隨著對朝廷上下對和議達成共識，推進的速度也在加快，而臨安與大都間的蒙元信使往來也日益頻繁。真金原則上同意割讓四川行省，以換取宋軍退出南陽及放棄索要開封的要求。至於要求釋放被擄往北方的德祐帝及宗親、大臣和工匠一事，蒙元方麵也做出了妥協，針對德祐帝和太後已經出家，宗親接受蒙元敕封，臣僚入職蒙元，且當年被擄往北方的匠人、伎人、宮女等已經婚配安家，他們提出以自願遣返的方式來解決。
趙昺對於這個提議有些為難，也覺得好笑。蒙元所言可以說是現實存在的問題，那些投元的臣僚肯定不敢回來，擔心被誅殺；而那些匠人、宮人等早已被賞賜給功臣或是安排到工坊中，已然是身不由己，去留不取決於自己。而己方又沒有準確的人數和名單，索要也缺乏證據，人家說死了、逃了，甚至隱匿起來，也無處查找。
堂議之上，眾臣也覺得此項缺乏可操作性，但是對於德祐帝及宗室不願回歸者，必須要求本人出具不願歸國的字據。涉及的臣僚也要發布自己不願歸國的聲明，同時蒙元方麵要在被擄者集中的地區發布通告，告知他們可以返回江南。
對於雙方的相互稱呼問題，趙昺也沒有多做糾纏，他不在乎什麼所謂‘父子之國’、‘兄弟之國’，以為在這種問題上浪費時間沒有必要，隻要你國力強盛，其自然會對你避讓三分，尊重有加，那些虛名沒有任何實質性的意義，隻會增加道義上的負擔。
而對於戰爭賠償問題，則進行了好一番討價還價，這不僅是因為趙昺愛財，也涉及到削弱蒙元的國力，打擊其戰爭潛力，同時還可以借此增加其內部的矛盾。因此大宋咬定賠償黃金十萬兩，白銀二百萬兩，另外就是歸還當年被搶走的圖書賬冊及宗室玉牒及曆代皇帝禦容圖。
賠償數目看似與當年金朝索要的五百萬兩黃金看似懸殊，其實即便是北宋最好的時期，年產黃金也不足八千兩，所以金朝的索賠就是瞎扯，宋朝皇室全家都賠上了，也真沒五百萬兩黃金。因而這個數目是比較客觀的，也是蒙元咬咬牙能夠湊齊的。
主要問題雙方達成共識後，至於開立榷場，交換戰俘及進貢戰馬、牛羊等問題就顯得不那麼重要了，可以在確定原則後，事後再詳談。在十一月十五日的朝會上，趙昺終於在詔書上落了玉璽，雙方在輿圖上劃定了邊界，同時送上賠償，和議之事基本落定。
但是下來涉及到具體落實的問題，為了能夠確保蒙元不會反悔，蒙元和議使團撤離時，將鐵穆耳留下為質，待協議執行完畢後，再放其歸國，而他也隻能在大宋過年了。
與此同時，趙昺分別下詔，令主持川蜀的劉師勇加快進軍速度，接受成都等地，控製交通要地，防止蒙元裹挾百姓、劫掠財物北歸，給自己留下一座空城，重演當年徽宗皇帝收複燕雲時的尷尬事；另一方麵詔令第三軍緩緩後退，撤出南陽地區，釋放被俘的南陽王禿嚕。
改製也在同步進行，經過兩個月的論證和準備，中書省、門下省和尚書省及相應寺監的職能和人員配置皆已編製完畢，而相應的辦公場所整修和經費已亦到位。趙昺決定正式設衙，同時對官員進行調整，因為下個月就是臘月，他又要開始祭祀之旅。
臘月初一，在當年最後一個大朝會上，趙昺下詔恢複三省製度。任命陸秀夫為中書省左相，高應鬆為右相；以王應麟為門下省左相，鄧光薦為右相；以文天祥為尚書省左相，江璆為右相；以鄧文原為禦史中丞。樞密院依然由他兼任正使，以江鉦為副使、劉洙為樞密僉事。
同時趙昺對於尚書省六部尚書進行調整，陳則翁兄弟職務不變，仍分為戶部和兵部尚書；以周翔為工部尚書；謝枋得為吏部尚書；謝翱為禮部尚書；何仁德調任刑部尚書；各部屬官經堂議和廷議後再進行調整。同時宣布以應節嚴、劉黻、馬廷鸞、徐宗仁、陳仲微為祭陵使，隨王伴駕祭拜紹興諸陵。
宣布完畢，趙昺下旨通令天下。大家都知道這次調整是一次轉折點，標誌著當初行朝老一代的領軍人物榮退，新生代的官員走上了前台，朝廷執宰的新老更迭完成。同時也標明小皇帝對權力完成了全麵的接管，徹底擺脫了舊朝的影響，一個新的時代即將來臨。