冬木市新都。
這座未遠川以東的住宅區，是原本在高度成長期時，對原野進行開發而建成的新城鎮。雖說當時並未規劃為那種曆史感深厚的深山城鎮，但由於政府與民眾計劃利用國有鐵路遺址建設近代商業街，冬木市正麵臨著一場大規模的再開發行動。
即將成為商業街的樓群中雖說仍有四成還未完工，但站前的公園與商場卻已是開業在即。即將建成的新都將以一種幹淨而蒼白、華麗卻又毫無個性的麵貌登場。市政府也逐漸向新都轉移，鋼筋、玻璃和塗料也組合成了各類現代建築。這座深山都市的城市機能，正逐漸地被迫改變著。
身為禦主之一，代表愛因茲貝倫出戰的衛宮切嗣隱沒在白天密集的人群中，來進入了一家便宜旅社的七樓，在那裏等待著他的是一位短發麗人，久宇舞彌，既是他的助手、也是他魔術與行事上的徒弟。
昨晚，遠阪府邸有行動。
她朝切嗣報告著昨晚發生在遠阪時臣據點，一場英靈間的戰鬥。
不，那不應該稱作戰鬥，那隻是單方麵的淩虐屠殺而已。
切嗣認真地觀看著使魔用攝像機偷拍下的影像，十三寸的屏幕中．昨夜遠阪府邸的一部分被從始至終被記錄了下來。雖然不夠清晰，但足夠使人弄清到底發生了什麼：隻見一個帶著骷髏麵具從者束手無策地被另一個黃金色的從者消滅了。
些許的情報並不足以兩人分析出更多的內幕，不過衛宮切嗣來此的目的也並非僅止於此...
華瑟WA2000型半自動狙擊槍，使用點300溫徹斯特口徑彈，有效射程可達l000米。是世界上現存最高級的也是擁有最高性能的來福槍。單價12000美元。
還有為了提高夜間視野弄來的美軍最新裝備AN／PVS04夜視鏡，以及專門為了捕捉魔術師施術時產生的體溫變化而購置的斯派克特lR熱感應夜視裝置。
除此之外還有兩把卡利柯M950**，手榴彈、震撼手榴彈、信號彈，甚至還有一捆C2**。以及那裝在紫檀木箱內的王牌，他的愛槍Contender以及能夠破壞魔術師體內魔術回路的‘起源彈’。
這些優秀的武器全部是通過愛因茲貝倫的力量非法獲取，並且運送到他手中的，是他能夠在禦主間的戰鬥中取勝的關鍵。
現代化的武器、異於魔術師們的思維方式以及冰冷的內心。這些構成了衛宮切嗣的元素同樣是他被稱作魔術師殺手的理由。
而在衛宮切嗣開始檢查裝備的同時，有兩件與他切身相關的事正在發生，其中之一是在離冬木市最近的機場，一架由德國始發的意大利的航空公司的飛機正緩緩降落在跑道上。
絲質的披肩和及膝的長靴，銀狐毛皮製的外套，怎麼看都是那種隻有在高級商場櫥窗中才能看到的服裝，愛麗絲菲爾·馮·艾因茲貝倫就穿著這樣一身扮作‘普通’遊客走下了飛機。單從姓氏上便可了解她正是聖杯戰爭禦三家中愛因茲貝倫一族的成員，同時她也是魔術師殺手衛宮切嗣的妻子。
而陪伴在他身邊的是一位穿著藏青色的裙裝襯衫和領帶，配上法式歐風黑色外套的男裝麗人。
從者saber，這個真身是被稱作亞瑟王的傳奇英雄，乃是切嗣用傳說中的寶具，亞瑟王的劍鞘所召喚出的強大英靈，身為劍之座英靈的她有著近戰絕不會輸的自信。
隻是，也許是大宇宙意誌的某種偏差，本該以男性身份活躍在曆史上的亞瑟王在這個世界卻成了一位身高僅一米五左右的名為阿爾托利亞的美麗少女。
平安地降落並未給兩人帶來一絲抵達目的地的放鬆。某種巨大的陰影似乎籠罩著身為聖杯戰爭參與者的兩人。
從準備乘飛機出行開始，原本依靠愛因茲貝倫家事先訂好的包機居然被德意誌政府給強製征用了，還是借用了愛因茲貝倫家家主阿哈德翁的人脈關係，兩人才得以乘上這架飛往島國的飛機。
接著在飛機起飛前，數十名穿著精幹，渾身散發著駭人氣息的高大保鏢護送著七八位老者搭上了這架飛機。他們完全無視了被強製安排在機艙尾部的saber與愛麗斯菲爾，就這樣走到前排坐下了，就連空乘人員似乎都被換上了他們的人。
這種陣勢讓深山城堡中的人造人，以及靈魂來自過去的騎士王都感到驚詫莫名。
但是這一點點的驚訝相比起她們所聽到的這些人的談話內容，其震撼程度可謂是天差地遠。