泰拉大地上有一種東西叫源石，會通過天災傳播，讓人類得不治之症。得了礦石病的人類有可能可以空手施法，但遲早必死無疑，人類死於源石病後會炸成更多的源石粉塵感染更多人。天災會在泰拉大地上頻繁且隨機地發生，人民不堪其擾，索性把城市建在了移動平台上，成了移動城市：城市以年為周期在固定路線上移動，躲避各個區域周期性的天災。
各地之間人員和物資的流通因為天災的存在，是受阻的，從而導致信息的流傳也受阻。一個炎國的老農可能一輩子都不知道還有個地方叫哥倫比亞，薩爾貢的難民也不知道天底下還真有安全的地方；網絡也不是全世界互聯的，隻能做到城際，跨國通訊還得靠人力，被感染的礦石病人廣受歧視。
羅德島的前身是卡茲戴爾複國與薩卡茲民族自救運動的巴別塔組織。巴別塔失敗後，願意留在凱爾希身邊的成員組成了羅德島。羅德島推出的礦石病抑製藥物來自凱爾希的知識儲備，她還有存貨，隻是如今最高的生產力造不出來。
對凱爾希來說，她的目標隻有幫助人類發展一條，解決感染者問題也能推進人類發展，所以改變工作重心也不是問題。
羅德島的本質算是個救火隊。在各地都有辦事處，哪裏的感染者處境很惡劣，就去哪裏給感染者提供幫助；哪裏的感染者發展到了恐怖分子的階段，也會去鎮壓。
明日方舟的故事是苦難與不公的集合體
《明日方舟》的故事發生在一個架空世界“泰拉”中。這裏有著與地球相似而又截然不同的環境，曆史和文明。這裏的主要居民是帶有各種動物特征的亞人類，而是否存在純粹的“人類”，目前還不得而知，早期有人通過華法琳的語音推測博士可能是純粹的“人類”，但是後來官方在後來與玩家的交流中表示當時已有的對博士身份的猜測基本都是錯的。由於有被用於食用的“獸肉”存在，以及從敵人會使用類似犬科動物的感染生物、部分幹員飼養著寵物（如慕斯的貓貓、艾雅法拉的小黑羊、銀灰的丹增、傀影的Miss Christine等）這幾點來看，泰拉世界可能存在著一些和地球生物相似的生物，不過在稱呼與形態上可能和對應的地球生物有所差別（如泰拉世界的鳥類形態生物被稱為羽獸）。但是注意到，根據幹員慕斯的檔案描述，泰拉世界觀中的人對“貓貓”這一生物似乎並不熟悉。綜合艾雅法拉、傀影、慕斯等幹員的檔案以及語音，幹員飼養的寵物和其源石技藝可能有極大的聯係，亦或是這些寵物均為源石技藝的產物。
天災——表現為各種自然災害的巨大災難（如風暴、地震、隕石墜落等），是文明的大敵。在它麵前，所有的事物都不堪一擊。但在帶來毀滅的同時，天災也帶來了源石——一種自然界能量結晶形成的神秘礦石。源石的開發讓文明進入了現代，建立起了以源石為基礎的科技體係。
然而，源石開發中泄露的物質也催生了不祥的礦石病患者，也就是“感染者”。他們無法被治愈，礦石會在他們身上逐漸擴散結晶，在殺死患者後進行二次擴散。為此，感染者成為了被社會排斥的對象。沒有人能告訴礦石病患者要如何生存下去，於是其中具有天賦的他們，賭上各自的未來，誓要為世界帶來震顫。
泰拉曆1096年12月，世界上最大的感染者組織——整合運動，在烏薩斯帝國城市切爾諾伯格掀起了暴亂。他們借助一場天災占領了該城市，並準備以此為跳板，進攻臨近的城市龍門。而同時，另一個神秘的感染者組織——羅德島出現在了這裏，即將與整合運動展開正麵衝突。明日方舟的故事，也就從這裏拉開了序幕……