07智戰部隊在地麵的戰鬥中已經消滅了大部分變異體部隊，加撒地下城殘存的變異體根本不敢到地麵支援，區域的空中被完全掌控，電磁脈衝裝置基本被清空。
從前獵魔行動很容易被合圍，深入惡魔腹地危險重重。現在戰局徹底扭轉，所有獵魔小隊沒有後顧之憂。最為關鍵的是，區域內智慧戰場監控每一個角落，所有變異體的反科技手段都被壓製，高科技裝備可以最大限度發揮作用，空中、地麵、遠程、近程、範圍殺傷、精確製導各種手段盡出，智慧戰場“發現即摧毀”的能力盡顯優勢。
事實證明，變異體的猖獗隻是人類文明發展史上的一股逆流。變異體致力於基因的無限製改造，致力於用科技手段發展出反科技的手段，以此片麵強調基因優勢去彌補與主流科技的係統性劣勢。當反科技手段被人們清晰認識達不到突然性的時候，人類文明就可以完全實現碾壓。
地上的清剿推進平穩，地下的進一步清剿卻不盡如人意。地下溶洞分支太多，地域廣闊，通道四通八達，經過長期的經營，未來聯盟在地下溶洞群中布置了大量的遙控炸藥、陷阱、水閘，初期的進入順利是因為具有突然性，變異體沒有組織好有效的抵抗。隨著未來超級物種聯盟的指揮體係反應過來，溶洞群中的各類機關運轉起來，越往溶洞群深處推進，遇到的困難就越大。變異體到處製造塌方，地下水區域性放水，智能機器人也有極限，推進陷暫時入僵局。
關鍵人物傑恩二世和很多未來超級物種聯盟高層都銷聲匿跡，萊特諾瑪口中的變異體生產線、基因實驗室、地下核電站等等都沒有任何線索。
一個村口的道路上幾乎聚集了全村的人，幾個老者在跟獵魔隊員交涉：“他們控製著糧食和水源，不為他們工作就得餓死，山上除了罌粟種不了別的，你們把罌粟地毀了，這些孩子、老人就得餓死。”整個金三角被未來超級物種聯盟經營多年，對當地民眾的懷柔兼恐嚇讓很多平民成為變異體的附庸，甚至一些人接受了基因改良和身體改造成為變異體，更多的人保持沉默，這些導致更大範圍的地麵清剿進度緩慢。
加撒地下城被經營了十多年，如同一個巨大的地下城市，傑恩二世藏身的溶洞早就建立了保證長期生存的生命維持係統，還有秘密光纖和外界溝通信息。當地下城被攻入時，傑恩二世來到自己的“避難所”，在那裏它引爆了地下城很多關鍵節點的炸藥，爆炸產生的塌方阻斷了大部分通道。導致地下環境更加複雜，想要找到傑恩二世無異大海撈針。
此刻的傑恩二世正打開便攜電腦自言自語地說：“開始吧，變亂的世界。”
就在剛才，傑恩二世向全球直播了自己宣讀《未來超級物種聯盟宣言》。
傑恩二世絲毫沒有掩飾自己的失敗，它在全球講話中替自己開脫：“這份宣言本來準備在勝利之日再發出的，但是勝利之日要晚一些到來了。這份宣言就當是新時代的開端吧，我並不害怕失敗，短暫的失敗並不能阻擋文明前進的大勢所趨。”
宣言中寫著：“生命的發展不應限製在人類這具軀殼裏，地球文明的未來需要更高層次的生命形式。”
“基因是與生俱來的，選擇改變基因的權利是自己的。”
“今天就是嶄新文明開啟的一天。”