日本神話的開始是天地原本是一片混沌，在這片混沌的天地之中出現了五柱神，裏麵最厲害的神叫做天之禦中主神，第二個是創造了天的神叫做高禦產巣日神，第三個是創造了地的神叫做神產巢日神，第四個是活力之神名字是宇摩誌阿斯訶倍比古遲神，第五個是時間之神，叫做天之常立神，也是永久之神，沒有描述樣子，也沒有說明性別。日本的神不是論個或者位，而是“柱”，所以最開始的時候是出現了五柱神。
五柱神出現之後又出現了十二柱神，分為七代，第二代和第二代都是單獨的一個神，也沒有性別，從第三代到第七代的五代都是一對一對出現的，不過不是叫男神和女神，是叫一個陽神和一個陰神，不過為了便於表達，還是叫回男女。最重要的也就是最後那一對，女神叫做伊美那岐，男神叫伊邪那岐。這兩個神是一男一女，他們是兄妹同時也是夫妻，和中國的女媧伏羲是一樣的。
日本神話把世界分成了三層，最上層叫“高天原”是神界，中間的叫做“葦原中國”是人界，最下麵的叫做根之國或者黃泉之國是冥界，冥界的描述和我國以及北歐神話很相似，都叫黃泉。
很久之前最頂層的天神就命令伊美那岐和伊邪那岐兩個人下去下去創建世界和國家，他們來到了人界之後，當時什麼都沒有全部都是水，他們漂在空中，用一根長矛在水裏攪合，一攪一提，就形成了大陸，然後就落到了這塊大陸上，之後就立起了一根大柱子，豎到了天庭，然後他們站在柱子兩側說接下來就要創建世界萬物，通過他們倆的結合創造世界萬物。然後，他們站在柱子兩側，走到中間，相遇，然後結合生出世界萬物來，雖然之前已經認識，但是要有這麼一個相遇的儀式。
他們走到中間的時候，女神就說這個小夥子很好看，然後男神說，好我們結合吧。他們以結合結果什麼都沒生出來，然後就去問天神，為什麼失敗了，天神說不能由女的先說起，要由男的來引導，然後他們就又回去，這回是男神說，美女！女神說，我們結合吧。他們結合之後生出了八塊大陸，但是沒有說清楚這八塊大陸是日本還是世界。生出八塊大陸之後又開始繼續生萬物之靈，比如石之靈，石頭的靈，水之靈、山之靈、風之靈等等。而且不單女神生，男神也跟著一起生。
生出了萬物之靈之後，最後出來的是火之靈，火之靈出來之後就把伊美那岐給燒死了，伊邪那岐看到很憤怒，一刀就把火之靈給弄死了。伊邪那岐舍不得自己的妻子和妹妹，就一直追到了黃泉，到了黃泉之後也找到了伊美那岐，可是伊美那岐說已經來不及了，她已經吃了黃泉的食物了，回不去了。伊邪那岐就說那他也不回去了，就在這陪你。伊美那岐很感動就說，那我去求求天神看看能不能把我複活了，但是你不可以看我這邊。伊邪那岐就在那等，等了很長時間，都沒有任何消息，他就好奇，黃泉是一片漆黑是什麼都看不見的，點了個火把往那邊看了一下，一看把他嚇的調頭就跑。伊美那岐全身都腐爛了，伊美那岐就想，剛才還海誓山盟，現在就跑的沒影，就命令黃泉醜女去追殺，這邊的醜女的意思不是醜陋，是邪惡的鬼的意思。
伊邪那岐跑的很快，單黃泉惡鬼跑的也很快，一下就追上了，伊邪那岐就扯了一把胡子丟在地上，變成了一串葡萄，惡鬼就在地上開始吃葡萄，他就接著跑。又快被追上的時候就又變了一些竹筍扔在地上，惡鬼就開始吃竹筍，他就接著跑，最後他撒了一泡尿，變成了大河，惡鬼隻好在河裏遊泳追，而這時候伊邪那岐也到了黃泉的入口。
伊邪那岐跑出去以後伊美那岐就很憤怒，並且發誓每天要殺死人界1000個生靈，伊邪那岐為了保證能夠繼續發展下去，決定每天生1500個生靈，並且從此不再與伊美那岐再相見。
伊邪那岐回來以後全身都沾滿了汙穢的東西，於是他到河裏打算把汙穢洗掉，在這個洗的過程之中不斷的產生了新的神，汙穢也就變成了災難，但是同時也產生了除災難之神。而且在整個洗澡的過程之中，產生了3個非常重要的神，也就是日本神話中最核心的3個神。一個是太陽神天照大神，是一個女的；還有一個是月神，叫月讀；還有一個叫須佐之男，他是荒神，也就是混亂之神，同時他掌管人界。
須佐之男一開始掌管的是海洋，但是他不想掌管海洋，他就每天哭，他就每天哭阿，他爸伊邪那岐就問他怎麼了，他就回答他想去黃泉見他媽，伊邪那岐就說你想見你媽，那你就走吧，就把他趕離了天界，後來伊邪那岐隱退了，把所有的權利交給了天照大神。須佐之男就來到天界找他姐天照大神，說想回天界，天照大神特別討厭這個荒神，因為須佐之男會各種的搗亂，她去見須佐之男的時候都要身穿盔甲，怕被暗算。