再加上太平天國優待投降者的傳聞，江戶幕府投降自然也就順理成章。
不過，即便做好了投降準備，江戶幕府仍然是主戰派占據優勢言論，沒人願意當漢人的奴仆！
因此，江戶城在得知太平軍艦隊南下後，在江戶一帶聚集了幕府超過八成的正規軍，幾萬足輕和武士以及各地大名帶來的勤王援兵，聚集在江戶這片地區。
然後，在太平軍鐵甲艦的炮擊下，煙消雲散……
被江戶幕府寄予厚望的數萬大軍，連太平軍的艦炮齊射都扛不住，這還打個屁啊！
當太平軍先鋒部隊入城時，最後一夥主戰派武士，聚集了所有願意上場的勇士，發動了一波英勇的襲擊，這是主戰派跟幕府大將軍定下的約定，如果他們能將太平軍趕出江戶城，戰爭就會繼續打下去，如果不能，幕府大將軍就會帶著求和派一起投降太平天國！
答案是顯而易見的，當幕府大將軍聽到了幾百名戰力高強的武士不到十分鍾時間被屠戮殆盡後，更加堅定了投降的念想。
幾萬人被太平軍鐵甲艦艦炮齊射轟擊的土崩瓦解，江戶城連區區數百名太平軍都擋不住，這種戰爭還有繼續下去的必要麼？
有時候，日本人的骨子硬的可怕，但當日本人意識到敵人強大到無法匹敵後，會瞬間變成一條溫順的哈士奇……
就這樣，出現了日本幕府大將軍帶著一群家老投降的一幕。
負責征伐日本島的太平軍指揮官得到江戶幕府投降的消息後，非常高興，迅速接納了江戶幕府的投降，並以他們的名義募集了一批日本足輕潰兵和浪人武士，組成了兵進日本島的先鋒炮灰。
江戶幕府雖然投降了，但日本島上有大量獨立自主的大名封建主，這些人可不會一股腦的投降太平軍。
果不其然，太平軍接下來的進展並沒有想象中那麼順利，日本江戶幕府一投降，在京都作為吉祥物的日本天皇頓時如同吃了大藥一般，發表了一連串誓死抵抗的‘聖旨’，大肆拉攏不願意被漢人奴役的地方大名和那些頑抗的武士。
占據了大和民族獨立自主大義名分的日本天皇，屬實收攏了一把權勢，甚至有隱隱將江戶幕府取而代之的意思！
日本島上的不少大名就是一群土包子，對外界的信息來源十分匱乏，與江戶幕府完全沒有可比性，所以他們根本不了解太平軍的強大，自然而然的，抵抗的十分起勁。
隻可惜，日本天皇大權在握的享受不到一年時間，就被太平軍組建的幕府傀儡軍團打到了京都……
此時，幕府傀儡兵團的各類足輕已經超過萬人，絕大多數都裝備著日本人自己的鐵炮（不帶火繩的那種更新版），至於支持天皇的日本地方大名，被車飛了三分之二，剩下三分之一基本上都投降了……
日本天皇本來也想投降的，隻是太平軍有了幕府這個鐵杆日奸，已經不需要一無是處的日本天皇了，所以，天皇必須死！