太陽冉冉升起，經曆多瑪姆之災的人類暫時團結了起來，聯合國在這個時候，發揮出了很大的積極作用。
如今多瑪姆所造成的混亂已經逐漸平息，最終千年獸的攻擊成功將多瑪姆打成重傷。
當多瑪姆重傷的那一刻，數碼世界露出了猙獰了獠牙，世界樹成功觸及到了多瑪姆的核心, 僅僅是一瞬間，世界樹就捕捉到了黑暗維度，以世界為食的多瑪姆也成了食物，成為了數碼世界的養料。
這一下，數碼世界成為了真正意義的世界，這個世界擺脫了現實寶石, 成為了一個獨立的維度。
黑暗維度不在, 隻有數碼世界。
當黑暗維度消失的瞬間，有很多存在察覺到了這件事情，地球上最先察覺到的就是古一，她同樣也使用黑暗維度的力量，現在這股力量消失不見，她的身體再也沒有辦法依靠黑暗力量來延續生命。
古一沒有插手這件事，秦漢明也派遣了數碼世界的使者，奧米加獸。
秦漢明借助奧米加獸之口傳達了他的想法，如果古一願意，她可以和數碼世界締結契約，數碼世界可以提供能量為古一延續古一的生命。
古一拒絕了秦漢明的提議，她告訴秦漢明，斯特蘭奇依舊會成為奇異博士，所以她選擇接受自己的結局，用自己的生命換取斯特蘭奇的覺醒。
在這裏，古一也提出了一個請求，她希望數碼世界可以出現一位邪惡的數碼寶貝, 代替多瑪姆的存在，她需要一些壞蛋，這樣才能讓她獲得一個犧牲的機會。
麵對古一的要求，秦漢明同意了。
這件事不難，隻需要世界樹去製造一個數碼寶貝就可以了。
啟示錄獸就是秦漢明給古一的答複，這數碼寶貝看似強大無比，實際上戰鬥力一般，既滿足了一個邪惡的敵人，又能把事情的結局控製在地球可以接受的程度。
至於理由，古一都給秦漢明找好了，她表示數碼世界遭到了破壞，自然會有邪惡的數碼寶貝試圖來到地球。
秦漢明聽到這借口，他隻是笑了笑，順便問了問古一，要不要他幫忙把斯特蘭奇的手給打斷。
古一拒絕了，她告訴秦漢明，斯特蘭奇是必然成為法師的，就算不是斷手，也會因為其他方式成為法師。
秦漢明一看古一自己有想法，他也就不再多嘴, 而是把精力放在了係統上, 他要繼續享受陽光沙灘和比基尼美女。
日子一天一天的過, 很快洛基就從新阿斯加德回到了地球, 他在夏威夷這裏和秦漢明見了一麵。
兩人在海邊上喝了一頓酒之後，洛基回到了紐約，準備進行競選前的最後一次演說。
洛基很收歡迎，看起來有著絕對的勝率。
秦漢明雖然不知道洛基的心聲，但他卻知道洛基在新阿斯加德的故事。
托爾和杜蘭達獸雖說已經分開，不在維持合體的情況，但托爾卻在合體的狀態下和洛基說了一些事情。
托爾把洛基的身份真相告訴了洛基，他表示如果洛基真的想要當一個國王，他會讓出這個王位。
洛基直接拒絕了托爾的提議，他表示會去地球，在美國競選總統，他告訴托爾，自己當了總統之後，說不定就不會想當國王了，等到他把總統這個位置坐爛以後，他考慮去宇宙冒險。
托爾也告訴洛基，他希望能和洛基一起去冒險，但他必須要和希芙結婚，最少也要生三個孩子，其中還要有男孩，等到這些孩子長大成人，他才能去冒險。
等到托爾這樣說，洛基露出了驚訝的表情，他拍了拍托爾的肩膀，嘴裏說著恭喜，他告訴托爾，他可能永遠不能再冒險了，他會是一個合格的國王。
托爾還想說點什麼，但洛基卻表示兄弟二人來日方長，他現在想要去地球了。
托爾一想也對，就沒有挽留洛基，他親自開啟彩虹橋，把洛基送回了地球。
等到洛基離開後，托爾也解除了合體進化，讓杜蘭達獸重歸數碼寶貝形態。
杜蘭達獸暫時在新阿斯加德生活，他身份特殊，被每一個阿斯加德人尊敬。
秦漢明通過杜蘭達獸觀察著新阿斯加德，他決定召回杜蘭達獸，而且不隻是杜蘭達獸，其他數碼寶貝也要回到數碼世界。
數碼寶貝的離去也會讓他們的搭檔產生一筆情緒值，秦漢明需要更多的情緒值來抽獎，雖說經過多瑪姆之災的人類貢獻了很多的情緒值，但秦漢明不嫌棄情緒值多，所以這一比離別的情緒值秦漢明也要拿到手裏。
離別之際，眾人情緒複雜，維持著浩克狀態的班納甚至當中大哭，他抱著木偶獸，不想讓木偶獸離開。
木偶獸沒有辦法他展開了退化，在退化的光輝中，他把自己木偶獸狀態下的小紅帽留給了班納。
在這種時候，秦漢明開啟了數碼世界的大門，在眾人不舍的情緒下，數碼寶貝們回到了數碼世界。
大門關閉，秦漢明單方麵的認為應該有一股風才對。
木偶獸留下的小紅帽被高高吹起，就像是斷了線的風箏。
浩克雖然不能飛，但他跳躍力驚人，他把小紅帽重新抓到手裏，這一次他捏的很緊。
眾人看著浩克手裏的小紅帽，似乎他們的冒險隻剩下了這東西。
神聖計劃和進化徽章，這兩種道具在孵化最終千年獸的時候已經用掉，已經消失不見。
浩克拿著小紅帽，在哭泣中變回了班納。班納擦了擦眼淚，浩克的人格還是小孩子，班納的人格則是一個成年人，他雖然不舍，但也能控製住自己的情緒。
他依舊緊緊的捏著木偶獸留下的小紅帽，沉默不語。
托尼試著活躍氣氛，但效果甚微，他依舊在鋼鐵戰甲之中，隻不過這鋼鐵戰甲出現了一些變化，這鋼鐵戰甲不再是空的，而是一個實實在在的軀體。
這是秦漢明讓最終千年獸留下的東西，他製造了一個安杜路獸的軀體，他把這東西留給了托尼，他想要看看托尼會想盡辦法讓自己變回人類還是享受來自完全體數碼寶貝的強大。
托尼得到了新的軀體，但不是人類的身體，而是一個數碼寶貝的軀體，這軀體很強大，兼顧了生命和超級計算機的兩種特性，在托尼眼中，這已經不能成為戰甲了，他覺得自己現在更像是一種新的生命。
這種強大的身軀他很喜歡，但他更希望自己能成為人類，他把自己關到了實驗室裏，試圖把自己變回人類。
被選召的孩子中的其他人也各自做著自己想要做的事情，班納和未婚妻生活在巴西，兩個人平平安安，隻不過班納偶爾會拿起小紅帽來，一坐就是一個小時。
斯特蘭奇做回了醫生，因為一次醫鬧報複，他的手指被斬斷，走上了法師之路。
娜塔莎在拯救了世界後向神盾局遞交了辭呈，她定居在日本，沒有去巴西，神盾局雖然不理解，但對神盾局來說，隻要不是加入獨聯體的情報組織就可以。
但根據監視的特工回報，娜塔莎偶爾還會和鷹眼，以及公開了自己身份的新任黑寡婦見麵，以及紅色守衛和鐵娘子，根據鷹眼的彙報，紅色守衛是娜塔莎的討厭的父親，鐵娘子則是她喜歡的母親，黑寡婦葉蓮娜是她承認的妹妹。
神盾局內部震驚，下令搜集更多情報，他們找到了紅色守衛潛伏在神盾局的任務記錄，神盾局與獨聯體的情報組織在情報對抗戰中越發的激烈。
獨聯體的情報組織團結，而且高效，神盾局的特工仿聲鳥經過千辛萬苦打探到了一個名號，珀爾修斯，正是這個神秘的特工把獨聯體各國的情報機關鏈接起來，在他的努力下，克格勃仿佛又回來了。