香讚
爐香乍爇，法界蒙熏，諸佛海會悉遙聞。隨處結祥雲，誠意方殷，諸佛現全身。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。
南無香雲蓋菩薩摩訶薩。
淨身業真言
唵，修哆利，修哆利，修摩利，修摩利，薩婆訶。
唵，修哆利，修哆利，修摩利，修摩利，薩婆訶。
唵，修哆利，修哆利，修摩利，修摩利，薩婆訶。
淨口業真言
唵，修利，修利，摩訶修利，修修利，薩婆訶。
唵，修利，修利，摩訶修利，修修利，薩婆訶。
唵，修利，修利，摩訶修利，修修利，薩婆訶。
淨意業真言
唵，嚩日囉怛訶賀斛。
唵，嚩日囉怛訶賀斛。
唵，嚩日囉怛訶賀斛。
淨三業真言
唵，娑嚩，婆嚩秫馱，娑嚩達摩娑嚩，娑嚩秫度憾。
唵，娑嚩，婆嚩秫馱，娑嚩達摩娑嚩，娑嚩秫度憾。
唵，娑嚩，婆嚩秫馱，娑嚩達摩娑嚩，娑嚩秫度憾。
安土地真言
南無三滿哆，母馱喃，唵度嚕度嚕，地尾薩婆訶。
南無三滿哆，母馱喃，唵度嚕度嚕，地尾薩婆訶。
南無三滿哆，母馱喃，唵度嚕度嚕，地尾薩婆訶。
普供養真言
唵，誐誐曩，三婆嚩，伐日囉斛。
唵，誐誐曩，三婆嚩，伐日囉斛。
唵，誐誐曩，三婆嚩，伐日囉斛。
發願文
稽首三界尊，皈命十方佛。
我今發宏願，持此藥師經。
上報四重恩，下濟三途苦。
若有見聞者，悉發菩提心。
盡此一報身，同生極樂國。
親覲大慈父，殷勤聞真諦。
學習獅子吼，回返婆娑地。
度眾脫苦海，弘法利群迷。
奉請十二藥叉大將
奉請宮毗羅大將。奉請伐折羅大將。
奉請迷企羅大將。奉請安底羅大將。
奉請額你羅大將。奉請珊底羅大將。
奉請因達羅大將。奉請波夷羅大將。
奉請摩虎羅大將。奉請真達羅大將。
奉請招杜羅大將。奉請毗羯羅大將。
奉請八菩薩
奉請文殊師利菩薩。
奉請觀音菩薩。
奉請得大勢菩薩。
奉請無盡意菩薩。
奉請寶檀華菩薩。
奉請藥王菩薩。
奉請藥上菩薩。
奉請彌勒菩薩。
南無藥師會上佛菩薩
開經偈
無上甚深微妙法，百千萬劫難遭遇。
我今見聞得受持，願解如來真實義。
藥師琉璃光如來本願功德經
大唐三藏法師玄奘奉詔譯
第一，法會緣起分
如是我聞。一時薄伽梵，遊化諸國，至廣嚴城。住樂音樹下，與大苾芻眾八千人俱，菩薩摩訶薩三萬六千，及國王大臣、婆羅門、居士、天龍八部、人、非人等，無量大眾。恭敬圍繞，而為說法。
第二，曼殊室利啟請分
而是曼殊室利法王子，承佛威神，從座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵，曲躬合掌，白言。世尊，惟願演說如是相類諸佛名號，及本大願殊勝功德。令諸聞者，業障消除，為欲利樂。像法轉時，諸有情故。
爾時世尊，讚曼殊室利童子言。善哉，善哉。曼殊室利，汝以大悲，勸請我說諸佛名號，本願功德。為拔業障所纏有情，利益安樂，像法轉時，諸有情故。汝今諦聽，極善思惟，當為汝說。
曼殊室利言，唯然，願說，我等樂聞。
第三，藥師琉璃光如來分
佛告曼殊室利。東方去此過十殑伽沙等佛土。有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來。應正等覺，明行圓滿。善逝，世間解，無上士。調禦丈夫，天人師，佛，薄伽梵。
第四，藥師如來十二大願分
曼殊室利，彼佛世尊藥師琉璃光如來。本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情，所求皆得。
第一大願，願我來世得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明熾熱，照耀無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨行，莊嚴其身。令一切有情，如我無異。
第二大願，願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍。身善安住，焰網莊嚴，過於日月。幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
第三大願，願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情，皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
第四大願，願我來世得菩提時，若諸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中。若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之。
第五大願，願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中，修行梵行，一切皆令得不缺戒。具三聚戒，設有毀犯，聞我名已，還得清淨，不墮惡趣。
第六大願，願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾喑啞，攣躄背僂，白癩癲狂。種種病苦，聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。、
第七大願，願我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦。我之名號一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
第八大願，願我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願舍女身。聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
第九大願，願我來世得菩提時，令諸有情，出魔罥網，解脫一切外道纏縛。若墮種種惡見稠林，皆當引攝於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。
第十大願，願我來世得菩提時，若諸有情，王法所錄，繩縛鞭撻，係閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難淩辱。悲愁煎迫，身心受苦。若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
第十一大願，願我來世得菩提時，若諸有情，飲渴所惱，為求食故，造諸惡業。得聞我名，專念受持。我當先以上秒飲食，飽足其身，後以法味畢竟安樂而建立之。
第十二大願，願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服，蚊虻寒熱，晝夜逼惱。若聞我名，專念受持。如其所好，即得種種上秒衣服，亦得一切寶莊嚴具。華䰋塗香，鼓樂眾伎，隨心所玩，皆令滿足。
曼殊室利，是為彼世尊藥師琉璃光如來，應正等覺，行菩薩道時，所發十二微妙上願。
第五，淨琉璃世界分
複次，曼殊室利，彼世尊藥師琉璃光如來，行菩薩道時所發大願，及彼佛土功德莊嚴。我若一劫，若一劫餘，說不能盡。然彼佛土一向清淨，無有女人，亦無惡趣及苦聲音。琉璃為地，金繩界道，城闕宮閣，軒窗羅網。皆七寶成。亦如西方極樂世界，功德莊嚴，等無差別。於其國中，有二菩薩摩訶薩。一名日光遍照，二明月光遍照，是彼無量無數菩薩眾之上。次補佛處，悉能持彼世尊藥師琉璃光如來正法寶藏。是故曼殊室利，諸有信心善男子，善女人等，應當願生彼佛世界。、
第六，聞佛名惡趣得度分
爾時世尊，複告曼殊室利童子言，曼殊室利，有諸眾生，不識善惡，唯懷貪吝。不知布施，及施果報，愚癡無智，闕於信根，多聚財寶，勤加守護。見乞者來，其心不喜，設不獲已。而行施時，如割身肉，深生痛惜。複有無量慳貪有情，積集資財，於其自身尚不受用，何況能與父母妻子、奴婢作使，及來乞者。彼諸有情從此命終，生餓鬼界，或旁生趣，由昔人間曾得暫聞藥師琉璃光如來名故。今在惡趣，暫得憶念彼如來名，即於念時，從彼處沒，還生人中，得宿命念。畏惡趣苦，不樂欲樂，好行惠施，讚歎施者，一切所有悉無貪惜。漸次尚能以頭目手足，血肉身分，施來求者，況餘財務。