所以，吳三桂在穩定朝鮮大局之後，挾天子以令諸侯頒布的第一條命令就是修訂朝鮮的曆史，從根源上考訂朝鮮族與漢民族是同一祖先，為日後將這一民族徹底並入漢族打下基礎，同時，吳三桂還在朝鮮境內興建書院，教授儒法墨各家的經典。
眼下由於缺乏人才，所以隻能暫時啟用原先朝鮮水師的班底來興建海軍，好在黃龍肯幫忙，雖然沒有親自前來，卻派遣了他的心腹親衛數十人前來。
等到鴨綠江的江水進入枯水期的時候，已經是崇禎四年的十一月了，幹枯的江水很快就結了厚厚的一層冰。
朝鮮的情況終於傳到了皇太極的耳中。雖然他早就已經有了心理準備，因為畢竟這麼久都沒有他們的消息，可是在確認豪格和鼇拜全軍覆滅的消息之後，皇太極還是當場狂噴一口鮮血，鼻子和眼中都溢出血來，足足昏迷了三天兩夜才清醒過來。
而皇太極醒來之後，首先要麵對的卻是揮師東歸的阿濟格和多爾袞兄弟，在阿濟格和多爾袞兄弟的大軍壓境之下，知道大勢已去的皇太極不想女真人陷入分裂之中，所以答應自動退位，由多爾袞即位為大金汗國的天命可汗。
多爾袞改元崇德，尊皇太極為太上皇，並冊封阿濟格和亡弟多鐸為親王，同時冊封在朝鮮役沒的豪格、鼇拜、郎實達等諸將。
多爾袞先是派出使者向朝鮮的破虜軍求和，吳三桂鑒於破虜軍損失慘重，而義勇軍尚屬草創，百廢待興，急需休養生息，所以同意了多爾袞的求和。
有鑒於此，多爾袞立即詔令阿濟格和索尼率三萬大軍西征察哈爾蒙古，以迅雷不及掩耳之勢，一舉將林丹汗打的向西逃竄，一路逃竄到青海湖，而察哈爾本部的烏珠穆沁、蘇尼特、浩齊特等部都被迫向建虜投降。
建虜通過這一戰再次確定了建虜在草原上的強大，抵消了建虜在朝鮮這場打敗所帶來的負麵影響，使得那些對建虜持觀望態度的蒙古各部重新回歸了建虜的懷抱。科爾沁蒙古博爾濟吉特家族台吉寨桑把自己最心疼的女兒海蘭珠嫁給了多爾袞。
建虜從察哈爾蒙古劫掠了大量的奴隸人口和牛羊馬匹，實力大增，大金汗國國內的危機得以暫時緩和。
不過，接連的大戰之後，一時之間建虜也沒有餘力反攻朝鮮，所以，多爾袞也開始積蓄實力，以圖一舉滅掉破虜軍，他開始派人前去和荷蘭人以及葡萄牙人接觸，想購買火槍火炮，以對抗破虜軍的地雷和震天雷。
禪位之後的皇太極，心憂不已，在崇禎四年十二月二十四日鬱鬱而終，享年才四十歲。多爾袞以國家危難為由，為皇太極舉行了簡樸的葬禮。