時光荏苒，少年偵探團在越發平靜的生活中長大了。
帝丹國中的教室外，溫暖的陽光透過教室的玻璃灑在少年少女的身上。老師在講台上用認真的語氣講著課，多年以前那一段和柯南一起經曆的那段總是驚心動魄卻充實有趣的時光，好像已經成了很遙遠的事。
他們五個人順利從帝丹小學畢業，升上了帝丹國中。時間的流逝並沒有改變他們五個之間的友誼，他們也經常會和柯南通話，隻是間隔變得越來越長。
時間和距離總能衝刷掉很多東西。對於他們而言，幾個孩子再舍不得柯南，他也已經遠在大洋彼岸，與他們有著截然不同的生活方式，更不用說柯南的經曆本就是編造出來的，好像一張一戳就破的薄紙。
他們之間的通話內容一次比一次單薄，哪怕少年偵探團總是嘰嘰喳喳地同他分享經曆，哪怕柯南總是能記得每一次通話內容，關心地詢問他們進展。
再加上隨著年紀漸長，男孩們都迎來了變聲期，令人煩惱的是，工藤新一的變聲期並沒有儲存自己國中時變聲期的聲音，這也導致柯南隻能想方設法地減少通話時間，以免露出破綻。
時光的腳步匆匆而過，當年氣焰囂張的組織也逐漸被曆史的塵土掩埋。組織的餘黨經過多年的圍剿，也已經幾近消失殆盡。
再一次幫助公安抓獲組織潛逃人員，並幾乎確定自身的安全之後，工藤新一又開始認真考慮一個問題——是否要將自己就是柯南的事情跟少年偵探團坦白。
他不願意少年偵探團失去柯南這個朋友，眼下如果要將這段關係延續下去，或許坦白才是最好的方式。
當然還有小蘭。工藤新一這樣想道。哪怕這幾年自己在她麵前又露出了一些馬腳引起她的懷疑，到最後，毛利蘭幾乎是以最大的包容放過了對真相的刨根問底，隻是選擇牽起身邊這個名偵探的手。
他們之間幾乎有了對真相的默契，但工藤新一明白自己依舊欠毛利蘭一個真正的解釋——對那一年到底發生了什麼的解釋。
也許是時候了。望著窗外一碧如洗的藍圖，工藤新一輕輕吐了一口氣。
下課之後，國中的教室裏亂哄哄的。
少年偵探團的五個孩子依舊幸運地在一個班。
圓穀光彥已經長成了少年模樣，與同齡人相比成熟穩重的性格、廣博的知識麵和熱心腸讓他被許多同學信賴，成功在開學不久被選為班長。
小島元太依舊熱愛美食，體重隨著年紀有所增長，不過到底是青春期，攝入多消耗也大，還有灰原哀在一旁的監督，好歹還在正常範圍內，不會影響健康。
安室優性格安靜，但因為自己的能力幾乎不會被班上的同學討厭。不過他總是和其他人保持著距離，隻同少年偵探團的幾位維持著親密關係。
兩個女生都出落得漂亮極了。吉田步美陽光開朗，還樂於助人，是班上最受歡迎的人。灰原哀則保持著冷靜淡漠的性子，成為班級中最有距離感的同學。
國中的課業壓力相比小學一下子增長不少。