子裏穿梭，少年頭上戴著木葉的護額，那護額上有一條橫線，那是叛忍的標誌。
“誌村團藏！我遲早讓你好看！”
少年是本書主角，玄天神月。
神月穿越到火影忍者的世界，剛穿越就是孤兒，在木葉忍者學校就讀。
但是一般穿越者不是開局係統外掛，就是有家族背景。再看看神月，除了知道劇情之外，什麼都沒有，每天盼著係統來，可惜沒啥用，麵對曉組織、帶土、斑爺、大筒木輝夜以及大筒木一族這些大BOSS，能咋辦，混吃等死吧。
直到神月8歲的時候，神月在訓練場和一名油女一族的人對練的時候，在忍者老師和同學們麵前，神月無意間釋放了一種不知名的忍術，那忍術的紫霧在神月身上像蛇一樣蠕動，有八九隻寄壞蟲接觸到紫霧發生了變異！
那些看起來如芝麻大小的寄壞蟲，突然變得如蒼蠅般大小，它們黑色的身體閃爍著金屬的光澤，翅膀纖細透明，足變得鋒利無比，口部長出了更鋒利的口器。
這些寄壞蟲變異完成後全部調轉槍口，還沒等神月反應過來就向那名油女族人發起了進攻，變異後的寄壞蟲實力完全碾壓普通寄壞蟲，一隻能打幾百隻的那種。
那名油女一族的人也懵了，因為他發現那些變異後的寄壞蟲不受他控製了，而且自己的寄壞蟲也不是那些寄壞蟲的對手，隻能眼睜睜看著自己的寄壞蟲被一隻隻的消滅，迫不得已，那人選擇了認輸。
這件事很快就被傳開了，為神月招來了三個麻煩。一是木葉高層很快就知道了這件事，當時誌村團藏提議讓神月加入他們根部，而猿飛日斬不同意他的建議，然後就出現了“日斬你會後悔的，團藏我才是火影”的小劇場。之後就是神月每天都會看見三代火影來串門，以及根部忍者的監視。
二是這些變異的寄壞蟲就像狗皮膏藥一樣，怎麼甩都甩不掉，經過一段時間，神月發現自己能使喚這些寄壞蟲後，就放棄了買殺蟲劑的想法。
三是油女一族知道這件事後，也是每天動不動就去神月家串門，串門的次數甚至比三代火影每天去的次數要多。因為這種寄壞蟲的戰鬥力爆表，他們想通過神月來加強他們的寄壞蟲，然後擊敗宇智波一族成為木葉第一家族。而神月看著這些墨鏡閃著金光的油女一族的人也是夠無語的，差點就要被他們給逼瘋了。
於是神月就在這種情況下，度過了5年年，但由於神月不知道那不知名忍術有沒有什麼危害，所以那5年中，神月再也沒用過那個招式了，卻憑借那些變異寄壞蟲的力量，成為了學校裏僅次於宇智波鼬的天才。
這5年裏，誌村團藏曾無數次對玄天神月進行過招攬，但毫無疑問，全部都以失敗告終。最後，團藏抱著“我得不到誰也別想要”的心態對玄天神月進行大肆抹黑，將神月是敵國忍者間諜的身份傳的到處都是，神月想為自己辯解，卻遭到了無情的蔑視和厭罵。
最終受不了這些言論的神月選擇了叛逃，而誌村團藏則出動了大量根部忍者進行追擊。盡管一路上寄壞蟲們阻攔了不少根部忍者，但它們卻全部折在了油女取根的手上。變異寄壞蟲的戰鬥力是很強，但是油女取根的納米級毒蟲卻讓它們中毒不淺，畢竟油女取根的納米級毒蟲隻有第四次忍界大戰時油女誌乃培養的特殊寄壞蟲才能克製，變異寄壞蟲們拚死掩護神月逃跑，神月是成功脫險了，寄壞蟲們卻再也忍受不了毒素而毒發身亡了。
時間回到現在，神月在一棵樹下暫時停了下來，他需要休息一下。長時間的奔跑耗費了太多的體力和精力，他靠這樹坐了下來，回想了他在這段時間被村民們誤會、被根部忍者追殺、被油女取根以強大的實力碾壓自己以及寄壞蟲們舉起前足向自己告別後衝向敵人的場景曆曆在目。
“快一點，玄天神月一定就在這附近！抓緊找，別讓團藏大人等急了！”
聽見聲音的神月立即站了起來，說道：“瑪德，追的真快！”隨後又開始了逃亡。
“找到他了！他在這！”一名根部忍者大喊。
神月奔跑的途中想著：“沒辦法了，用那個吧。”於是結了一個印，那是他當初釋放的不知名忍術時結的印。
紫霧和當時一樣，出現在神月身邊，但是紫霧突然凝聚成一個箭頭，朝著一個方向指定。
“我的主人，玄天神月……”
“誰？！”神月神經一緊，他不知道這聲音來自於哪，也不知道說話的人是誰。
“順著指引，尋找我吧……”
“我將為您，解決難關……”
神月聽著這些話有點疑惑，但身體卻如同不受控製般向紫霧箭頭指的方向移動，一直到一處山洞。