幕府是前世島國一種權力曾一度淩駕於天皇之上的中央政府機構。
其最高權力者為征夷大將軍，亦稱幕府將軍。
幕府本指將領的軍帳，但在島國的特殊狀況下，演變成一種特有國情的政治體製。
而幕府作為軍方參政體係，特別適用於當前農之國的國情。
畢竟現在的國情便是以忍者首崎家一統國家。
各個家族正式成為忍者的族人，除非是那些因為年紀或者是身體原因已經修養忍者都要集中到幕府內。
由幕府進行統一管理。
還沒有成為忍者的族人，可以在四歲左右的適齡期送到幕府單獨蓋造的‘首崎之裏’，專門培訓忍者，教導他們學習忍術，幻術，體術，以及忍者知識的聚集之所，類似於學校的地方。
同時各個家族要將所有的忍術，幻術，體術卷軸上交到幕府當中，由幕府高層來篩選哪些忍術可以通過首崎之裏來教導給孩子們。
而各個家族的秘術，幕府是不會征收的，如果不是秘術的話，其它忍術想來也沒有私藏的必要，最起碼如果真的敢私藏可得考慮後果，而大量的忍術能夠公平的用來教導每一個族人，不是更好。
並且首崎剛佐還表示，他自己開發的一些五遁忍術也將用來教導首崎之裏的孩子們，當然秘術除外。
這也讓各位族長十分驚喜，畢竟自家少主開發的忍術，即便沒有展示過也素有威名。
同時所有的忍者要分成十個番隊，每一個番隊分別有一位隊長和副隊長。
並且隊長和隊副當中必須有一人得是首崎家族的族人，可以是隊長也可以是隊副，但決不允許兩個職位當中都是首崎一族的人，也不允許這當中沒有首崎一族的人。
同時幕府也會根據國情，對內承接一些民生治安方麵的任務給那些十個番隊中實力不足的忍者新人來執行。
培養他們的能力，挑選其中具備領隊能力的佼佼者。
對外的話，會承接一些其他國家參與戰爭方麵的任務，畢竟現在農之國的幕府統一了整個國家的忍者勢力。
如果其他國家要發動戰爭，或者是其他有困難的大任務，與其分別雇傭好幾個家族，還不如直接向幕府這邊花錢提交任務。
對外的話，戰爭，情報，刺殺，這一些酬金高昂的任務都是幕府成績的範圍。
同時任務也會因為難度，而分為S、A、B、C、D！五個等級。
十個番隊的忍者到了五十五歲的年齡可以選擇返回家族族地修養，每月領取固定修養金。
除非幕府有特殊任務需要這些老人出麵執行，要不然也不會插手他們各自的生活。
但如果實在閑不住的話，也可以繼續為幕府出力，不過就得選擇幕後，可以擔任忍者的培訓導師等職業。
隨後剛佐又詳細介紹了幕府製度下各個忍者家族將會被重新分化族地和領土。
以忍者家族的規模來進行精準評斷，管理地區的忍者家族可以享受一定比例的稅收。
與大名府征收的稅收成1:1的比例，這些錢能夠彌補過去忍者家族的酬金。