喜歡打《崩壞三》和《星際爭霸》的孤兒少年木空穿越了，穿越到崩壞世界遊戲中做描述的虛數空間，同時他獲得了名為崩壞係統的金手指，係統的第一AI愛醬給予了木空第一綠者的真理寶石，並向他發布了第一個任務：構築月光王座號方舟艦。同時星際爭霸世界虛無空間的薩爾娜迦埃蒙和奧魯斯被木空的崩壞能量波動所吸引，木空利用一局賭約將埃蒙和奧魯斯變成他的船員，經過八個月的時間後，木空，埃蒙和奧魯斯合夥成功將月光王座號方舟艦構築了出來，然後木空將埃蒙和奧魯斯的化身帶上艦，來到了科普魯星區。
木空開著月光王座，帶著埃蒙和奧魯斯在科普魯星區航行，在路過一顆名叫邦德瑞的星球時遇到塔達林星靈和艾爾星靈交戰，木空立刻出手救下了艾爾星靈，同時俘虜了大量的塔達林星靈，沒想到這夥艾爾星靈的首領竟是大名鼎鼎的執行官塔薩達爾，塔薩達爾對木空說，他們的一支科考隊在這附近失蹤了，而被他們俘獲的塔達林星靈說是這顆星球上的人類抓走了艾爾星靈科考隊，於是木空便決定幫助塔薩達爾他們。當木空和塔薩達爾等人來到困住艾爾星靈科考隊的人族基地時，人族基地的某項實驗品暴走，基地負責人被迫逃離，當木空等人攻占這座基地，俘虜這座基地剩下的人，救出幸存的艾爾星靈時，木空也邂逅了在這座人族基地中暴走搞破壞的實驗品，編號為p-t-28的人類星靈混合少女。木空用崩壞係統的強製艦員征招功能讓塔達林星靈，被割掉神經束的艾爾星靈以及p-t-28加入了他的月光王座。
突然埃蒙的人類化身吐出一口黑血，埃蒙在虛無空間的本體被人攻擊了。木空回到虛無空間一看，隻見薩爾那迦納魯德叛變，殺死了埃蒙的本體，將奧魯斯的本體封印，木空和納魯德一番激戰，敗，就在木空即將被納魯德殺死時，一個神秘人突然出現將木空救了下來。
木空離開虛無空間，來到奧塔裏安裂隙的烏爾納遺跡，和塔薩達爾進行聯係，塔薩達爾派了一艘偵察機去接應木空，兩天後，名為凱拉克斯的相位技師開著一架偵察機來到木空的麵前，木空上了凱拉克斯的偵查機，然後往邦德瑞開去，可是飛船折躍過程中在克哈附近被人類蒙斯克家族掌握的戰列巡航艦諾德0號警惕性攻擊，木空利用空之律者的能力和凱拉克斯一起離開超空間，來到克哈上空，但在進入克哈大氣層時與凱拉克斯失散，然後木空掉在蒙斯克家族長女多蘿西·蒙斯克的車上。
多蘿西將昏迷的木空帶回蒙斯克家宅邸，當木空從昏迷狀態清醒過來之後，先是被蒙斯克家族的家主安格斯·蒙斯克進行了一番警惕的身份驗證，當木空利用律者的能力勉強通過身份驗證之後，便以一個失憶者的身份留在了蒙斯克家宅邸成為了一個管家，然後逐漸獲得了蒙斯克一家的信任與感情。
兩個月後，安格斯在克裏斯汀議政廳舉辦了一場克哈獨立宣言演講，泰倫聯邦派出三名幽靈特工企圖刺殺蒙斯克一家，隊長是莎拉·凱瑞甘，但另外兩名幽靈特工的刺殺行動被木空所阻止，一名被凱瑞甘殺死滅口，另一名被木空活捉並被愛醬改造成女武神，將體內的靈能改造成崩壞能。木空像安格斯提議在演講時貼身保護他，安格斯允許木空以多蘿西未婚夫的身份和他一塊兒站在演講台上。
克哈獨立演講照常開始，可誰知泰倫聯邦軍竟動用攻城坦克攻擊克裏斯汀議政廳，木空隻來得及保護多蘿西·蒙斯克，安格斯·蒙斯克和凱瑟琳·蒙斯克夫婦最終還是被攻城坦克的炮彈擊中，埋在了廢墟之下，多蘿西覺醒了靈能。
木空見此場景，悲怒交加而暴走，召喚了數千頭崩壞獸以及一隻帝王級崩壞獸迦尼薩，命令崩壞獸群攻擊聯邦陸戰隊，然後便暈闕，聯邦陸戰隊在崩壞獸群的攻擊下死傷慘重，而且還被崩壞能侵蝕，變成了死士，凱瑞甘僥幸逃離。
多蘿西帶著木空逃離，期間相遇偽裝成人類的凱拉克斯，隨便找了一輛車，卻無法啟動，這時被改造成了女武神的幽靈特工出現在兩人麵前，成功啟動車輛，並開著車一路前往本內特港，乘上諾德0號逃離克哈。
然而諾德0號在太空中被聯邦上將埃德蒙·杜克所帶領的阿爾法中隊三艘聯邦戰列巡航艦諾拉德1，2，3號追上並被攻擊，就在諾德0號寡不敵眾搖搖欲墜時，木空的月光王座號方舟艦及時趕到，並利用強化的雷之律者電磁操縱能力同時剝奪了雙方戰艦的全部能源，阿爾法中隊全員被俘。
p-t-28帶領著一隊泰坦機甲來到木空的麵前，然後見到木空和多蘿西非常親密自然火冒三丈，然後在木空麵前又哭又鬧，但最終多蘿西的諾德0號船員眾還是加入了木空的月光王座號。筆者不同於黑豬總統的《帶著崩壞係統去星際爭霸》也從這裏開始。