二戰結束後，聯合國秘密成立了一個由世界最頂尖特工組成的情報組織——世界特工組織，在這個組織裏，特工由高到低分為A，B，C，D，E，F，G七個等級，在A級之上還有一個S級，但是特工組織成立至今隻有兩人達到了S級別，能達到這個級別的特工已經能夠以一當百，並且在特工組織裏擁有僅次於組織最高管理者——主帥的地位，是世界上所有特工終生追求的目標。
然而特工組織培養，選拔特工的製度也極其嚴格而殘酷，被選中有天賦成為特工的人可以在14歲時選擇簽署協議來成為特工組織的特工學員，進入特工學院進行學習和訓練，通過結業考核即可成為預備特工，再經過選拔可成為見習特工，見習期實行積分製，見習期立功或見習分達到180分即可正式成為特工並開始執行分配的任務。
成為特工雖然可以擁有極其可觀的收入也是很多人的夢想，但是代價也是很大的，從簽署協議成為學員，踏上成為特工的第一步開始，你將接受常人難以接受的殘酷訓練，等待你的將會是挑戰各種身體機能的極限，不但要進行大量的體能訓練，還要進行記憶力，反應力等高強度腦力訓練，隻有體能和腦力達到要求才能通過最基本的基礎考核，成為預備特工。預備特工階段才會接受特工技能的學習和訓練，該階段結業後會進行決定是否具備特工能力的特工考核，該考核極其困難且殘酷，甚至有人可能會在這個考核中失去生命。但為了保證特工組織高效運轉，組織錄用的特工都是萬裏挑一的精英。
至於特工組織那神秘的最高管理者，誰也沒見過他的容貌，每次分配任務時特工看到的隻是屏幕上一個黑色的影子，即使是S級的特工也隻是知道他代號主帥。
2001年12月31日，特工組織收到了一封匿名信，信中詳細描述了2002年將要發生五個重大事故，據信中所說，每個事故的傷亡都超過了千人，火災，集體食物中毒，恐怖襲擊，甚至有地震和海嘯。當時大家都覺得這是一場鬧劇，都以為是虛假的惡作劇而已。直到2002年4月5日，信中所說的第一起重大事故真的發生了，事發時間，傷亡人數以及事故類型竟和信中所述完全一致，此時組織還認為可能是巧合，但是信中描述的第二起，第三起，第四起，第五起事故相繼發生，特工組織開始高度重視這封匿名信，並派出了一些特工調查信的來路，結果參與調查的特工竟全部離奇失蹤。
2002年的12月31日特工組織又收到了同樣的一封信，信中說2003年會爆發大規模疫情，並且二十年後人類會滅絕。而這封信的署名是一個字母L，隨後組織派出大量特工調查，結果隻有一個人活著回來，而且精神已經出了問題，重複說著一句話：末日要來了……
後來2003年確實發生了世界範圍的疫情，但是很快就控製住了，病毒也消失了，而且特工組織沒有在2003年最後一天收到類似的信，就這樣過了十年，2013年的最後一天，還是12月31日，特工組織又收到了一封信，內容隻有八個字：別忘了末日的存在，而且署名還是那個L字母。
在一個與世隔絕的房間，那位誰也從未見過的主帥默默自言自語：難道真的是他？