木葉51年
九尾之亂爆發，強盛的木葉忍村遭九尾狐妖重創。
那是一個充斥著哭泣與哀嚎的夜晚，無數木葉人民跪立於廢墟之中抱著親人的殘屍發出悲鳴的嗚咽，直至清晨，宇智波一族的族長“宇智波富嶽”才率領宇智波忍者姍姍來遲。
宇智波富嶽下令讓跟隨者加入搜救的隊列，可迎接他們的卻是來自木葉人民眼中的仇恨，因為所有人都見到了，九尾狐妖眼中的寫輪眼，那是獨屬於宇智波一族的眼睛，也因此，宇智波一族收到了三代火影的命令不允許參戰，隻能在九尾之患解決後才得以出門。
災難之後，木葉人民心中的不滿與怨恨似乎都指向了宇智波一族，麵對前來搜救的宇智波忍者皆露出仇視敵對的目光，更有甚者會直接張口怒罵，並且這種摩擦還在不斷增多。
風塵仆仆的三代火影\"猿飛日斬\"抱著一個哇哇啼哭的嬰兒走過宇智波富嶽的身旁，似為關心的說了句：“先回去吧，我會安撫好他們的。”
宇智波富嶽眼角餘光掃過他懷中的嬰兒，無言點頭回應，抬手召回宇智波忍者轉身離去，在回去的途中，他聽到了那句熟悉的台詞：“木葉飛舞之處，火亦生生不息。”
他站在人前回頭看去，所有人都在三代的演講中重燃起希望，隻有宇智波一族默默退場，好像他們本就不屬於這個村子一樣。
一路沉默走回族地，自己的妻子正抱著一個唑手指的嬰兒站在門外等他，在妻子身旁還有一個三歲大小的男孩，他懷中也抱著一個不停蹬腿的嬰兒。
宇智波富嶽勉強對自己的家人們露出一個微笑，接著馬不停蹄的帶領追隨者走向宇智波祠堂，那裏還有一場會議要開。
三歲的宇智波鼬抱著剛出生的宇智波佐助看向父親離去的背影，淡漠的目光中透露出一絲憂慮。
同樣的，另一個嬰兒也在看著宇智波富嶽逐漸走遠的背影，她本是不屬於這個世界的人，卻降生到了這，並且得到了一個意義非凡的名字宇智波月。
宇智波月忘記了自己的從前，卻記得經曆過的事，那是一個高樓林立，鐵軌打通全球的時代，她還記得從前看過的碟片，其中就有《火影忍者》。
而現在這個世界，就是火影忍者的世界，距記憶中的時間回顧，七年後宇智波一族就會被覆滅，而且凶手還是自己這一世的親哥哥宇智波鼬。
思索完，宇智波月將目光看向三歲的宇智波鼬，哪怕年紀幼小，也能從他臉上看到大人的成熟。
月不知道鼬這一次會選擇留下佐助還是自己，她不想死，所以她要阻止滅族的發生，她當然有這個能力，因為她識海中擁有九把不知從何而來的妖刀。
妖刀分別對應九隻尾獸，作用就是封印它們。
宇智波月已經開始策劃未來的路，而當下要做的事是喝奶。
第二日，山林中飄來大霧，一隻雄鷹鳴叫著飛過房屋的廢墟降落在火影大樓，戴著貓臉麵具的銀發忍者從鷹爪下取出密信呈現在猿飛日斬麵前。
看後，猿飛日斬眉頭一皺，將五指合攏捏成拳，指節發出脆響，這個久坐火影寶位的老人褪去他和藹慈祥的目光露出鷹一般的犀利眼神大手一揮怒吼而出，開戰。
因九尾之亂造成了木葉四代目火影隕落，聞名天下的三忍也各自離村，此時正是木葉忍村最為薄弱的時候，垂涎木葉良土的外敵雲隱村趁機發起侵略戰爭。