陳文帝天嘉四年(563)六月，陳蒨又除掉了對他有擁戴大功的司空侯安都。
侯安都，字成師，始興曲江人，數世為郡裏大姓。自陳霸先嶺南起兵，侯安都就擁兵相從，“攻蔡路養，破李遷仕，克平侯景，並力戰有功”。尤其是攻殺王僧辯，侯安都作為先鋒將、先鋒兵，單身一人被人扔過石頭城女牆，確實獨膽英雄。如此一個赳赳武夫，“工隸書，能鼓琴，涉獵書傳，為五言詩，亦頗清靡”，文武全才，世所罕有。而後，侯安都又率兵屢破北齊軍，生擒數員北齊大將，並協助周文育擒斬梁宗室蕭勃。沌口一戰，雖敗於王琳，侯安都又能虎口脫臉，威名未墮。陳霸先死後，推陳文帝繼位，殺掉礙事的陳昌，又進敗王琳、留異。於陳文帝而言，侯安都怎麼說也是第一功臣。所以，投桃報李，陳文帝榮顯侯安都一家老小，其父病死，文帝在建康予其風光大葬。侯安都小兒子侯秘才九歲，就被授為始興內史。
由於功勳卓著，又“有恩”於陳文帝，侯安都慢慢“膨脹”起來，多次招聚文武之士，“或射馭馳騁，或命以賦詩，第其高下，以差次賞賜之”，完全就是個曹操大丞相的陳朝版。而且，其部下將帥仗著侯安都勢力，多違法亂紀，朝廷查處，紛紛逃入侯安都處躲避，廷尉也不敢抓人。“世祖(陳蒨)性嚴察，深銜之”。侯安都恃功自傲，無所收斂，“日益驕橫”，連給皇帝的書奏也不依格式，批公文一樣隨開隨啟，想寫什麼就寫什麼。
最過分的一次，陳文帝在皇宮宴飲重臣，侯安都酒酣興起，箕坐斜靠，大聲問陳文帝:“現在您與做臨川王的時候相比感覺如何?”陳文帝慍怒，假裝沒聽見，不答。侯安都不識趣，連問好幾次。陳文帝強按怒氣，回答說:“為帝雖是天命，也多虧明公之力。”侯安都聞言大笑。
大宴畢，侯安都借著酒勁，又向皇帝說要借用禦用帳飲器具，轉天想把全家老小都帶來也擺他數桌歡飲一次。“世祖雖許其請，甚不懌”。果然，侯安都第一天滿載妻妾家小，自己坐在禦座上，其文武賓客坐在群臣位上，“稱觴上壽”。陳文帝聞報，更是殺心欲起。
其實，侯安都也就是恃功驕傲，倚老賣老，沒有任何不忠之心或篡位的企圖。重雲殿大火，他自己親率甲士帶甲仗劍入衛，指揮救火，對於老陳家尤其是陳文帝一直忠勇不二，但這種帶兵入宮之舉更使陳文帝“甚惡之”，認定他有篡謀之心。中書舍人蔡景曆(為陳武帝做大蠟棺材那位爺)揣知上意，便密奏侯安都要謀反。陳文帝便下詔征侯安都為江州刺史、征南大將軍，令他從京口還建康受命。
侯安都沒什麼戒備，率大批文武從官入城。陳文帝親自在嘉德殿“私宴”侯安都，剛喝一杯酒，衛士衝入，把侯大將軍五花大綁捆了起來。同時，禦林軍又盡奪侯安都屬下將校的兵杖和兵權。轉天，陳文帝“賜死”侯安都，時年四十四。
雖下詔稱侯安都“驕暴滋甚、密懷異圖”要謀反，陳文帝也覺虧心，未忍對侯家加以連坐族誅，“宥其妻口家小，葬以士禮”。估計縊死侯安都之前，陳文帝與他也見過麵，兩人哭訴談心，侯安都才明悟“功高不賞”的古訓，可見，功高權重，根本就不是什麼好事。侯安都並非是那種隻知打打殺殺的粗蠻武將，知書達理，竟也不知韜晦之計，沒事總讓皇帝下不了台，身死家存，還算不幸中的萬幸。陳霸先有知人之明，登基之際，品評諸將，就曾這樣說過侯安都:“侯郎傲狠而無厭，輕佻而肆誌，並非全身之道。”此言果驗!
陳文帝在位七年，於天康元年(566)四月崩殂，諡曰文皇帝，廟號世祖。史稱，陳文帝“起自艱難，知百姓疾苦。國家資用，務從儉約……妙識真偽，下不容奸，人知自勵矣”。觀其在位所為，確實是個不差的皇帝。