但是在徐恩曾的眼裏，顧順章隻可利用，不可信任！顧順章是一個順風倒的人，哪裏有所顧忌就倒向哪裏。到了後期，顧順章在共產黨的施壓下，竟然又與共產黨聯絡到了一起。徐恩曾說：“此人已經沒有利用價值！必須要及時鏟除掉！”不過在顧順章叛變革命的這段時間裏，徐恩曾竭盡全力安排這個人給中統小特務們上課，手把手地傳授特務技能！徐恩曾雖然是特務頭頭，但是對顧順章的本領還是瞠目結舌、十分欣賞！
那段時間，顧順章也是傾囊而出，盡可能地把自己的本事傳授給中統特務。其中顧順章把他從蘇聯“克格勃”學來的本事變成教材，這些教材有《組織工作》、《訓練工作》、《情報工作》、《偵察工作》、《行動工作》和《審查工作》，後來這六本書彙編整理成《特工工作的理論與實際》。後來顧順章寫書成癮，與王一心合作了一本《中國共產黨的特務工作》以及臨死前還打算出的一本《“人”的研究》（最後不了了之），這些書不但成為國民黨特務的教科書，而且還得到了徐恩曾的極高讚譽。
曾經接受過顧順章訓練的特務回憶道：“此人簡直是一人間奇貨，天生為特務而生的！他懂得易容術，易容之後，難辨其人麵目。此人還有一套培養特務的體係，且體係非常科學，行之有效。此人的攻心術也了得，而且還懂得槍法、格鬥、擒拿等。”
顧順章剛剛加入國民黨陣營就迅速適應了新身份。後來他還偷偷摸摸與戴笠勾結，幫軍統訓練特務，並且挑撥中統和軍統之間的關係，弄得徐恩曾跟戴笠老死不相往來。而他手中的特權也越來越多，私心逐漸膨脹！於是就有了以後他竟然還企圖成立新共產黨與共產黨、國民黨分庭抗爭的舉動！但是顧順章的預謀還是被老奸巨猾的徐恩曾識破，最後將他除掉。
徐恩曾回憶：“我所引以為憾的這位在初期反共戰鬥中具有特殊貢獻的朋友，不曾和我合作到底。在民國二十四年的春天，因和敵人重新勾結而被處刑。由於他的不安分的本性，我雖盡量優容他、款待他，使他的生活方麵不感到欠缺，不料日子一久，他對這樣的生活仍感到不耐，他的個性需要有刺激，他要找政治上的出路，他不願像我們這樣做不求人知的工作。最初，他在我們這邊找出路，找不到，於是又偷偷摸摸去和共產黨勾結。事發的前幾個月，我們在上海破獲了中共的地下總部，搜獲一部分文件，其中有關於我的內部人事和業務情況的調查報告，這些材料無疑是從我的內部工作人員中透露出去的，有人曾懷疑到他，但是沒有其他佐證，故未采取任何行動。不久，經過一個新近被捕轉變的共產黨分子的證實，上述材料確是他報告的。我才開始對他注意，但隻是警戒而已！又過了不久，我派在他手下做事的工作人員向我報告，他有實施暗殺計劃後，逃亡江西赤區的準備，於是我們對他的最後一點希望也隻好放棄了，我前後經辦和他同等重要地位的共產黨分子的自新轉變案件，不下五六十起，顧順章是唯一的轉變後又想回到敵人懷抱的一個，我愛惜他的才具，至今仍以不能挽救他而感到惋惜！”（選自《徐恩曾回憶錄》）
可見徐恩曾對顧順章是又愛又恨！愛他的才能，卻恨他的“不安分”！而顧順章也正因為自己的不安分而引來殺身之禍。