明朝中葉，由於商品經濟發展，土地買賣也非常頻繁，這也是造成土地兼並嚴重的原因之一。當時，皇親國戚、皇室的藩王、宦官、官僚憑借自己政治上特權，大肆購買土地與掠奪土地，建立莊田。
明朝中葉各類莊園的總數究竟有多少，雖然現在沒有完整的記載，留下的幾個片段統計數字可以充分證明。如《明史》卷七七記載：
“弘治二年，戶部尚書李敏等以災異上言：‘畿內皇莊有五，共地萬二千八百餘頃，勳戚中官莊田三百三十有二，共地三萬三千餘頃。”
這隻是在北京地區對一個戶部尚書擁有莊園土地麵積的統計數據，可以看到當時莊園麵積是如此龐大，土地兼並也是日益膨脹。這些地主豪強擁有大麵積土地，通常也偷稅漏稅，朝廷征不了稅，也造成財政危機。如《大明劫》裏麵孫傳庭的軍隊缺少軍餉，朝廷撥不出銀子，也是國庫真的沒錢了。
在天啟帝 朱由校落水駕崩，由朱由檢登基後， 他劈麵遇到的棘手問題，便是如何處置專擅朝政、氣焰囂張的客氏與魏忠賢。如果聽之任之，放任客、魏繼續為非作歹，那麼他就可能成為第二個朱由校——當一個傀儡皇帝，這是這個剛毅自強的人所不能容忍的。
而魏忠賢則故伎重演，在朱由檢即位不久就進奉絕色女子四名，既是討好，又是迷惑。朱由檢其人與他的列祖列宗絕不相同的一點，就是不好女色。對於魏忠賢進奉的絕色女子本不想接受，又恐引起魏的疑心，便接受了。入宮後，對四名女子搜遍全身，並無可疑之物，隻見各人都在裙帶頂端佩香丸一粒，大小如同黍子，名叫“迷魂香”。此物十分奇特，男子一接觸便產生迷魂效應，欲心頓起。朱由檢毫不猶豫地命她們毀棄這“迷魂香”。又一個晚上，朱由檢與大臣議論朝政後正在靜心思考，忽然一陣陣奇異的香味幽幽傳來，似有若無，縷縷不絕。他這個不近聲色的人也不由得聞香心動了，立即命近侍太監秉燭檢查，查遍了壁隅，竟一無所見。過了一會，望見遠處殿角有微弱的火星閃爍，前往一查，見一小宦官持香端坐於複壁內。一審問，原來是魏忠賢派來的。朱由檢不由得長歎一聲：“皇考皇兄皆為此誤！”他不願成為如同皇兄那樣聽任客、魏擺布的昏聵君主，但是要擺脫他們二人並不是一件易如反掌的事情。
客、魏一個自稱“老祖太太千歲”，一個自稱“九千歲”，宮內宮外都布滿了親信黨羽，內外呼應，盤根錯節，朝廷上下都在他們的控製之下，稍有不慎，局麵就難以收拾。朱由檢畢竟不同於他的皇兄，是一個極有主見、極有韜略的君主，以大智若愚的姿態應對自如。一方麵，他擺出若無其事的樣子，把精力集中於冊封後妃及籌辦熹宗喪葬事務上，不讓客、魏感到有什麼異常動態；另一方麵，他一如熹宗在世時那樣，繼續優容客、魏，對彈劾客、魏及其黨羽的奏章一概置之不理，給客、魏之流造成錯覺。
即位次日，他要禮部詳議追尊生母賢妃劉氏，以盡他對母親多年思念的一片孝心。正如他給禮部的諭旨所說的那樣，“慶源有自，禮必隆於所生；孝思永言，施必由於親始”。幾天後，他要禮部挑選吉日冊封元妃周氏為皇後。禮部遵旨於九月二十一日議定，追諡聖母賢妃劉氏為孝純皇太後，並選定九月二十七日冊立周氏為皇後，由英國公張惟賢持節，大學士黃立極捧冊，大學士施鳳來捧寶，舉行冊封禮。禮畢後，朱由檢接受百官表賀，並把皇後之父周奎由南城兵馬司副指揮提升為右軍都督同知，任命皇後的兄長周文炳、周文耀為兵馬司副指揮。
作為穿越者的朱由檢他深知任由下去可能自己變成傀儡皇帝，但是魏忠賢的皇權來源於皇帝殺之又一時半會找不到製衡東林黨的工具人。
思來想去，就在他任命王安司禮監掌印太監後結果沒成想，魏忠賢指示給事中霍維華彈劾王安，矯旨降王安為南海子淨軍，然後把曾趁西李移宮時偷盜珍寶的太監劉朝釋放出獄，充任南海子提督，再弄死了王安。
朱由檢萬方無奈下加之客氏一番說辭，逐漸令朱由檢缺乏一絲安全感，如不除掉魏忠賢與客氏恐怕他的人身安全將會極大威脅。