無名醒來，到後來有一陣頭疼，心裏想到“怎麼這麼疼”。他又暈了過去，結果有了小智的記憶，第二天早晨他聽見有一個女人在喊他：“小智，再不起來就遲到了。”他醒了過來，然後說道：“媽媽我醒了。”這個女人就是小智的母親，花子。無名，不，應該說是小智，他看了一下鬧鍾說道：“媽，快遲了。我現在就走了。”“小智等等，哎~~這孩子。”花子先急後笑著說道，“真像他的父親”。小智穿著睡衣在路上跑著，想起了虛無神給的係統他，說道：“係統，係統，你在嗎？”這時候有一個冰冷的機械聲說道：“我就是係統，想在已開啟了兌換，探查信息和抽獎的功能”小智說道：“你的聲音可以人性化一下嗎？”係統說道：“宿主可以更新係統。”小智說道：“係統更新。”然後，有一個聲音說道：“現已更新1％···現已更新完成，請宿主選擇係統精靈性別：‘女生or男生’”小智選擇了一個身行苗條，性地善良的女生來做係統精靈，並給叫她小雅。
當小智跑到大木研究所時，不小心和一個人撞上，當他看清人的樣貌時，不由自主的叫到“小茂！”這個男孩揉揉肩說：“小智你太慢了，當我的對手，竟在領神氣寶貝的這一天遲到。”小智心裏想到“就知道是這樣，還是不要理他的好！”小茂發現小智不像平時一樣反駁他，就失去了跟小智鬥嘴的興趣。並走向一邊，給小智讓開了路，讓他進大木研究所。他一進去就遇見大木博士，大木博士收：“原來是小智啊！”小智說：“大木博士我來領精靈了。”大木博士說：“由於你是最後一個來的，已經沒有初始小精靈了，不過還有一隻小精靈，不過它有一點問題。”小智說：“我就要它了。”心想，“沒有皮神的智爺還叫智爺嗎？”大木博士說：“好現在你跟我去領它吧！”小智就很大木博士走進研究所，然後大木博士給了他一個精靈球，他打開了精靈球，從中出來一個皮卡丘，大木博士說：“這隻小精靈叫做皮卡丘，是電氣係的小精靈。”小智露出子的黃金瞳看著皮卡丘，皮卡丘被這一瞪就乖乖的聽了小智的話，大木博士看見這一切就說：“小智這隻皮卡丘就交給你，對了，還有精靈球和精靈圖鑒”小智說道：“大木博士，請您幫我把精靈圖鑒升級成全國圖鑒，並附加攝像和拍照的功能行嗎？”大木博士說道：“可以”過了一會，大木博士和他一起出了研究所。全鎮人都來送他，他的母親把背包和一些必用品，給了他以後。囑咐他要照顧好自己，就目送著他和皮卡丘離開。