由於天幕覆蓋範圍有限，隻能保障60億人的安全，而當時地球上人數有90億，其中35億人由於超強紫外線的照射而患絕病症，地球聯盟命令人類聯軍對其實施清除，曆時六年四個月，35億人全部清除。
此項計劃，引起了35億人的強烈不滿，他們成立了自護軍，來反抗人類聯軍對他們的屠殺。而他們的軍隊，隻有一些公元時期的火藥槍支和患病的普通人，而人類聯軍成員全都穿著機械外骨骼，裝配高能激光武器，還有許多機器軍人。
自護軍的子彈打在他們的金屬外衣上頂多隻是掉點漆而已，而且機械外骨骼還可以給他們提供近乎無窮的力量。實力如此懸殊，往往一個人類聯軍成員就能對抗數千自護軍。
清除計劃結束，人類聯軍無一傷亡。
亞聯地區自護軍是最多的，共有17億人，盡管部分患者未加入自護軍，但是隻要是被大數據篩查出患絕症的目標，全部歸為自護軍，由於人類聯軍都是其他聯盟調來的，再加上人工智能的監視，隻要目標被篩出來，就一定會被清除。
所謂“清除”而不是“槍決”，是由於高能激光武器是由聚變產生能量而發出高能激光束，高能激光束接觸人體時不會穿透人體，而是將能量聚在一起，形成一個極微小的核彈，使人體瞬間汽化，像楚羽飛他們一樣。這個過程是瞬間的，沒有任何痛苦，這可能也是唯一能夠為這 35億人做的好事吧。
太陽能量大爆發時，於毅已經斷絕和外界的聯係，他隻是覺得白天的陽光更強烈，皮膚都曬起皮了。直到洪水到來時，於耀開著一艘不知道哪裏來的小船，和他大伯一起找他。洪水把一切都衝沒了，包括楚羽飛的墳。
夜晚，他躺在船上，看看星空，還是那麼的靜謐，除了馬達和水流的聲響。
一個月後，洪水逐漸退去，沿海大堤也開始建造。地球的氣溫有還在持續升高。
於耀最先被檢查出來患皮膚癌，就一直住在醫院中治療，於毅和大伯便住在於毅家。
他們白天一直在爭奪聯盟發放的救災物資，維持著基本生活，晚上原本繁華的城市也黯 淡下來，星夜依舊，清晰可見，這應是在這災難之中，對於毅最大的安慰吧。
患皮膚病的人漸漸增多，於耀的病情不太嚴重，便讓他出院了。於耀，於光，於毅他們兩代三人，成了彼此的依靠。
沿海大堤建成後，洪水已經完全消失，但氣溫已高達50多度，城市裏街上幾乎沒有人，全都在家，雖然有空調，但是有的空調因外機溫度過高而起火，仍然死了許多人。
在這幾個月內，於毅在家中，他意識到人類的未來自已經不長了，毀滅即將到來，於是他便開始寫回憶錄，寫他的童年經曆、校園生活、研究過程以及和楚羽飛的生活點滴。將這些全部寫成書，算是當作紀念吧。書名是《毀滅前的美好》。
寫完後，他將書的內容轉化為電子檔，儲存在了他的個人信息檔案庫裏麵。隨著三項計劃的啟動，於耀三人也成為了被清除目標，他們都患上了皮膚癌。
城市一半以上的人都患了皮膚癌，都被列為被清除目標。 一開始人們對清除任務不以為然，一切照常進行。
直到有一天，六個穿著鐵甲的人和二十個機器人的到來，打破了這份正常。先是二十個機器人封鎖了城市各個重要的出口，六個人對這個人口三十萬的城市進行了一個月的屠殺，當他們走後，隻剩下了十三萬人。