糖酵解途徑：（線粒體外細胞質）
葡萄糖在己糖激酶的作用下，不可逆地生成6-磷酸葡萄糖，消耗一分子ATP生成ADP，6-磷酸葡萄糖在磷酸己糖異構酶的作用下可逆地生成6-磷酸果糖，6-磷酸果糖在磷酸果糖激酶的作用下，消耗一分子ATP生成ADP，不可逆地生成1，6二磷酸果糖，1，6二磷酸果糖在醛縮酶的作用下先裂解成1分子的磷酸二羥丙酮和1分子3-磷酸甘油醛，1分子的磷酸二羥丙酮可逆地生成1分子的3-磷酸甘油醛後，才可進行下一步，在3-磷酸甘油醛脫氫酶的作用下可逆地生成1，3-二磷酸甘油酸（酰基），消耗NAD和pi生成H和NADH，再在磷酸甘油酸激酶的作用下 ，消耗磷酸和ADP生成ATP，生成3-磷酸甘油酸，在磷酸甘油酸變位酶的作用下生成2-磷酸甘油酸，再在烯醇化酶的作用下生成磷酸烯醇式丙酮酸，再在丙酮酸激酶的作用下，不可逆消耗ADP和pi生成ATP，生成丙酮酸。
糖異生
丙酮酸在丙酮酸羧化酶的作用下生成草酰乙酸，在磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶，消耗GTP生成GDP和Pi和二氧化碳，和磷酸烯醇式丙酮酸。
果糖-1，6-二磷酸在果糖-1，6-二磷酸酶，消耗水生成pi和果糖-6-磷酸
葡萄糖-6-磷酸在葡萄糖-6-磷酸酶作用下生成葡萄糖
質粒提取：
solution 1 tris -HCL緩衝液，EDTA螯合劑，螯合金屬離子，RNaseA:水解核糖核酸酶
solution2:
NaOH:破壞細胞壁，破壞氫鍵，使大DNA從雙鏈變為單鏈，質粒超螺旋
SDS：使細胞膜溶解，使蛋白變性
solution3:KAc:與SDS結合形成PDS，PDS帶著基因蛋白質沉澱從而分離出來，然後用高鹽將質粒吸附到矽膠柱上，因為柱為負性電極，高鹽中Na離子為正電極，Na離子與柱吸附 DNA為負性的，DNA與Na結合
然後用異丙醇除去雜蛋白，對溶液進行純化，然後用70%乙醇進行濃縮，最後洗脫得到目標產物。
conventional (常規的）Pcr：
菌落pcr:colony pcr
反向PCR：inverse pcr
熒光定量PCR：Real-time PCR表達倍數（基因表達量）
融合PCR：overlap extension PCR
降落PCR：touch down PCR
啟動子：是DNA鏈上能與RNARol結合並有效起始RNA轉錄的DNA序列
在一條DNA序列中，啟動子包括：識別位點-35區，結合位點-10區。-1和1之間的為起始位點。
識別位點和結合位點之間有17bp左右的距離。
trp的啟動子-35區ttgaca，-10區ttaact
tRNATyr的啟動子-35區tttaca，-10區tatgat
lac啟動子：-35區tttaca，-10區tatgtt
recA啟動子：-35區ttgata，-10區tataat
Ara BAD啟動子：-35區ctgacg，-10區tactgt，共有序列：-35區ttgaca，-10區tataat
阻遏蛋白：由調控基因（i基因）編碼，DNA結合蛋白，特異性識別並結合操縱子，阻止轉錄。信號分子+阻遏蛋白—變構—結合DNA（或去結合）。特異性結合位點：AATTGT ACAATT
i與操縱子（O）連在一起時，順式調節子，i與操縱子特別遠，反式調節子（trans-）
正調控蛋白：CRP蛋白
在一個啟動子中，CRP結合部位為GTGAGCTCAC，-35區TTTACAC和-10區TATGTT（lac啟動子）是RNA聚合酶結合部位，+1區AATTGT ACAATT 為阻遏蛋白結合部位
上調控序列被稱為順式作用元件。
倒位蛋白：位點特異性重組酶