眾位可能有個疑惑，在朱元璋、陳友諒、張士誠殊死搏鬥的時候，元政府去哪裏了？為什麼不借此良機，把這些起義軍一舉殲滅？
這些人打得那麼熱鬧，元政府軍在幹什麼？元政府軍這時候，竟然當起了看客，靜坐釣魚台，坐山觀虎鬥！
元政府可能想得很美，等他們打完了，兩敗俱傷，坐收漁翁之利！但朱元璋，在這場曆盡艱辛，充滿驚險刺激的爭鬥中，真正的壯大了力量，曆練了膽識！
當朱元璋馳騁江南的時候，大局基本上已定。朱元璋勝出，似乎沒有了懸念！
這時候，元政府也開始行動了。派人給朱元璋，送了無數金銀財寶，派戶部尚書，親自來給朱元璋送官。
但此時的朱元璋，謀士如雲，精兵強將，在打敗陳友諒和張士誠後，在武器配置方麵，又高了幾個檔次。他的目標是天下，所以對官位、金銀他都不感興趣。
手下的謀士們，幫他想出了一個口號“驅除胡虜，恢複中華！”這個口號在當時，煽動性非常強，因為他道出了千千萬萬漢族人的心聲，這句話，在心裏憋了一百多年了。
我們知道，13世紀初，蒙古族強大起來。這個騎在馬背上的民族非常的殘忍，他們有個愛好，就是屠殺，所以屠城是經常的事。
蒙古族的高官們，對博大精深的漢文化，采取排斥的態度，建國後，科舉停了三年才恢複。在民族關係上，采取民族歧視政策，作為第四等的南人，是毫無地位，任人宰割的。所以土地被蒙古貴族搶占，是常有的事。正是這種盲目的自大，讓元朝的統治者自斷了生路。
這種民族積怨，在今天，終於找到了突破口，就是“驅除胡虜，恢複中華！”口號一出，天下雲湧，一呼百應！換句話說，朱元璋征討元政府，是有群眾基礎的！朱元璋打出了旗幟，為了大漢族而戰！所以這一次的征討，師出有名！
1367年10月，朱元璋發布命令，徐達、常遇春奉命北上討伐元政府。
朱元璋沒有選擇直接攻打大都，而是把目標首先定在了山東和河南。
北上的朱元璋軍隊，一路披荊斬棘，三個月時間，打下了整個山東，然後轉戰河南。
1368年，朱元璋在應天府，當上了皇帝，建立大明帝國，年號為洪武。
當然，朱元璋當皇帝，不是自己主動要求的，是順應了民心，大臣們給他上演了個新時代的“黃袍加身”，朱元璋就勉為其難的當上了皇帝。史書都這麼記載的，當然我們知道這是朱元璋上演的迷惑人把戲。
至此，一個新的明王朝誕生。中國曆史上，總是上演著差不多的故事，當舊的王朝腐敗不看的時候，就會趕走一個舊皇帝，迎來一個新皇帝。這次，也不例外，新皇帝來了，但舊皇帝的勢力還沒清除幹淨。
下一步目標，需要清理元政府的殘餘勢力。成功收複山東和河南之後，徐達、常遇春接到朱元璋的命令，揮師北上，直取大都。
當時的皇帝，元順帝，聽說明軍打過來了，帶著自己的妃嬪家眷逃離了大都。
這是上策，大勢已去，走為上計！
元朝皇帝一路北上逃跑，徐達、常遇春一路追擊。順道拿下了山西、陝西等地。北方的大部分地區，都處在新王朝的統治之下了。但是朱元璋，並沒有打算放過這個舊王朝，要將它全部消滅掉。趕盡殺絕，斬草除根，這是一個新王朝對待舊王朝的常用手段。
1369年，常遇春奉命攻打上都，元順帝在這裏建了北元政權。僅用一個月的時間，這員猛將就擊垮了元政府軍的二十幾條防線，一路勢如破竹。勝利屬於大明帝國，常遇春贏了，但就在這一年，常遇春在回朝的路上卻病死了。常遇春之死，對朱元璋來說，這是一筆莫大的損失。
徐達這時候已經打到了甘肅，在蘭州和王保保決戰。徐達深夜突襲，王保保戰敗逃跑了。
結果是元軍大敗，王保保全軍覆沒，帶著家眷一路跑到和林，元順帝已經被俘，隻剩下元順帝的兒子逃了出來，找到王保保，倆人在一起痛哭了一場。然後收拾行囊，準備東山再起。至此，蒙古族，一個馬背上的民族，在中原的統治結束了。
後續，朱元璋派遣他的大軍，一路追擊王保保和元順帝的兒子。從山西、甘肅，一路打到蒙古，元軍殘餘部隊節節敗退，倉皇逃竄。
但小股的抵抗勢力還是存在的，就這樣，一直斷斷續續的進行了十幾年，才徹底消滅了元朝的殘餘勢力和地方的割據政權。