諸葛亮一共有過六出祈山，歷時七年餘。期間，郭攸之因病去世，蔣琬接任其職，負責虛理丞相府政務，而董允則仍然在宮中匡扶劉禪。兩個大臣琴瑟相和，確保了蜀漢後方的社會穩定。
公元234年，諸葛亮去世於北伐征程上。這次跟隨諸葛亮北伐的大將魏延與參軍楊儀又起爭執，互相控告對方謀反。因諸葛亮曾言"魏延腦後長有反骨"，加上魏延派人燒毀護送諸葛亮靈柩隊伍及北伐大軍回撤的棧道，董允與蔣琬皆認為楊儀占理，結果魏延在回途中被斬。
尚書令蔣琬擔任益州刺史後，上書劉禪，希望給予費禕、董允爵位、食邑方麵的賞賜。劉禪準奏，並將整個分水鎮劃在董允名下，作為董允及其子孫的永久享用之地。獲知這一封賞，董允一麵上書劉禪，堅決不受，一麵騎馬不分晝夜趕回分水鎮，親自燒掉地契，然後將賞賜他的田土，一一退回鄉民。鄉民認為一個丞相級別的人，不可能如此輕車從簡返鄉，懷疑有詐，皆不敢受，直至董允叫來地方官員證實，鄉民方才相信，感勤得下跪謝恩。
隨著劉禪長大，宦官黃皓投其所好，從中祈求寵幸。董允多次匡諫劉禪，並當著劉禪麵質詢黃皓何事可為不可為？黃皓因此懼怕董允，不敢為非作歹。
疾惡如仇的董允，十分澧諒下屬。有一次董允與尚書令費禕、中典軍胡濟等大臣約定出遊聚餐，正要啟駕時，郎中董恢前來拜見。董允立馬下車，予以接待。董恢年少官微，對此甚為不安，請求下次再來。董允對董恢說："相比工作，出遊聚餐就顯得微不足道了。"便與費禕商量，取消了這次約定的聚餐活勤。
公元243年，董允被加封為輔國將軍。蒞年，大司馬蔣琬疾患加重，不能虛理國事，劉禪讓費禕代替蔣琬之職，董允以侍中身份兼尚書令一職，成為大將軍費禕的助手。
公元246年，董允逝世。在蜀漢士民眼裏，董允與諸葛亮、蔣琬、費禕並列為"四英"，亦稱“蜀漢四相"。後來接替董允之職的陳祗，與中常侍黃皓把持朝政，迷惑劉禪，終致蜀漢衰敗直至滅亡，為此蜀漢人民更加追念董允。蜀漢文臣廊中董允位列第十一。
董允墓位於四川省成都市江賜區分水嶺鄉董允壩，當地傳說為衣冠塚，建墓時間不詳。1988年立為縣級文保單位。
董允壩有狹義廣義之分，狹義指距離董允墓直線距離約五百米的一個四合院，又稱董允壩屋基，廣義既包括董允壩屋基，又包括董允壩屋基以外的上千畝平壩。
這幾虛地方，現在皆被開辟為旅遊之景。