1877年，被任命為柏林皇家醫學院的物理學教授。
《論醫學思想》。
《論德國大學中的學術自由》，柏林大學校長就職演講。
《論由於物質含量的不同而引起的電流：熱的機械理論的一些推論》，物理學年鑒。
1878年，《論知覺事實》，紀念柏林大學成立日的演講。
《電話和音質》，柏林科學院。
《論為了確定雙眼視覺看到的物體的距離，眼睛的收斂位置的含義》，柏林生理學學會。
意大利之行。
《弗蘭茲·博爾（Franz BoU）死後論文的前言注釋：關於光和顏色感覺的主題和假設》，雷蒙德檔案。
1879年，《電邊界層的研究》，物理學年鑒。
赫茲在亥姆霍茲物理研究所工作。
1880年，《論受極化的鉑金的運動電流》，物理學年鑒。
西班牙之行。
1881年，《論作用在磁化或電介質極化的物體的力》，柏林科學院。
《關於磁化或電介質媒介內部吸引作用理論的注釋》。
《一個電動力學平衡》，物理學年鑒。
英國之行。
《論法拉第電觀念的現代發展》，在倫敦化學學會上的演講。
《注釋：補充法拉第演講的觀察》。
《注釋：論光學現象的電動力學理論》。
巴黎之行，參加電學大會。
佛羅倫薩之行，在維也納看電學展覽。
《有關電學單位的巴黎大會的考慮》，柏林電技術學會演講。
《論水銀的電極化和近期由科尼希（Arthur Koenig）所做的與之相關的實驗》，柏林科學院。
1882年，《亥姆霍茲科學論文集》第一卷出版。
《論化學過程的熱力學》，柏林科學院。
1883年，《關於熱力學導言的注釋》。
《通過平衡方法測定磁力矩》，柏林科學院。
與赫茲通信。
羅馬之行，參加測地學的大會。
1884年，英國之行。
《關於單循環係統的靜力學的研究》，柏林科學院。
《關於單循環係統靜力學的定理的推廣》，柏林科學院。
《單循環係統的靜力學原理》，克雷爾雜誌。
《論最小作用量原理的物理意義》，克雷爾雜誌。
《論最小作用量原理發現的曆史》，柏林科學院。
1885年，《生理光學手冊》第二版（1885-1895）
《關於有威廉·湯姆孫先生的數學和物理學論文的報告》，自然雜誌。
1886年，海鐮疊大學建校500周年。
被授予格拉菲獎章。
《論雷雨和雲的形成》，柏林物理學會。
與赫茲通信。
1887年，帝國物理技術研究所的建立。
《流體內聚力證明的實驗》，柏林物理學會。
《約瑟夫·弗朗和費：誕辰一百周年上的演講》。
《關於水的電解的進一步研究》，柏林科學院。
《論用皮克托（Pictet）液體工作的製冰機》，柏林物理學會。
《對於化學過程的熱力學觀察》。
《數字和測量》。
帝國物理技術研究所所長：1888-1894
1888年，《論視網膜的固有光》，柏林物理學會。
與赫茲通信。
1889年，《紀念克勞修斯》，柏林物理學會。
唐德斯去世。
《論大氣的運動》，柏林科學院。
《論大氣的運動II》，柏林科學院和柏林物理學會。
亥姆霍茲的兒子羅伯特去世。
1890年，《波和風的能量》，柏林科學院。
《關於帝國物理技術研究所的工作》。
1891年，《關於學術研究的預備訓練的觀察》。
《費希納定律在顏色係統中運用的一次嚐試》，發表在感官心理學和生理學雜誌上。
《心理物理學定律運用到三色眼睛的色差的一次嚐試》，感官心理學和生理學雜誌。
《顏色係統中的最短的線》，柏林科學院。
70歲生日慶祝。
1892年，《一個自傳式概略》，在他70歲生日慶祝會上的演講。
《電動力學中的最小作用量原理》，柏林科學院。
《歌德關於未來科學思想的預言》，在魏瑪歌德學會上的演講。
獲得博士學位50周年。
與赫茲的通信。
沃納·馮·西門子去世。
《關於色散的電磁理論》，柏林科學院。
《對論文“關於色散的電磁理論”的補充和修正》，物理學年鑒。
1893年，《從麥克斯韋關於純以太運動的理論中得到的一些結論》，柏林科學院。
《注釋：如何想象在麥克斯韋電動力學理論中發生的以太的運動》。
芝加哥博覽會之行，歸途中發生不幸。
1894年，赫茲去世。
《對論文“電動力學中的最小作用量原理”的補充》，柏林科學院。
《注釋：關於一些未知電動力學力的完全性的進一步研究》。
《論我們感覺印象的正確解釋的來源》，感官心理學和生理學雜誌。
亥姆霍茲去世。
12月14日音樂學院的紀念會。
1899年，柏林大學亥姆霍茲塑像的揭幕儀式。
亥姆霍茲的第二任妻子去世。