張楓從小就喜歡神奇寶貝，各個版本都爆機了，漫畫看了幾十遍，經常幻想自己能到神奇寶貝世界。他還不知道，災難即將來臨！
一天晚上他正在聚精會神的玩著遊戲機。這時，門忽然北砸開，張楓從房間的門縫裏看到幾個蒙麵人闖了進來，先殺了他的幾個親人，然後慢步向他的房間走來。張楓大驚，正在不知所錯的時候，遊戲機裏一股不知名的力量將他吸了進來。之後，眼前便是一片黑暗。這時，一個聲音對他說：歡迎來到神奇寶貝世界，你將為一名訓練師。張楓又驚又喜，便說：有人陪我嗎？那個聲音回答：當然有，放心去吧！現在將要把你送達神奇寶貝世界。張楓便感覺滲透正在下沉，下麵有光，並且越來越大。當他在此回複知覺之後，發現自己正躺在床上，四擺設好像在那見過。他下床，出了房間，一個三十歲左右的女子出現在她麵前，並對他說：兒子，今天第一次去，給博士一個好印象！張楓一聽便知道，這是他這個世界的母親。張楓答道：知道了，媽媽。媽媽說：小岩真乖。哦！原來在這個世界，我叫小岩。也好，這名字還不錯。張楓想。
於是，小岩離開家，徑直走向大木博士的研究所！進去之後，小岩看到一個無比可愛的女孩和一個英俊的男孩，他知道，這個女孩叫小瓊，男孩叫小茂，都是主角。而且應該有四個人，沒來的是小智，睡過頭了。博士說：你們三個一人選一個做自己的寵物。說完拿出了三個精靈球。小茂想都沒想便拿了妙蛙種子。小瓊則那了傑尼龜。而小岩隻能要小火龍。小岩一見小瓊，就想和她表白。但又不好意思說。其實小岩不知道，小瓊從小就喜歡他。這時，大木博士說：你們三個一起旅行，相互幫助，去讓自己成長。小茂卻說：我隻想自己一個人，不想有伴。小瓊說：小岩哥，咱倆一起旅行吧！小岩簡直不敢相信自己的耳朵，求之不得的事發生了就要珍惜。趕緊說：好的，小瓊。博士說：你們三個去旅行吧！三人剛出研究所，就迎麵遇上了穿著一身睡衣的小智。小茂輕蔑的說：懶蟲，已經沒精靈了！小智大怒說：我不信。說完氣衝衝的進了研究所。小瓊無奈的笑了笑。小岩便已經看呆了。小茂說：等他出來，我要好好問一下他，沒精靈咋樣。小瓊點了點頭。幾分鍾後，研究所裏傳來了慘叫和電流聲。
三人趕忙進去。看到小智抱著皮卡丘，渾身都是黑色，一旁的大木博士和小智一樣，渾身都黑了，僵僵的站在旁邊。要是大木博士沒在旁邊，三人一定會大笑一場。小瓊說：博士，小智，你們倆沒事吧？倆人趕忙擦去身上的黑灰。小智說：我，我，我，我沒事。小茂邊笑邊說：沒事說話還結疤！大木博士終於忍不住了，說：你們三個怎麼還沒走？三天之後務必到達常磐市。三人隻好無趣的走開了。小智和皮卡丘在博士囑托之後，也踏上了旅途。