季源溥惱羞成怒，他嚴厲問毛澤民：“你們為什麼要來新疆？”
毛澤民不屑一顧，冷笑道：“你不應該問我，而是應該問問盛督辦，是他請我們來的。沒有他的盛情相邀，我們怎會來新疆？”
“胡攪蠻纏！你們來新疆明明是來謀反！”
“我們為什麼要謀反？我們所做之事，盛督辦最清楚！”
此時，陳潭秋高呼起來：“我們來新疆的目的是抗日，難道抗日也有錯嗎？委員長不是動員全國人民抗日嗎？”
季源溥無話可說，氣急敗壞，黔驢技窮，隻能對毛澤民、陳潭秋施以重刑。特務們將兩人押至大牢，先是鞭刑，而後是壓竹杠、坐老虎凳……經過一係列的酷刑，毛澤民、陳潭秋等人不勝暴打，昏厥過去。
然而，季源溥卻不肯罷休，命令特務們繼續拷打毛澤民等人，對毛澤民、陳潭秋等人施以坐飛機、打手掌、掛炸彈等種種慘無人道的刑罰。
在經曆了幾天幾夜的毒打後，毛澤民等人依然咬緊牙關，不屈如初。
4月24日，季源溥又來到審訊室，再一次審訊奄奄一息的毛澤民：“你們在新疆到底有沒有組織？”
“這裏沒有組織，隻有六大政策！”毛澤民說。
“什麼六大政策？”
“這個你要問盛世才，政策是他製定的，我隻是執行政策！”
季源溥繼續問：“那麼‘阿山事件’是不是受到第三國際的指示？”
毛澤民回答：“第三國際沒有指示，我們認為阿山案子很離奇，口供不符實。”
季源溥又惡狠狠地問毛澤民：“如果你們的組織在新疆搞陰謀暴動怎麼辦？”
“我們共產黨絕對不會做這種事！”
季源溥見毛澤民不招，再次命令打手對奄奄一息的毛澤民施刑。
5月5、6日，季源溥再次對毛澤民進行了第五次、第六次審訊。這一次審訊，季源溥吩咐打手繼續對毛澤民施刑逼供，並采取“車輪”方式，輪流對毛澤民進行“坐飛機”、“壓竹杠”、“掛炸彈”，打昏之後，再用阿姆尼亞藥品刺激毛澤民醒來……這一次非人性的折磨是漫長的，前後曆經七天七夜……與此同時，陳潭秋也被打成了一個血人。
季源溥最終終於明白了，想要從毛澤民、陳潭秋嘴裏得到點什麼，根本是徒勞的！所以他決定偽造“證據”，直接定罪。
5月底，季源溥偽造了一份“四一二陰謀暴動案”的判決書，與此同時，王德溥、朱樹聲也在炮製“杜重遠案”和“阿山案”的判決書。他們琢磨了半天，最終引用《刑法》中的有關條文，寫下了如下判罰：
在徐傑（陳潭秋）、周彬（毛澤民）的指揮下，李一歐召集和主持秘密會議數次，決議於民國三十二年四月十二日在廣場召開群眾大會時，實行武裝暴動。
首先由自衛隊上台將盛世才衛隊繳下槍支。
推定李一歐刺殺督辦盛世才，孟一鳴刺殺參謀長汪鴻藻，潘柏南刺殺民政廳廳長李溥霖，劉西屏刺殺財政廳廳長彭吉元，李嘯平刺殺教育廳廳長程東白。
同時航空隊派飛機在大會上空示威，散發傳單。
另派人率領武裝分別占領督辦公署、省政府及郵電、銀行、倉庫等各機關。暴動成功，即組織新疆新政府，推徐傑、周彬為負責人。
核其所為，被告徐傑、周彬等20餘人，觸犯《刑法》第二章“內亂罪”，應依法判決。
判處徐傑、周彬、林基路死刑，李一歐、孟一鳴、潘柏南、劉西屏、李嘯平無期徒刑，其餘被告3年以上15年以下徒刑。
宣判結束後，毛澤民、陳潭秋、林基路等人被關押到新疆第四監獄。
季源溥帶著判決書高高興興地回了重慶。
季源溥一回到重慶，就來到陳立夫的辦公室，向陳立夫彙報：
“案子審判時有些曲折，但他們‘預謀叛變’一事卻是鐵板釘釘，所以以《刑法》第二章‘內亂罪，判他們死刑！”
“共黨方麵有什麼反應沒有？”陳立夫問。
“這個案子沒有公開審判，共黨方麵還不知道此事！”
陳立夫迅疾提醒季源溥，“一定要保守秘密，千萬不要聲張！你馬上致電盛世才，讓他做好保密工作！”
季源溥離開陳立夫辦公室後，又向徐恩曾彙報了工作。
毛澤民、陳潭秋等人在監獄裏，並沒有坐以待斃，而是展開了生命中最後的一場鬥爭。
青年共產黨人、曾時任庫車縣、烏什縣縣長的林基路在得知自己被判死刑後，在第四監獄的五號牢房裏，對同住一個牢房的共產黨員高登榜、陳穀音、曹建培等說：“我們不能坐以待斃，要想辦法組織起來，反抗到底！”
“對啊，難道抗日還有錯嗎？憑什麼判我們有罪？”
“就是！”
大家紛紛痛斥國民黨當局的無恥行為，林基路號召大家繼續抗爭，不能這樣輕而易舉地將生命交付出去！林基路還自編了《囚徒歌》，由同一個牢房的共產黨員、畢業於上海音樂學院的陳穀音配曲，大家一起在監獄裏高唱《囚徒歌》！
囚徒，新的囚徒，堅定信念，貞守立場；
砍頭槍斃，告老還鄉，嚴刑拷打，便飯家常。
擲我們的頭顱，奠築自由的金字塔；
灑我們的鮮血，染成紅旗，萬載飄揚！
1943年9月，盛世才接到重慶密電，命其槍斃毛澤民、陳潭秋等人。盛世才看到電報，內心五味雜陳，畢竟毛澤民、陳潭秋都是他請來的，重慶要他殺掉這些共產黨人，他也有些難以下手。而遠在重慶的陳立夫，也深知盛世才優柔寡斷，唯恐他不肯執行命令，所以派了季源溥等特務到新疆來協助盛世才執行總裁的命令。
1943年9月27日，幾個打手把毛澤民從牢房裏拉出去，毛澤民跟著打手們往前走，走著走著，一根棍子猛擊在他的頭頂……毛澤民就這樣死在了特務們的手裏，時年47歲。