直到三千年前，仙門玄元兩道的分歧爭端越來越大，兩道各自秉持自己的理念互不相讓，雙方的爭論也逐漸從文鬥改為了武鬥，彼時世間百姓常能遙望到諸仙比鬥引起的眾多異象，凡夫俗子以此為見識相互吹噓交談，漸漸流傳開來，為有心人引用，漸成神話故事流傳於世。
話回正文，玄元兩道的爭鬥日益激烈，有時甚至是彼此之間生死相鬥，如此下去死傷在所難免，正所謂誰人能沒有妻女家人，誰人能沒有幾個誌同道合的朋友，更不用其背後的修仙門派，如此下去、矛盾可謂是越積越深，終至不可調和。終於有一天，玄、元兩道雙方比鬥，一著不慎，玄門煉氣士死於元門之手，雙方大打出手，最終結果是動靜越來越大，諸修仙門派盡皆參與了進去，後來隨著凡間一些影藏的煉氣士也紛紛進場，一場爭鬥從仙門最終波及到了凡間，仙人們彼此爭鬥，諸國之間更是流血不止，整個山海界開始動蕩，這場鬥爭的波及範圍原來越大，雙方打得興起，靈山大川紛紛倒塌，大地開始寸寸崩裂，海水倒灌大陸，凡人百姓死傷無數，幾乎快到了亡族滅種的地步。直到此時，雙方才幡然悔悟，紛紛停手，雖然停止了大規模的爭鬥，但玄元雙方理念之爭鬥已到不可調和的地步，至此玄元兩道分家，玄門改為仙玄之道，元門則改為魔元之道，分別傳道於世。
然而，又過不久，仙魔兩道漸漸發現世間靈氣開始變得渾濁，不再似上古時候那般天地清明，原本雙方都以為是對方下的手腳，差點又引發一場爭鬥。一番調查下來，卻是發現原來雙方在爭鬥過程中竟然錯手打壞了地根，天地之間，自有其規律，以往靈氣由地根出而後又歸於大地，循環往複，一刻也不停息，現如今，地根崩裂，靈氣即使仍能在天地間循環，卻也隻是少量了，不能如往日那般強盛了。直到此時，他們才明白自己失去了什麼，紛紛想辦法補救，一番手段下來，卻是毫無希望。
他們明白隨著天地靈氣的日益減少，世間煉氣士的修煉之途也即將截止，眾人上升的路途也將到此為止。眼看長生大道即將就此斷絕，一仙門前輩突然發現地根雖然被毀，無法修複合並，但是這些崩裂的地根分支卻是在經過悉心培養之後仍能返還靈氣，其量雖不如往日那般洶湧，其質卻仍舊和舊時相差不多，這一發現讓眾仙心中希望之光重燃，一番商討之後，九大門派共分地根，各自選擇立派根基之地，重疏地根，再立門庭。同時由於天地之間靈氣的減少，而地根被九大派分別掌握，以及因為沒有地根的洗練靈氣，世間的渾濁靈氣之於煉氣士而言不啻於慢性毒藥，隱藏於凡人間的散修不得不投靠於各門各派，世間煉氣士卻是越來越少，除非必要，煉氣士不再於人世間行走。而對於煉氣士來說，除了靈氣是必需品之外，其餘諸多靈藥對於他們來說，同樣是不可去少的，特別是有些靈藥源自天生，無法移植，更無法培養，而煉氣士們又不想而因此入世，於此就不得不借助於凡人之力，至此，各個門派開始於凡間培植其勢力，而凡間各個勢力憑借其背後的支持，逐漸形成九個較大的國家，割據山海，逐鹿天下。而我們的故事就從這裏開始……