轉眼到了1938年的元旦,在這喜慶的日子裏,林芷卻高興不起來。林芷多次通過八路軍總部向重慶反應,要求撤離南京市民,可恨的是重慶方麵置若不理,南京還是如曆史一般遭受劫難。大屠殺的消息開始傳播開來,林芷惱怒異常,把手底下的七個野戰團撒了出去,林芷的要求就是以營連為單位,目的隻有一個,殺小鬼子。一時間,晉察冀三省鬧得熱火朝天,大量零星的據點被林芷拔掉,香月清司焦頭爛額。
這天,林芷率守備團和軍區的領導班子來到倒馬關迎接呂正操和他的冀中人民自衛軍。呂正操於1937年1月起任東北軍六九一團團長,5月加入中國共產黨,10月率部脫離國民黨53軍,成立冀中自衛軍,初創冀中平原根據地。12月初,隨著晉察冀軍區的成立,呂正操劃歸林芷編下,呂正操正在按林芷的命令率部來五台山地區換裝整編。中午時分,雙方正式會麵,呂正操立正敬禮:“報告林司令員,呂正操率冀中自衛軍奉命歸建。冀中自衛軍實有人數3215人,全員到齊。”林芷等人回禮,林芷說:“呂司令員辛苦一路辛苦!但時間緊急,我也就不客氣了!冀中自衛軍需要馬上進行整訓,還得呂司令員多操勞。”
冀中自衛軍很快被改編為晉察冀軍區新八團,由呂正操擔任團長,劉興元(開國中將,1937年11月任五台山根據地政治部主任)任政委,方國華(開國少將,抗日軍政大學學員,正在晉察冀軍區實習)任副團長。新八團整訓練期間,由新二團馳援冀中根據地。
呂正操很快就被震住了,原來以為依他東北講武堂優秀生的身份,再加上帶兵多年,冀中人民自衛軍的前身又是東北軍的主力團,他的部隊可以算是八路軍中很有戰鬥力的。接下來林芷的動作讓呂正操的自信心倍受打擊,新八團先是換裝,遼造十三年式步槍(和漢陽造通用)被中正式步槍代替,每個班兩枝湯姆遜一挺輕機槍的標配,被充火炮營和營屬火炮,按呂正操自己估計,現在新八團的火力和鬼子一個聯隊相比,隻強不弱。接著是號稱守備團的部隊對其進行軍事技戰術的訓練,看到守備團過硬的技戰術,呂正操真心服了,連守備隊都有如此的水平,那軍區其餘的七個主力團的戰鬥力可想而知!其實這是呂正操的誤解,林芷創建的守備團不光是執行根據地的警戒任務,還承擔著教導隊的作用,根據地的新兵都是由守備團進行訓練的,守備團的戰士乃至班排長都是有戰鬥經驗的老兵,而且經常和主力團互相輪換中基層指戰員。
1938年1月8日周副主席發表《怎樣進行持久抗戰》一文,指出隻有堅持持久抗戰,才能爭取最後勝利,並提出爭取持久抗戰最後勝利的8項具體辦法:1、鞏固前線;2、建設新軍備;3、建立軍事工業;4、發展敵占區的廣大遊擊戰爭;5、進行廣泛征募兵役運動;6、鞏固後方;7、加強國防機構;8、運用國際有利條件。周副主席點名表揚林芷率領的晉察冀軍區,稱晉察冀根據地為“模範根據地”,號召全黨全軍向晉察冀根據地學習。