告各位讀者：因為各種原因，不得不放棄對《祖尊》的後續創作，現將後續的大綱上傳。敬請各位讀者諒解。
道門借助修士議院的力量開始對魔門弟子進行清洗，雖然祖界地域廣闊，還有無數的小世界，但以修士議院的力量進行搜查，也是無所遁形。
魔門開始展開反擊，把重點放在了道門。道門十脈均遭受重創，其中以蜀山和昆侖受創最重，如果不是魯樸子念在當年的感情，救了蜀山一次，隻怕蜀山都有可能被滅。
接著佛國光明神殿均受到攻擊。黑暗神殿也被魔門控製。就在此時三千世界主啟，無數修士進入到祖界。祖界的勢力範圍重新劃分。
他了解到祖界的情況之後，百族聯盟全部加入修士議院。魔門也設立了黑暗聯盟。戰爭在西方開啟。祖界頓時全部陷入到了戰爭當中。
伏瑞卻命令真陽仙宗蜀國和幽冥靜觀其變，繼續提升實力。西方力量全麵收縮到了極西小鎮之中。東方則以幽冥島和蜀國蒙山為基地。
從三千世界之中1出來的修士全部武裝起來，實力快速地恢複並還大幅提升。祖界在一場場的大戰之中，變得滿目瘡痍。
就在此時，天命之爭開啟。修士議庭和黑暗聯盟進入遠古戰場。伏瑞並沒有馬上進入，而是啟動了計劃，幽冥所伏下的暗棋全部啟動，在祖界全麵推行大同世界理念。
一個覆蓋整個祖界的祖朝建立，一個涉及到整個祖界的修士議院建立。在完整的律法製度下，強行推動起來。
遠古戰場中，黑暗聯盟與修仙議院不相上下，進入膠著狀態。九黎和紅蓮聖國則保持中立。甚至紅蓮聖教還與九黎結成同盟，形成第三大勢力。
等伏瑞架構好祖界的內政結構之後。率領著近三億的修士大軍進入遠古戰場。就在伏瑞進入戰場之後，魔門高層接連被暗殺。魔門勢力崩潰，除一部分被修士議院剿殺之外，很多魔門弟子被九黎收容。
修士議院向姚霖施壓，要他交出收容的魔門弟子。姚霖提出伏瑞的大同世界理念，以駁斥修士議院。伏瑞不得不站出來。
魔門弟子對姚霖更加忠誠，對伏瑞感恩。各方勢力隻好罷戰，然後進入天命之地。九州鼎原來是開啟天命之地的鑰匙。
天命之地被打開，卻發現其中已經被魔氣汙染。天命之爭不了了之，司徒煥差一點崩潰。道門從中挑拔，修士議院對九黎發起進攻。
九黎與紅蓮聖國聯手應戰，伏瑞仍然兩不相幫。收容了魔門弟子的九黎今非昔比，擁有與修士議院抗衡的實力。
在大戰之時，那戰陸上出現的詭異情況再一次出現。伏瑞找到司徒煥，講了三千世界中戰陸的情況，再一次說明天道已經變了。
但司徒煥不為所動，一心一意要剿滅魔門及魔門弟子。雙方打得天昏地暗，數以十億計的修士戰死沙場。
伏瑞則守在天命之地，研究天命之地發生異變的原因。發現這一切都源自戰陸上的那塊巨大的混沌石。
隨著死亡的人越來越多，這方天地也變得越來越詭異。伏瑞公布了他研究的結果，雙方這才罷戰。誰知道門又從中生事，修士議院反過來針對伏瑞。司徒煥與伏瑞斷絕師徒關係。
這是當年真陽仙宗的敵人所為，見真陽仙宗勢大，隻能借助修士議院來對付伏瑞，從而達到奪取洪疇手中仙爐的目的。
修士議院之中的大周係和大周係修士和軍隊全部投入到伏瑞的麾下，在交戰之中，諸勝與伏瑞相認，也轉而追隨伏瑞。
九黎突然對修士議院發起襲擊，修士議院失敗。司徒煥與魯達鵬下落不明，熠馨戰死，雷建木護著一些道門弟子遠遠避開戰場，儒門佛門等勢力也退出修士議院，修士議院從此解散。九黎轉而開始針對伏瑞。姚霖之母把所有事情經過詳細地告訴了姚霖。