當時齊泰、徐輝祖（朱棣妻弟）等大臣都建議將朱高煦兄弟扣留在南京。
但朱允炆為了麻痹朱棣 ，最終還是將他們遣返歸國。
朱高煦臨行時盜走徐輝祖心愛的寶馬，還在沿途擊殺驛丞，以最快的速度回到了北平（治今北京），但這也成為後來朝廷指控朱棣的一大罪狀。
不久，朱棣以“靖難”為名，在北平正式舉兵。
朱高熾留守北平，朱高煦則在外征戰，常充前鋒。
建文二年（1400年），朱高煦參加了白溝河之戰。
當時戰況異常慘烈，朱棣連換了三匹戰馬，射光了三筒箭，手中的寶劍也被砍斷，險被南軍（即朝廷軍隊）大將平安、瞿能所傷。
朱高煦在危急之際率數千精銳騎兵來援，與朱棣合兵一處，大敗南軍，陣斬瞿能父子。
是年十二月，燕軍在東昌（治今山東聊城）戰敗，大將張玉戰死。
朱棣雖奮力衝出重圍，但遭到了南軍的追擊，被“擊殺者無數”。
朱高煦在關鍵時刻率部趕至，擒獲敵將數人，擊退了南軍，這才保護著朱棣安全撤離了戰場。
建文四年（1402年），燕軍攻至長江北岸，準備自浦子口（在今江蘇南京西北）渡江，遭到了南軍的頑強抵抗。
朱棣因戰事不利，甚至打算議和北還。朱高煦此時引兵來援，率眾殊死力戰，終於扭轉了敗局。
朱棣隨後率大軍渡過了長江，很快便攻入南京，在群臣擁戴下即位稱帝，史稱明成祖。
朱高煦成為了皇子。他因在靖難戰場上屢立戰功，多次救朱棣於危難，被朱棣認為“類己”，頗以此而自負，且又恃功驕恣，因此多有不法之行，後來，朱高煦又被派回了北平（後改稱北京）。
明史評價“成祖屢瀕於危而轉敗為功者，高煦力為多”。
“果然是朱高煦啊，雖說朱高熾也是極好的，不過嘛論及行軍打仗還得是朱高煦，而且這一世沒有了皇位，這朱高煦必然可以脫胎換骨！”王晨笑道。
沒有了朱棣的那句：“世子多病汝當勉勵之！”蠱惑，朱高煦就是一位純粹的軍中統帥了。
隻不過朱高煦的戰績嘛，記載的倒時不算多，不過朱高煦可以統率指揮張玉、朱能、陳亨、丘福等同時期的名將，就已經說可以這小子的能力了。
【叮咚，係統檢測到羈絆五龍同朝激活：朱元璋、朱棣、朱瞻基同處在一個朝代時，全屬性均提升5點。
如朱元璋、朱允炆、朱棣、朱高熾、朱瞻基同處在一個朝代時，朱元璋、朱棣、朱瞻基全屬性額外提升5點，朱高熾智力值提升7點，政治值提升7點，朱允炆智力值提升5點，政治值下降5點！】
王晨看著這個新出現的羈絆倒是沉默了，好家夥你們一家子都加屬性了，就是朱允炆好像是加了吧，但又好像沒有加。
提升了智力值，降低了政治值，這就相當於是提升了你逃跑的能力，同時降低了治國的能力，雞肋啊雞肋。