從外觀和改造的難易度上來說艨艟是首選，但趙昺卻沒有選擇它。這是因為戰船是用來作戰的平台，還需要搭載武器。
在這個時期戰船交戰的方式除繼續沿用古老的接舷戰的同時，更為注重拋射武器的運用。一般情況下，雙方是隔著一定距離作戰，因而拋射武器在海戰中發揮的作用越來越大。便有了海戰中‘弓矢為上，鉤槍次之，手刀又次之’的說法。而由於火器的發展，火箭和火砲此類武器在海戰中也格外引起重視。
當然宋元時期的火箭和火砲的應用還處於最初級的階段。火箭不過是在箭矢上捆綁一個藥筒，點燃後再用弓弩發射，以增加射程。而火砲也不是現代意義的金屬身管火炮，隻是以拋石機為動力發射的火藥包。但因為此類武器既是拋射武器，又帶有火攻的性質，在殺傷敵軍的同時，又能摧毀敵船，還是受到了各方的重視。
為了能夠在海戰中取得優勢，趙昺已經‘發明’了弩炮，並用於實戰，取得了不俗的戰果。這便解決了由於沒有火炮，而又需要遠程大威力武器的問題。但弩炮比弓箭不知重了幾十倍，所需要占用的空間也大的多，操作弩炮的射手同樣要需要多人完成，顯然艨艟小巧的船身和較低載重量難以勝任。
另外龜船除了遠程武器外，還具有一項必殺技，那便是依靠船頭上的衝角撞擊敵船水線下的船體，使敵船進水沉沒。為了獲得最大的衝擊力，除了船隻要有較快的速度外，還要有較大的體量，否則撞上後，沉的不知道是誰呢？而同歸於盡也不是趙昺想要的結果。艨艟這幾項致命的缺陷使其不得不出局。
以戰船為載體進行水戰的另一個特點是：戰船必須根據戰場的具體情況隨時調整火力和兵力的配置，這就需要其具有良好的機動性能，快速分合聚散以取得戰場的主動權。相反，戰船失去機動性，則處於攻亦難攻，守也難守的境地，成為敵軍肆意攻擊的固定目標，從而失去戰場的主動權。
艨艟采用槳櫓為動力，機動靈活。但海船體量大，所以主要是靠風帆為動力，因此受氣候，主要是風力影響明顯。在順風的情況下，水軍戰船乘駛自如，可以乘風直搗敵陣，盡量利用風力的影響，化為自己的優勢。同理，要是逆風的情況下便會陷入機動困難，被動挨打的境地。而龜船是以突襲為主要戰術選擇，具有良好的機動性是必須的。顯而易見海船難以勝任。
這樣一來多槳船便成了最後的選擇，其機動性雖不如艨艟，但其船身長八丈三尺，闊兩丈，載重達八百料，可載兵士二百人，完全可以滿足搭載弩炮和兵員的要求。且其體量較大，配上衝角在撞擊中既能重創敵船，又能保證自己的安全；而多槳船顧名思義是以槳劃水驅動船隻航行，其用槳四十二隻，可以保證它能有較高的航速，有良好的機動性，改造時加裝桅帆，同樣也具有靠風航行的能力……